MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	TC	3	6	399	404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018666	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018666	AT	3	6	571	576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018666	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018666	TA	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018666	AG	3	6	2081	2086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018666	TG	3	6	2919	2924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018666	GC	3	6	6330	6335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018666	TA	3	6	12982	12987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018666	CT	3	6	16224	16229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018666	AT	3	6	21604	21609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018666	CA	3	6	22805	22810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018666	AC	3	6	27006	27011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018666	AC	3	6	27346	27351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018666	TA	3	6	29971	29976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018666	TG	3	6	30304	30309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018666	AT	3	6	30494	30499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018666	TA	3	6	33743	33748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018666	GC	3	6	34589	34594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018666	AG	3	6	34777	34782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018666	AT	3	6	35059	35064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018666	GA	3	6	36253	36258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018666	AT	3	6	39791	39796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018666	CA	3	6	39862	39867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018666	CT	3	6	44189	44194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018666	AT	3	6	51095	51100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018666	CA	3	6	51461	51466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018666	CA	4	8	53030	53037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018666	TA	4	8	53098	53105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018666	AT	3	6	54720	54725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018666	TA	3	6	60261	60266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018666	TA	3	6	64019	64024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018666	GA	4	8	64566	64573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018666	AT	3	6	64579	64584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018666	AG	3	6	64786	64791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018666	TA	4	8	69955	69962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018666	AT	3	6	69990	69995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018666	TG	3	6	70026	70031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018666	AT	3	6	70048	70053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018666	GC	3	6	71956	71961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018666	AT	3	6	72645	72650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018666	TA	3	6	74211	74216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.