MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Exiguobacterium antarcticum B7 chromosome

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018665	CATTT	2	10	200	209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018665	TCGTG	2	10	11816	11825	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018665	ATGGG	2	10	12594	12603	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018665	GCGCC	2	10	13616	13625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_018665	TGACA	2	10	15613	15622	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018665	CAGGT	2	10	26306	26315	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018665	TCGTG	2	10	30781	30790	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018665	ATGGG	2	10	31559	31568	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018665	GCGCG	2	10	32580	32589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_018665	ATTTT	2	10	34920	34929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018665	TCTAA	2	10	35197	35206	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018665	TCGTG	2	10	36703	36712	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018665	TTGTC	2	10	37430	37439	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018665	ATGGG	2	10	37685	37694	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018665	GCGCC	2	10	38707	38716	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_018665	AGGAT	2	10	40606	40615	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018665	TCTGT	2	10	71574	71583	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018665	ATGGA	2	10	74758	74767	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018665	TCGTG	2	10	83497	83506	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018665	TTTAT	2	10	84082	84091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018665	ATGGG	2	10	84274	84283	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018665	GCGCC	2	10	85296	85305	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_018665	TCGTG	2	10	89085	89094	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018665	ATGGG	2	10	89863	89872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018665	GCGCC	2	10	90885	90894	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_018665	GGAGA	2	10	102997	103006	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018665	ACTAA	2	10	120924	120933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018665	TATTT	2	10	124483	124492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018665	AAGGA	2	10	125671	125680	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018665	CTTTC	2	10	135300	135309	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018665	TTGAT	2	10	139621	139630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018665	CATTT	2	10	142893	142902	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018665	TCGTG	2	10	148240	148249	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018665	TTGTC	2	10	148967	148976	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018665	ATGGG	2	10	149222	149231	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018665	GCGCC	2	10	150244	150253	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_018665	AAGGG	2	10	161310	161319	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018665	AGGAG	2	10	168017	168026	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018665	TTGTT	2	10	170471	170480	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018665	ACCGG	2	10	172931	172940	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_018665	ATAAA	2	10	178373	178382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018665	TAAAA	2	10	178486	178495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018665	TGAAC	2	10	179453	179462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018665	AGGAT	2	10	184052	184061	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018665	ATAGT	2	10	195173	195182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018665	GTCGT	2	10	203455	203464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018665	TTGAA	2	10	228043	228052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018665	TTTCG	2	10	243622	243631	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018665	GTAAA	2	10	251041	251050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018665	TGAAA	2	10	253962	253971	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018665	CGGAT	2	10	257193	257202	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018665	ATGTA	2	10	262504	262513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018665	AAGAA	2	10	281754	281763	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018665	TCTGT	2	10	286518	286527	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018665	ACCAC	2	10	301835	301844	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_018665	GGATG	2	10	305136	305145	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018665	TTTGA	2	10	308153	308162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018665	AATTA	2	10	312938	312947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018665	TAATT	2	10	315832	315841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018665	TAAAA	2	10	331665	331674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018665	TCTTT	2	10	337571	337580	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018665	TCGAA	2	10	340616	340625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018665	ATAAG	2	10	351518	351527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018665	AATTT	2	10	352859	352868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018665	ACATC	2	10	365506	365515	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_018665	TCGCT	2	10	365651	365660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018665	GAACG	2	10	387765	387774	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018665	AATCA	2	10	388097	388106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018665	AATGA	2	10	391110	391119	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018665	GTTTT	2	10	392833	392842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018665	TTTGA	2	10	403516	403525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018665	TCAAA	2	10	403549	403558	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018665	TAGAA	2	10	415273	415282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018665	CGATA	2	10	423452	423461	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018665	AAAGG	2	10	424559	424568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018665	TCAAA	2	10	424877	424886	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018665	GAAGA	2	10	425209	425218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018665	GAAAG	2	10	427447	427456	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018665	TCGTG	2	10	429805	429814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018665	ATGGG	2	10	430583	430592	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018665	GCGCC	2	10	431605	431614	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_018665	AATCG	2	10	472004	472013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018665	ATGAA	2	10	487924	487933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018665	ATTAA	2	10	495727	495736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018665	