MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	TC	3	6	766	771	0 %	50 %	0 %	50 %	407484806
2	NC_018666	TA	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
3	NC_018666	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	407484810
4	NC_018666	AT	3	6	7276	7281	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
5	NC_018666	TA	3	6	7327	7332	50 %	50 %	0 %	0 %	407484810
6	NC_018666	GT	3	6	7869	7874	0 %	50 %	50 %	0 %	407484811
7	NC_018666	TC	3	6	9605	9610	0 %	50 %	0 %	50 %	407484813
8	NC_018666	GA	3	6	10833	10838	50 %	0 %	50 %	0 %	407484815
9	NC_018666	AT	3	6	11440	11445	50 %	50 %	0 %	0 %	407484816
10	NC_018666	AT	3	6	11822	11827	50 %	50 %	0 %	0 %	407484817
11	NC_018666	TA	3	6	11867	11872	50 %	50 %	0 %	0 %	407484817
12	NC_018666	CT	3	6	17025	17030	0 %	50 %	0 %	50 %	407484824
13	NC_018666	AT	3	6	17728	17733	50 %	50 %	0 %	0 %	407484826
14	NC_018666	AT	4	8	18664	18671	50 %	50 %	0 %	0 %	407484828
15	NC_018666	TC	3	6	18762	18767	0 %	50 %	0 %	50 %	407484828
16	NC_018666	AT	3	6	18880	18885	50 %	50 %	0 %	0 %	407484828
17	NC_018666	CT	3	6	18954	18959	0 %	50 %	0 %	50 %	407484828
18	NC_018666	GT	3	6	19655	19660	0 %	50 %	50 %	0 %	407484829
19	NC_018666	TA	3	6	20037	20042	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
20	NC_018666	AT	3	6	20923	20928	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
21	NC_018666	AT	3	6	21398	21403	50 %	50 %	0 %	0 %	407484829
22	NC_018666	TA	3	6	21739	21744	50 %	50 %	0 %	0 %	407484830
23	NC_018666	GA	3	6	23294	23299	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
24	NC_018666	AG	4	8	23762	23769	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
25	NC_018666	AG	3	6	23814	23819	50 %	0 %	50 %	0 %	407484832
26	NC_018666	GC	3	6	24037	24042	0 %	0 %	50 %	50 %	407484833
27	NC_018666	TG	3	6	24406	24411	0 %	50 %	50 %	0 %	407484834
28	NC_018666	CG	3	6	24414	24419	0 %	0 %	50 %	50 %	407484834
29	NC_018666	TC	3	6	24641	24646	0 %	50 %	0 %	50 %	407484834
30	NC_018666	CA	3	6	25248	25253	50 %	0 %	0 %	50 %	407484834
31	NC_018666	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	407484835
32	NC_018666	AC	3	6	26128	26133	50 %	0 %	0 %	50 %	407484836
33	NC_018666	TC	3	6	27412	27417	0 %	50 %	0 %	50 %	407484837
34	NC_018666	AT	3	6	27432	27437	50 %	50 %	0 %	0 %	407484837
35	NC_018666	GC	3	6	29159	29164	0 %	0 %	50 %	50 %	407484839
36	NC_018666	CT	4	8	29676	29683	0 %	50 %	0 %	50 %	407484840
37	NC_018666	AG	3	6	31130	31135	50 %	0 %	50 %	0 %	407484843
38	NC_018666	CA	3	6	31412	31417	50 %	0 %	0 %	50 %	407484844
39	NC_018666	TG	3	6	32835	32840	0 %	50 %	50 %	0 %	407484845
40	NC_018666	AT	3	6	32956	32961	50 %	50 %	0 %	0 %	407484845
41	NC_018666	AG	3	6	33133	33138	50 %	0 %	50 %	0 %	407484845
42	NC_018666	GT	3	6	33968	33973	0 %	50 %	50 %	0 %	407484846
