MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pAA-EA11

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018666	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018666	T	6	6	682	687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018666	T	6	6	1951	1956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018666	A	7	7	2097	2103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018666	G	6	6	2281	2286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018666	T	6	6	5808	5813	0 %	100 %	0 %	0 %	407484809
7	NC_018666	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018666	A	6	6	8258	8263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018666	A	6	6	8984	8989	100 %	0 %	0 %	0 %	407484812
10	NC_018666	T	6	6	9521	9526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018666	T	6	6	10682	10687	0 %	100 %	0 %	0 %	407484814
12	NC_018666	T	6	6	11856	11861	0 %	100 %	0 %	0 %	407484817
13	NC_018666	A	7	7	11952	11958	100 %	0 %	0 %	0 %	407484818
14	NC_018666	T	8	8	12059	12066	0 %	100 %	0 %	0 %	407484818
15	NC_018666	T	7	7	12330	12336	0 %	100 %	0 %	0 %	407484818
16	NC_018666	A	6	6	12848	12853	100 %	0 %	0 %	0 %	407484818
17	NC_018666	A	6	6	13007	13012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018666	A	8	8	13049	13056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018666	A	6	6	13561	13566	100 %	0 %	0 %	0 %	407484819
20	NC_018666	A	6	6	13689	13694	100 %	0 %	0 %	0 %	407484819
21	NC_018666	A	6	6	13841	13846	100 %	0 %	0 %	0 %	407484819
22	NC_018666	T	7	7	14349	14355	0 %	100 %	0 %	0 %	407484821
23	NC_018666	T	6	6	18132	18137	0 %	100 %	0 %	0 %	407484827
24	NC_018666	C	7	7	18449	18455	0 %	0 %	0 %	100 %	407484827
25	NC_018666	T	6	6	18508	18513	0 %	100 %	0 %	0 %	407484827
26	NC_018666	A	6	6	18559	18564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018666	C	12	12	18782	18793	0 %	0 %	0 %	100 %	407484828
28	NC_018666	T	6	6	19120	19125	0 %	100 %	0 %	0 %	407484829
29	NC_018666	C	8	8	19883	19890	0 %	0 %	0 %	100 %	407484829
30	NC_018666	C	6	6	21076	21081	0 %	0 %	0 %	100 %	407484829
31	NC_018666	T	7	7	21268	21274	0 %	100 %	0 %	0 %	407484829
32	NC_018666	T	9	9	21379	21387	0 %	100 %	0 %	0 %	407484829
33	NC_018666	C	6	6	21495	21500	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_018666	C	10	10	21690	21699	0 %	0 %	0 %	100 %	407484830
35	NC_018666	T	7	7	21958	21964	0 %	100 %	0 %	0 %	407484830
36	NC_018666	T	7	7	22145	22151	0 %	100 %	0 %	0 %	407484830
37	NC_018666	A	7	7	22498	22504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018666	T	6	6	23257	23262	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
39	NC_018666	T	6	6	23306	23311	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
40	NC_018666	T	6	6	23734	23739	0 %	100 %	0 %	0 %	407484832
41	NC_018666	T	6	6	24652	24657	0 %	100 %	0 %	0 %	407484834
42	NC_018666	T	8	8	26593	26600	0 %	100 %	0 %	0 %	407484836
43	NC_018666	A	6	6	26997	27002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018666	A	8	8	27044	27051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018666	T	6	6	28503	28508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018666	A	6	6	28584	28589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018666	C	6	6	29128	29133	0 %	0 %	0 %	100 %	407484839
48	NC_018666	G	6	6	30309	30314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018666	T	6	6	30336	30341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018666	A	6	6	30354	30359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018666	C	7	7	30459	30465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_018666	A	9	9	30515	30523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018666	A	6	6	31987	31992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018666	A	6	6	32486	32491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018666	A	8	8	32624	32631	100 %	0 %	0 %	0 %	407484845
56	NC_018666	T	6	6	35185	35190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018666	T	7	7	35201	35207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018666	T	6	6	36856	36861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018666	T	6	6	36876	36881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018666	T	6	6	38388	38393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018666	A	6	6	39668	39673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018666	A	6	6	39928	39933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018666	A	7	7	39981	39987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018666	T	6	6	40041	40046	0 %	100 %	0 %	0 %	407484856
65	NC_018666	A	7	7	40616	40622	100 %	0 %	0 %	0 %	407484857
66	NC_018666	A	6	6	40790	40795	100 %	0 %	0 %	0 %	407484857
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68	NC_018666	T	6	6	44414	44419	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
69	NC_018666	T	7	7	44600	44606	0 %	100 %	0 %	0 %	407484863
70	NC_018666	A	6	6	44877	44882	100 %	0 %	0 %	0 %	407484864
71	NC_018666	C	6	6	45983	45988	0 %	0 %	0 %	100 %	407484866
72	NC_018666	T	6	6	48038	48043	0 %	100 %	0 %	0 %	407484866
73	NC_018666	T	6	6	48734	48739	0 %	100 %	0 %	0 %	407484866
74	NC_018666	C	6	6	49174	49179	0 %	0 %	0 %	100 %	407484866
75	NC_018666	C	7	7	49540	49546	0 %	0 %	0 %	100 %	407484867
76	NC_018666	A	7	7	52092	52098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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78	NC_018666	A	6	6	52780	52785	100 %	0 %	0 %	0 %	407484870
79	NC_018666	T	6	6	54135	54140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018666	C	6	6	54154	54159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81	NC_018666	T	6	6	54279	54284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018666	T	6	6	54391	54396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_018666	A	7	7	55497	55503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_018666	A	6	6	55569	55574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_018666	A	6	6	56745	56750	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
91	NC_018666	G	6	6	56871	56876	0 %	0 %	100 %	0 %	407484873
92	NC_018666	A	6	6	57250	57255	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
93	NC_018666	G	6	6	57331	57336	0 %	0 %	100 %	0 %	407484873
94	NC_018666	A	6	6	57497	57502	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
95	NC_018666	A	6	6	58805	58810	100 %	0 %	0 %	0 %	407484873
96	NC_018666	A	7	7	59913	59919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_018666	T	6	6	65628	65633	0 %	100 %	0 %	0 %	407484879
109	NC_018666	A	6	6	65739	65744	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
110	NC_018666	A	6	6	66031	66036	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
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112	NC_018666	A	7	7	66132	66138	100 %	0 %	0 %	0 %	407484879
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115	NC_018666	T	6	6	66619	66624	0 %	100 %	0 %	0 %	407484880
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117	NC_018666	T	6	6	67328	67333	0 %	100 %	0 %	0 %	407484881
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120	NC_018666	T	6	6	68216	68221	0 %	100 %	0 %	0 %	407484882
121	NC_018666	T	7	7	68346	68352	0 %	100 %	0 %	0 %	407484882
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123	NC_018666	A	7	7	69801	69807	100 %	0 %	0 %	0 %	407484883
124	NC_018666	A	6	6	70197	70202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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126	NC_018666	T	6	6	71069	71074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_018666	T	6	6	71574	71579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018666	T	8	8	71816	71823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018666	G	6	6	71845	71850	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018666	C	9	9	72042	72050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_018666	T	6	6	72754	72759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018666	A	8	8	72805	72812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018666	T	7	7	72825	72831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018666	T	6	6	73520	73525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018666	T	6	6	74018	74023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.