MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 1910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	AGGTAA	2	12	2969	2980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472535
2	NC_018664	ATAGAG	2	12	3326	3337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472536
3	NC_018664	AGATAT	2	12	3598	3609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472536
4	NC_018664	GAAAAT	2	12	3811	3822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472536
5	NC_018664	GGTATA	2	12	4846	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472538
6	NC_018664	AAACTA	2	12	5624	5635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472538
7	NC_018664	TGATGG	2	12	6897	6908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407472539
8	NC_018664	AAAGAA	2	12	10876	10887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018664	ACATTT	2	12	16695	16706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407472543
10	NC_018664	ATTGGA	2	12	18904	18915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472545
11	NC_018664	TAGAAG	2	12	24661	24672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472550
12	NC_018664	CAAGAC	2	12	29605	29616	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407472556
13	NC_018664	GCTGTA	2	12	31036	31047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407472557
14	NC_018664	AAACTT	2	12	31863	31874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018664	TATTGA	2	12	32883	32894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472559
16	NC_018664	GTAGAA	2	12	33788	33799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472560
17	NC_018664	TTTAGG	2	12	35991	36002	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407472562
18	NC_018664	TTTTAT	2	12	36721	36732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018664	TTTTGC	2	12	40701	40712	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407472570
20	NC_018664	ATTTAT	2	12	41181	41192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018664	TCTTAA	2	12	41624	41635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018664	TTTTGC	2	12	42576	42587	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407472572
23	NC_018664	TTAAAA	2	12	42910	42921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472572
24	NC_018664	CCATAC	2	12	44165	44176	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407472573
25	NC_018664	TTTTGC	2	12	44812	44823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407472574
26	NC_018664	TTAAAA	2	12	45146	45157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472574
27	NC_018664	TAGTTT	2	12	46011	46022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407472575
28	NC_018664	CCTTCA	2	12	47119	47130	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407472575
29	NC_018664	ATCAGA	2	12	47879	47890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472576
30	NC_018664	ATTAAA	2	12	48828	48839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472577
31	NC_018664	TAAATT	2	12	50052	50063	50 %	50 %	0 %	0 %	407472577
32	NC_018664	GAAGTA	2	12	50296	50307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472577
33	NC_018664	AAAATA	2	12	50479	50490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018664	TAGATA	2	12	50614	50625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018664	AGCTAT	2	12	52206	52217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472580
36	NC_018664	AAGTGA	2	12	53922	53933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472581
37	NC_018664	GAAAAT	2	12	53971	53982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472581
38	NC_018664	ATAAGT	2	12	55309	55320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018664	TGTAGT	2	12	57110	57121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407472583
40	NC_018664	TATAAA	2	12	60502	60513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407472586
41	NC_018664	ATATTA	2	12	60539	60550	50 %	50 %	0 %	0 %	407472586
42	NC_018664	AATATA	2	12	61438	61449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018664	GGATAT	2	12	61961	61972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472587
44	NC_018664	AAAGTA	2	12	63126	63137	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018664	ACTTTA	2	12	64428	64439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407472589
46	NC_018664	TACAGT	2	12	64787	64798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472589
47	NC_018664	GAAAAA	2	12	64921	64932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472589
48	NC_018664	TATGCT	2	12	65324	65335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472589
49	NC_018664	GTATTT	2	12	69563	69574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407472593
50	NC_018664	AGGACT	2	12	78752	78763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407472602
51	NC_018664	GAAATC	2	12	78825	78836	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472602
52	NC_018664	CAAAAA	2	12	79488	79499	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407472602
53	NC_018664	ATAAGA	2	12	83666	83677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472606
54	NC_018664	AAGAAA	2	12	84308	84319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472607
55	NC_018664	TTTAGA	2	12	85108	85119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472608
56	NC_018664	ATTTAG	2	12	85155	85166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472608
57	NC_018664	AGATGG	2	12	85279	85290	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407472608
58	NC_018664	GGATAT	2	12	86933	86944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472609
59	NC_018664	TATATT	2	12	87485	87496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472610
60	NC_018664	ATATTT	2	12	89836	89847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472612
61	NC_018664	TGAAAA	2	12	92983	92994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472615
62	NC_018664	TTAAAG	2	12	94075	94086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472617
63	NC_018664	CCATAA	2	12	94657	94668	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407472618
64	NC_018664	TTAACT	2	12	94997	95008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018664	GGATTT	2	12	95830	95841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407472619
66	NC_018664	ATAACT	2	12	96285	96296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407472620
67	NC_018664	GGATAT	2	12	97188	97199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472620
68	NC_018664	ACAAGT	2	12	100180	100191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472624
