MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	CAC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_018666	TTC	2	6	106	111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018666	GCT	2	6	121	126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018666	TCA	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018666	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018666	GCT	2	6	271	276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018666	TTG	2	6	469	474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018666	TTC	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018666	TTC	2	6	635	640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018666	TTC	2	6	725	730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018666	TAT	2	6	1879	1884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018666	ATA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018666	TAT	2	6	1974	1979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018666	CCT	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018666	AGG	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018666	GGC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018666	ATT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018666	GGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018666	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018666	CAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018666	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018666	ATA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018666	ACC	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018666	ATC	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018666	ATA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018666	GGA	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018666	TCG	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018666	ATG	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018666	CTC	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018666	ACT	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018666	GAG	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018666	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018666	TCC	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018666	GTG	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018666	TTC	2	6	5151	5156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018666	ATC	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018666	TTG	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018666	AAC	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018666	TGC	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018666	GAT	2	6	5697	5702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018666	CAG	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018666	ATT	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018666	TTC	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018666	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018666	GCC	2	6	6359	6364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018666	GGC	2	6	6394	6399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018666	TGT	3	9	6469	6477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018666	CAG	2	6	6498	6503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018666	GAT	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018666	TAA	2	6	6757	6762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018666	ATT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018666	TGA	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018666	TCA	2	6	8303	8308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018666	TCA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018666	ACT	2	6	8364	8369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018666	GCA	2	6	9326	9331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018666	ATG	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018666	TCT	2	6	9419	9424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018666	CTA	2	6	9443	9448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018666	TTC	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018666	TTC	2	6	9564	9569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018666	TTA	2	6	10929	10934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018666	ATA	2	6	10958	10963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018666	ATA	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018666	ATG	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018666	CAA	2	6	11350	11355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018666	CAT	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018666	TCC	2	6	11680	11685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018666	TTA	2	6	12963	12968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018666	ATT	2	6	13065	13070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018666	CTG	2	6	13146	13151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018666	GTG	2	6	13166	13171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018666	TGC	2	6	13239	13244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018666	CCG	2	6	13294	13299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_018666	GAG	2	6	13389	13394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018666	ATT	2	6	13901	13906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018666	GTA	2	6	13965	13970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018666	GCA	2	6	14885	14890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018666	CAG	2	6	15055	15060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018666	CTC	2	6	15072	15077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018666	ATC	2	6	15172	15177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018666	CAG	2	6	15293	15298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018666	CCG	2	6	15337	15342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018666	TCC	2	6	15399	15404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018666	CGG	2	6	15447	15452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018666	GGC	2	6	15467	15472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018666	CCG	2	6	15604	15609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018666	GTC	2	6	15635	15640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018666	TCA	2	6	15711	15716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018666	CAG	2	6	15773	15778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018666	GCA	2	6	15782	15787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018666	CAG	2	6	15806	15811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018666	CAG	2	6	15905	15910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018666	CGG	2	6	16048	16053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018666	CCG	2	6	16080	16085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018666	GCA	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018666	CGG	2	6	16269	16274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018666	CGG	2	6	16308	16313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018666	CAG	2	6	16418	16423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018666	GTC	2	6	16430	16435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018666	AGA	2	6	16436	16441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018666	TGG	2	6	17257	17262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018666	CAG	2	6	17405	17410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018666	GGC	2	6	17424	17429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018666	ATT	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018666	TAT	2	6	18585	18590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018666	CCT	2	6	21466	21471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018666	TAA	2	6	21513	21518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018666	TAT	2	6	21582	21587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018666	GAT	2	6	21592	21597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018666	TTG	2	6	22350	22355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018666	TTC	2	6	22362	22367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018666	AAT	2	6	22861	22866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018666	CCT	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018666	CGT	2	6	22996	23001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018666	GTG	3	9	23050	23058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018666	AGA	2	6	23162	23167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018666	GCG	2	6	23843	23848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018666	ACC	2	6	23894	23899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018666	GAA	2	6	27319	27324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018666	ATA	2	6	28551	28556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018666	ATC	2	6	30183	30188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018666	ACA	2	6	30240	30245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018666	TCA	2	6	30253	30258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018666	CAC	2	6	30273	30278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018666	TGT	2	6	30280	30285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018666	GCA	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018666	TCA	2	6	31515	31520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018666	TCC	2	6	31610	31615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018666	CAA	2	6	31618	31623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018666	CGC	2	6	32000	32005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018666	CAA	2	6	32177	32182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018666	TGT	2	6	32361	32366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018666	TAT	2	6	33530	33535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018666	TGC	2	6	33587	33592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018666	CTG	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018666	GCA	2	6	34659	34664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018666	GTG	2	6	34687	34692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018666	GAT	2	6	34748	34753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018666	TGG	2	6	34853	34858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018666	TGG	2	6	35089	35094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018666	TCC	2	6	35113	35118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_018666	ATA	2	6	73360	73365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018666	TGC	2	6	73400	73405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_018666	CTT	2	6	73526	73531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_018666	GCA	2	6	73585	73590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_018666	GCA	2	6	73724	73729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_018666	CAG	2	6	73845	73850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_018666	CAC	2	6	73879	73884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_018666	GCA	2	6	73888	73893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_018666	GCC	2	6	73909	73914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_018666	CTA	2	6	74078	74083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_018666	ACT	2	6	74177	74182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.