MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	TC	3	6	399	404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018666	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018666	AT	3	6	571	576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018666	TC	3	6	766	771	0 %	50 %	0 %	50 %	407484806
5	NC_018666	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018666	TA	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018666	AG	3	6	2081	2086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018666	TG	3	6	2919	2924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018666	GC	3	6	6330	6335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018666	TA	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
11	NC_018666	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
12	NC_018666	AT	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
13	NC_018666	TA	3	6	7327	7332	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
14	NC_018666	GT	3	6	7869	7874	0 %	50 %	50 %	0 %	407484811
15	NC_018666	TC	3	6	9605	9610	0 %	50 %	0 %	50 %	407484813
16	NC_018666	GA	3	6	10833	10838	50 %	0 %	50 %	0 %	407484815
17	NC_018666	AT	3	6	11440	11445	50 %	50 %	0 %	0 %	407484816
18	NC_018666	AT	3	6	11822	11827	50 %	50 %	0 %	0 %	407484817
19	NC_018666	TA	3	6	11867	11872	50 %	50 %	0 %	0 %	407484817
20	NC_018666	TA	3	6	12982	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018666	CT	3	6	16224	16229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018666	CT	3	6	17025	17030	0 %	50 %	0 %	50 %	407484824
23	NC_018666	AT	3	6	17728	17733	50 %	50 %	0 %	0 %	407484826
24	NC_018666	AT	4	8	18664	18671	50 %	50 %	0 %	0 %	407484828
25	NC_018666	TC	3	6	18762	18767	0 %	50 %	0 %	50 %	407484828
26	NC_018666	AT	3	6	18880	18885	50 %	50 %	0 %	0 %	407484828
27	NC_018666	CT	3	6	18954	18959	0 %	50 %	0 %	50 %	407484828
28	NC_018666	GT	3	6	19655	19660	0 %	50 %	50 %	0 %	407484829
29	NC_018666	TA	3	6	20037	20042	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
30	NC_018666	AT	3	6	20923	20928	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
31	NC_018666	AT	3	6	21398	21403	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
32	NC_018666	AT	3	6	21604	21609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018666	TA	3	6	21739	21744	50 %	50 %	0 %	0 %	407484830
34	NC_018666	CA	3	6	22805	22810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018666	GA	3	6	23294	23299	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
36	NC_018666	AG	4	8	23762	23769	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
37	NC_018666	AG	3	6	23814	23819	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
38	NC_018666	GC	3	6	24037	24042	0 %	0 %	50 %	50 %	407484833
39	NC_018666	TG	3	6	24406	24411	0 %	50 %	50 %	0 %	407484834
40	NC_018666	CG	3	6	24414	24419	0 %	0 %	50 %	50 %	407484834
41	NC_018666	TC	3	6	24641	24646	0 %	50 %	0 %	50 %	407484834
42	NC_018666	CA	3	6	25248	25253	50 %	0 %	0 %	50 %	407484834
43	NC_018666	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	407484835
44	NC_018666	AC	3	6	26128	26133	50 %	0 %	0 %	50 %	407484836
45	NC_018666	AC	3	6	27006	27011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018666	AC	3	6	27346	27351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018666	TC	3	6	27412	27417	0 %	50 %	0 %	50 %	407484837
48	NC_018666	AT	3	6	27432	27437	50 %	50 %	0 %	0 %	407484837
49	NC_018666	GC	3	6	29159	29164	0 %	0 %	50 %	50 %	407484839
50	NC_018666	CT	4	8	29676	29683	0 %	50 %	0 %	50 %	407484840
51	NC_018666	TA	3	6	29971	29976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018666	TG	3	6	30304	30309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018666	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018666	AG	3	6	31130	31135	50 %	0 %	50 %	0 %	407484843
55	NC_018666	CA	3	6	31412	31417	50 %	0 %	0 %	50 %	407484844
56	NC_018666	TG	3	6	32835	32840	0 %	50 %	50 %	0 %	407484845
57	NC_018666	AT	3	6	32956	32961	50 %	50 %	0 %	0 %	407484845
58	NC_018666	AG	3	6	33133	33138	50 %	0 %	50 %	0 %	407484845
59	NC_018666	TA	3	6	33743	33748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018666	GT	3	6	33968	33973	0 %	50 %	50 %	0 %	407484846
61	NC_018666	GC	3	6	34589	34594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018666	AG	3	6	34777	34782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018666	AT	3	6	35059	35064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018666	TC	3	6	35288	35293	0 %	50 %	0 %	50 %	407484848
65	NC_018666	GA	3	6	35355	35360	50 %	0 %	50 %	0 %	407484848