43	NC_018666	TC	3	6	35288	35293	0 %	50 %	0 %	50 %	407484848
44	NC_018666	GA	3	6	35355	35360	50 %	0 %	50 %	0 %	407484848
45	NC_018666	CA	4	8	35473	35480	50 %	0 %	0 %	50 %	407484848
46	NC_018666	GT	3	6	35497	35502	0 %	50 %	50 %	0 %	407484849
47	NC_018666	GA	3	6	39584	39589	50 %	0 %	50 %	0 %	407484855
48	NC_018666	TG	3	6	40695	40700	0 %	50 %	50 %	0 %	407484857
49	NC_018666	TC	3	6	41009	41014	0 %	50 %	0 %	50 %	407484858
50	NC_018666	AT	3	6	43290	43295	50 %	50 %	0 %	0 %	407484861
51	NC_018666	CA	3	6	44365	44370	50 %	0 %	0 %	50 %	407484863
52	NC_018666	GT	3	6	44494	44499	0 %	50 %	50 %	0 %	407484863
53	NC_018666	CT	3	6	46117	46122	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
54	NC_018666	GT	3	6	46862	46867	0 %	50 %	50 %	0 %	407484866
55	NC_018666	AC	3	6	46982	46987	50 %	0 %	0 %	50 %	407484866
56	NC_018666	GA	3	6	47029	47034	50 %	0 %	50 %	0 %	407484866
57	NC_018666	TG	3	6	47860	47865	0 %	50 %	50 %	0 %	407484866
58	NC_018666	CT	3	6	47981	47986	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
59	NC_018666	TG	3	6	48481	48486	0 %	50 %	50 %	0 %	407484866
60	NC_018666	CT	3	6	49072	49077	0 %	50 %	0 %	50 %	407484866
61	NC_018666	CA	3	6	53708	53713	50 %	0 %	0 %	50 %	407484871
62	NC_018666	AT	3	6	53956	53961	50 %	50 %	0 %	0 %	407484871
63	NC_018666	AT	3	6	55678	55683	50 %	50 %	0 %	0 %	407484873
64	NC_018666	GC	3	6	56363	56368	0 %	0 %	50 %	50 %	407484873
65	NC_018666	GA	3	6	57985	57990	50 %	0 %	50 %	0 %	407484873
66	NC_018666	GA	3	6	59597	59602	50 %	0 %	50 %	0 %	407484873
67	NC_018666	CT	3	6	61214	61219	0 %	50 %	0 %	50 %	407484877
68	NC_018666	AT	3	6	62023	62028	50 %	50 %	0 %	0 %	407484877
69	NC_018666	TA	3	6	62265	62270	50 %	50 %	0 %	0 %	407484877
70	NC_018666	AC	3	6	62437	62442	50 %	0 %	0 %	50 %	407484877
71	NC_018666	GA	3	6	62464	62469	50 %	0 %	50 %	0 %	407484877
72	NC_018666	AT	3	6	63049	63054	50 %	50 %	0 %	0 %	407484878
73	NC_018666	AT	3	6	65222	65227	50 %	50 %	0 %	0 %	407484879
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78	NC_018666	TA	3	6	67046	67051	50 %	50 %	0 %	0 %	407484881
79	NC_018666	TA	3	6	67689	67694	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
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81	NC_018666	TA	3	6	68231	68236	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
82	NC_018666	TC	3	6	68319	68324	0 %	50 %	0 %	50 %	407484882
83	NC_018666	AT	3	6	68419	68424	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
84	NC_018666	TA	3	6	68550	68555	50 %	50 %	0 %	0 %	407484882
85	NC_018666	CT	3	6	69229	69234	0 %	50 %	0 %	50 %	407484883
86	NC_018666	TC	3	6	69249	69254	0 %	50 %	0 %	50 %	407484883
87	NC_018666	TA	3	6	69662	69667	50 %	50 %	0 %	0 %	407484883

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.