CTTGT	2	10	500192	500201	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018665	GTCAT	2	10	501985	501994	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018665	ACCAC	2	10	506309	506318	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_018665	TCCTT	2	10	512357	512366	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018665	AACAA	2	10	512531	512540	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018665	TGGAT	2	10	512878	512887	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018665	AACAA	2	10	514091	514100	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018665	TTTAT	2	10	518807	518816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018665	AGTGG	2	10	528301	528310	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018665	AATTA	2	10	536634	536643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018665	TGAAA	2	10	544526	544535	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018665	AAAAT	2	10	548569	548578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018665	CGAAA	2	10	557229	557238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018665	ATCGG	2	10	564728	564737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018665	TGAAG	2	10	565957	565966	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018665	GAATT	2	10	566388	566397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018665	CGGAT	2	10	567654	567663	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018665	GTCAG	2	10	567793	567802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018665	TATGT	2	10	569279	569288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018665	TCAAT	2	10	575285	575294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018665	AGCTG	2	10	575506	575515	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018665	CTGTT	2	10	577612	577621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018665	GAAAG	2	10	589700	589709	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018665	ATGAA	2	10	599780	599789	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018665	AACTA	2	10	611194	611203	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_018665	AGTAT	2	10	611328	611337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018665	GAAAT	2	10	630204	630213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018665	AGGAA	2	10	630343	630352	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018665	CGTAT	2	10	634463	634472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018665	TTTTG	2	10	636223	636232	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018665	GATAA	2	10	640679	640688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018665	ACGAT	2	10	655155	655164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018665	GAAAA	2	10	657165	657174	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018665	ACGAC	2	10	657321	657330	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018665	TCGTG	2	10	658538	658547	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018665	ATGGG	2	10	659316	659325	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018665	GCGCC	2	10	660339	660348	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_018665	CCAGC	2	10	663201	663210	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_018665	GATCG	2	10	674851	674860	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018665	TATCA	2	10	689730	689739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018665	CTAAA	2	10	691582	691591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018665	TCAAA	2	10	691699	691708	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018665	ACAAG	2	10	691762	691771	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018665	CAATT	2	10	710141	710150	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018665	AGCAA	2	10	749263	749272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018665	TCCTT	2	10	749276	749285	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_018665	ATTTT	2	10	762761	762770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018665	AAAAC	2	10	781929	781938	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018665	TAAGG	2	10	781995	782004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018665	CACTA	2	10	787031	787040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_018665	ATGAA	2	10	788990	788999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018665	GTTTT	2	10	842200	842209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018665	GAACA	2	10	878745	878754	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018665	TTTTA	2	10	881288	881297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018665	AGTGA	2	10	905765	905774	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018665	GTGAT	2	10	935044	935053	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018665	GCTTT	2	10	940402	940411	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018665	TAAGT	2	10	941509	941518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018665	CAAAT	2	10	941675	941684	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018665	GGACG	2	10	943547	943556	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018665	TCCAT	2	10	948409	948418	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_018665	GTGAC	2	10	966568	966577	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018665	CCGGA	2	10	966636	966645	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_018665	CTTGG	2	10	968492	968501	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018665	CTTGG	2	10	969667	969676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018665	AAGGG	2	10	979225	979234	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018665	AGATT	2	10	1038606	1038615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018665	TGAAT	2	10	1044991	1045000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018665	AGCTG	2	10	1098881	1098890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_018665	TATAG	2	10	1103308	1103317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_018665	ATTCA	2	10	1162912	1162921	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_018665	ATTGA	2	10	1167299	1167308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018665	TTTCG	2	10	1167366	1167375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_018665	GTCGG	2	10	1277318	1277327	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_018665	AGGAC	2	10	1278139	1278148	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_018665	GTCAA	2	10	1288705	1288714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_018665	CGGAT	2	10	1289644	1289653	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_018665	ATGAG	2	10	1332373	1332382	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_018665	TTCGA	2	10	1992640	1992649	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_018665	TAAAA	2	10	1998394	1998403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018665	CATTT	2	10	1998603	1998612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_018665	GCCGT	2	10	2031706	2031715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
289	NC_018665	AAACG	2	10	2035362	2035371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_018665	ATTGT	2	10	2088036	2088045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.