66	NC_018666	CA	4	8	35473	35480	50 %	0 %	0 %	50 %	407484848
67	NC_018666	GT	3	6	35497	35502	0 %	50 %	50 %	0 %	407484849
68	NC_018666	GA	3	6	36253	36258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018666	GA	3	6	39584	39589	50 %	0 %	50 %	0 %	407484855
70	NC_018666	AT	3	6	39791	39796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018666	CA	3	6	39862	39867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018666	TG	3	6	40695	40700	0 %	50 %	50 %	0 %	407484857
73	NC_018666	TC	3	6	41009	41014	0 %	50 %	0 %	50 %	407484858
74	NC_018666	AT	3	6	43290	43295	50 %	50 %	0 %	0 %	407484861
75	NC_018666	CT	3	6	44189	44194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018666	CA	3	6	44365	44370	50 %	0 %	0 %	50 %	407484863
77	NC_018666	GT	3	6	44494	44499	0 %	50 %	50 %	0 %	407484863
78	NC_018666	CT	3	6	46117	46122	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
79	NC_018666	GT	3	6	46862	46867	0 %	50 %	50 %	0 %	407484866
80	NC_018666	AC	3	6	46982	46987	50 %	0 %	0 %	50 %	407484866
81	NC_018666	GA	3	6	47029	47034	50 %	0 %	50 %	0 %	407484866
82	NC_018666	TG	3	6	47860	47865	0 %	50 %	50 %	0 %	407484866
83	NC_018666	CT	3	6	47981	47986	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
84	NC_018666	TG	3	6	48481	48486	0 %	50 %	50 %	0 %	407484866
85	NC_018666	CT	3	6	49072	49077	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
86	NC_018666	AT	3	6	51095	51100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018666	CA	3	6	51461	51466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018666	CA	4	8	53030	53037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018666	TA	4	8	53098	53105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018666	CA	3	6	53708	53713	50 %	0 %	0 %	50 %	407484871
91	NC_018666	AT	3	6	53956	53961	50 %	50 %	0 %	0 %	407484871
92	NC_018666	AT	3	6	54720	54725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018666	AT	3	6	55678	55683	50 %	50 %	0 %	0 %	407484873
94	NC_018666	GC	3	6	56363	56368	0 %	0 %	50 %	50 %	407484873
95	NC_018666	GA	3	6	57985	57990	50 %	0 %	50 %	0 %	407484873
96	NC_018666	GA	3	6	59597	59602	50 %	0 %	50 %	0 %	407484873
97	NC_018666	TA	3	6	60261	60266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018666	CT	3	6	61214	61219	0 %	50 %	0 %	50 %	407484877
99	NC_018666	AT	3	6	62023	62028	50 %	50 %	0 %	0 %	407484877
100	NC_018666	TA	3	6	62265	62270	50 %	50 %	0 %	0 %	407484877
101	NC_018666	AC	3	6	62437	62442	50 %	0 %	0 %	50 %	407484877
102	NC_018666	GA	3	6	62464	62469	50 %	0 %	50 %	0 %	407484877
103	NC_018666	AT	3	6	63049	63054	50 %	50 %	0 %	0 %	407484878
104	NC_018666	TA	3	6	64019	64024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018666	GA	4	8	64566	64573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018666	AT	3	6	64579	64584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018666	AG	3	6	64786	64791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018666	AT	3	6	65222	65227	50 %	50 %	0 %	0 %	407484879
109	NC_018666	TA	3	6	65514	65519	50 %	50 %	0 %	0 %	407484879
110	NC_018666	AT	3	6	65955	65960	50 %	50 %	0 %	0 %	407484879
111	NC_018666	GA	3	6	66404	66409	50 %	0 %	50 %	0 %	407484880
112	NC_018666	AT	3	6	66584	66589	50 %	50 %	0 %	0 %	407484880
113	NC_018666	TA	3	6	67046	67051	50 %	50 %	0 %	0 %	407484881
114	NC_018666	TA	3	6	67689	67694	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
115	NC_018666	TC	3	6	68152	68157	0 %	50 %	0 %	50 %	407484882
116	NC_018666	TA	3	6	68231	68236	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
117	NC_018666	TC	3	6	68319	68324	0 %	50 %	0 %	50 %	407484882
118	NC_018666	AT	3	6	68419	68424	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
119	NC_018666	TA	3	6	68550	68555	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
120	NC_018666	CT	3	6	69229	69234	0 %	50 %	0 %	50 %	407484883
121	NC_018666	TC	3	6	69249	69254	0 %	50 %	0 %	50 %	407484883
122	NC_018666	TA	3	6	69662	69667	50 %	50 %	0 %	0 %	407484883
123	NC_018666	TA	4	8	69955	69962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018666	AT	3	6	69990	69995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018666	TG	3	6	70026	70031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018666	AT	3	6	70048	70053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018666	GC	3	6	71956	71961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018666	AT	3	6	72645	72650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018666	TA	3	6	74211	74216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.