69	NC_018664	AAAGAA	2	12	100250	100261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472624
70	NC_018664	TTTTTA	2	12	101615	101626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018664	AAGAAA	2	12	103053	103064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472626
72	NC_018664	ATTTGC	2	12	105080	105091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472630
73	NC_018664	ATATAA	2	12	105457	105468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018664	TTTTAA	2	12	106187	106198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018664	AGAAGT	2	12	107956	107967	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472634
76	NC_018664	AAAGTA	2	12	108150	108161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472635
77	NC_018664	AGAGAA	2	12	112191	112202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472639
78	NC_018664	AGGAAC	2	12	115284	115295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407472644
79	NC_018664	TCAAAA	2	12	120153	120164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472649
80	NC_018664	GAAGTA	2	12	122875	122886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472651
81	NC_018664	TAAAAG	2	12	123413	123424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472652
82	NC_018664	ACAGCA	2	12	123985	123996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407472652
83	NC_018664	TAAAGT	2	12	125627	125638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472654
84	NC_018664	AGATGA	2	12	126077	126088	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472655
85	NC_018664	TGAAGA	2	12	126725	126736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472655
86	NC_018664	AAAGTT	2	12	128740	128751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018664	AATTTA	2	12	131845	131856	50 %	50 %	0 %	0 %	407472663
88	NC_018664	TACAAA	2	12	132288	132299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018664	ATTTAA	2	12	133445	133456	50 %	50 %	0 %	0 %	407472664
90	NC_018664	ATATAG	2	12	134083	134094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472664
91	NC_018664	AGGCGA	2	12	135164	135175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407472666
92	NC_018664	TTTGAT	2	12	137676	137687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407472668
93	NC_018664	ATAGAG	2	12	143048	143059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472672
94	NC_018664	AGAACA	2	12	148515	148526	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407472677
95	NC_018664	ATAGAT	2	12	151549	151560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472680
96	NC_018664	CTATAG	2	12	153575	153586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472682
97	NC_018664	TTATAC	2	12	154920	154931	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018664	TATAGC	2	12	156389	156400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472684
99	NC_018664	TAAAGT	2	12	158352	158363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472685
100	NC_018664	TATTTA	2	12	158425	158436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018664	GTAGCA	2	12	158994	159005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407472686
102	NC_018664	TAGATG	2	12	162217	162228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472689
103	NC_018664	CTAGTA	2	12	163961	163972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472691
104	NC_018664	TCTGAC	2	12	164170	164181	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407472691
105	NC_018664	TTTTAA	2	12	165172	165183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407472692
106	NC_018664	AAAAAT	2	12	165268	165279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018664	ATAGCA	2	12	165492	165503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472693
108	NC_018664	AGAAGT	2	12	167033	167044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407472693
109	NC_018664	ATAGTA	2	12	167355	167366	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472693
110	NC_018664	ATAGAC	2	12	168810	168821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472693
111	NC_018664	TTATGA	2	12	170411	170422	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407472693
112	NC_018664	CAAATA	2	12	170935	170946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472693
113	NC_018664	AAGGAC	2	12	171424	171435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407472694
114	NC_018664	GAAAGA	2	12	171735	171746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472694
115	NC_018664	AGATGT	2	12	172358	172369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407472694
116	NC_018664	CAATAT	2	12	173551	173562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407472694
117	NC_018664	AGTGCA	2	12	176190	176201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407472696
118	NC_018664	ACTAGT	2	12	176828	176839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472697
119	NC_018664	TTTGCA	2	12	176868	176879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407472697
120	NC_018664	AGATAA	2	12	177521	177532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407472697
121	NC_018664	AACTTT	2	12	177609	177620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407472697
122	NC_018664	GAATTA	2	12	177849	177860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407472697
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125	NC_018664	AAAGAG	2	12	183866	183877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018664	AGAGAA	2	12	183922	183933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018664	AAAGGA	2	12	183934	183945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018664	AAAGAA	2	12	183986	183997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_018664	AAAGAA	2	12	184084	184095	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_018664	GAACTT	2	12	328382	328393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407472834
231	NC_018664	CAAATG	2	12	329598	329609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407472834
232	NC_018664	TTATTT	2	12	331518	331529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_018664	TAAATA	2	12	332624	332635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_018664	AAAAGA	2	12	333096	333107	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407472838
235	NC_018664	GAAAAG	2	12	334715	334726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407472838
236	NC_018664	ACTAAA	2	12	339112	339123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407472841
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