MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	TCGTG	2	10	12170	12179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018664	ACATA	2	10	13213	13222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018664	GGGAG	2	10	13437	13446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018664	AAGTG	2	10	13797	13806	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018664	AAGAT	2	10	15719	15728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018664	ATTAA	2	10	16051	16060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018664	TAAAA	2	10	20321	20330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018664	TTTTA	2	10	20346	20355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018664	TAATG	2	10	20401	20410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018664	TTAAT	2	10	20435	20444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018664	TATAA	2	10	27596	27605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018664	GTAAA	2	10	27700	27709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018664	TTATA	2	10	29882	29891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018664	TTATA	2	10	31962	31971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018664	ATATA	2	10	33364	33373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018664	AGTGA	2	10	34954	34963	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018664	GTTCA	2	10	36258	36267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018664	ATATA	2	10	39026	39035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018664	AAAAT	2	10	39152	39161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018664	TAGAA	2	10	39358	39367	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018664	TTGCT	2	10	41927	41936	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018664	TTTAA	2	10	44571	44580	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018664	TATAC	2	10	51657	51666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018664	AGGAG	2	10	52712	52721	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018664	CTAAA	2	10	53123	53132	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018664	AAAAT	2	10	53481	53490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018664	TGTTA	2	10	53491	53500	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018664	AATTA	2	10	67155	67164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018664	TTTTA	2	10	70093	70102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018664	GAGTA	2	10	76313	76322	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018664	CAAAC	2	10	79855	79864	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018664	AAAGG	2	10	84815	84824	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018664	TCTTT	2	10	84851	84860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018664	ATAAA	2	10	90814	90823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018664	ATAAA	2	10	96066	96075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018664	ATTTA	2	10	99309	99318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018664	ATATA	2	10	101678	101687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018664	ATATG	2	10	106520	106529	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018664	GAAAA	2	10	109342	109351	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018664	AATAA	2	10	109468	109477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018664	ATATA	2	10	124366	124375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018664	TTTAA	2	10	127904	127913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018664	AAAAT	2	10	128512	128521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018664	TAAAA	2	10	129364	129373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018664	AGGGG	2	10	132332	132341	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018664	ATATA	2	10	138294	138303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018664	AAATA	2	10	141777	141786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018664	ATAAA	2	10	141939	141948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018664	TTAAA	2	10	143098	143107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018664	AAAGA	2	10	148008	148017	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018664	GTATA	2	10	176608	176617	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018664	ATTTT	2	10	180003	180012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018664	AAAGA	2	10	184019	184028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018664	GTCCT	2	10	190870	190879	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_018664	AACTT	2	10	197935	197944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018664	ATTTT	2	10	227396	227405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018664	GAAAT	2	10	227428	227437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018664	GTTTA	2	10	230417	230426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018664	AATGA	2	10	230475	230484	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018664	TTTAA	2	10	231478	231487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018664	GTCTA	2	10	231918	231927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018664	AAAAT	2	10	232762	232771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018664	ACGTA	2	10	234037	234046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018664	AATTT	2	10	236967	236976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018664	GTTAT	2	10	238007	238016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018664	ATATA	2	10	240117	240126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018664	ATTAT	2	10	257526	257535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018664	ATATT	2	10	264322	264331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018664	ATATT	2	10	264381	264390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018664	AAAAT	2	10	270154	270163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018664	CAGGG	2	10	274433	274442	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018664	TATAT	2	10	274555	274564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018664	GATAT	2	10	278204	278213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018664	AGCAA	2	10	284679	284688	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018664	TTTCT	2	10	289912	289921	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018664	AAGGG	2	10	289974	289983	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018664	ATATA	2	10	294984	294993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018664	AAATA	2	10	294994	295003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018664	ATATA	2	10	296381	296390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018664	ATAAA	2	10	296943	296952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018664	TACTT	2	10	298777	298786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018664	TAAAT	2	10	313231	313240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018664	AGTAT	2	10	316921	316930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018664	TAAAA	2	10	318531	318540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018664	TTTTA	2	10	318565	318574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018664	CTTTA	2	10	325333	325342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018664	TATGA	2	10	341558	341567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018664	GAATT	2	10	355765	355774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018664	ATTAA	2	10	359426	359435	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018664	TTAAA	2	10	362792	362801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018664	AAAAG	2	10	370166	370175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018664	AATAT	2	10	370475	370484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018664	CAAAG	2	10	373882	373891	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018664	AAATG	2	10	374985	374994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018664	AAAGA	2	10	377674	377683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018664	ATGAA	2	10	378866	378875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018664	AGTAA	2	10	402518	402527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018664	CCTAT	2	10	402550	402559	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_018664	TTATC	2	10	402812	402821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018664	TATCT	2	10	402834	402843	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018664	AGATA	2	10	403246	403255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018664	TAAAT	2	10	411880	411889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018664	TATAA	2	10	412197	412206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018664	CAACA	2	10	420307	420316	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018664	TTAAA	2	10	422529	422538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018664	TAATA	2	10	423007	423016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018664	AAATT	2	10	423079	423088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018664	AATGA	2	10	423193	423202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018664	TATAT	2	10	427479	427488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018664	ATGTT	2	10	428918	428927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018664	TATAA	2	10	435065	435074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018664	ATATT	2	10	437780	437789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018664	TTTTA	2	10	440825	440834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018664	TTAAT	2	10	440887	440896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018664	AAAGT	2	10	454916	454925	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018664	TTTTA	2	10	456591	456600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018664	TTTAT	2	10	459252	459261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018664	TAAGT	2	10	466221	466230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018664	TGGAA	2	10	478738	478747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018664	ATATT	2	10	479145	479154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018664	TTTTC	2	10	479919	479928	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018664	ATTTT	2	10	482851	482860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018664	TAAAA	2	10	484598	484607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018664	TATAT	2	10	484641	484650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018664	TAAAA	2	10	487622	487631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018664	AAATC	2	10	492540	492549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018664	AGTGT	2	10	497175	497184	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018664	AATGC	2	10	497853	497862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018664	TTTTA	2	10	505660	505669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018664	TGACT	2	10	505701	505710	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_018664	AGAAA	2	10	515884	515893	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018664	ATTTG	2	10	515992	516001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018664	AAAGT	2	10	518891	518900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018664	ATTTT	2	10	525562	525571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018664	GGTAT	2	10	531923	531932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018664	AGGTC	2	10	531989	531998	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018664	TACAT	2	10	538091	538100	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_018664	TAAAT	2	10	542293	542302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018664	AAAAC	2	10	544252	544261	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_018664	ATTGG	2	10	551410	551419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018664	AGTTT	2	10	551424	551433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018664	TCTAT	2	10	552856	552865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018664	TAAGA	2	10	553249	553258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018664	ATTAA	2	10	560265	560274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018664	TAAAA	2	10	560925	560934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018664	TTTTA	2	10	560990	560999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018664	TTATT	2	10	561907	561916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018664	ATATT	2	10	563432	563441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018664	AAGTA	2	10	566031	566040	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018664	AAATT	2	10	646403	646412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_018664	TAAAA	2	10	735739	735748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_018664	TATAA	2	10	738896	738905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_018664	TTTTA	2	10	819443	819452	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_018664	TTACA	2	10	913517	913526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_018664	GTAAG	2	10	917155	917164	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_018664	CTAAA	2	10	1008176	1008185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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475	NC_018664	ATTAT	2	10	1619263	1619272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_018664	TTTCT	2	10	1694759	1694768	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
495	NC_018664	TTTTA	2	10	1700133	1700142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_018664	TTCTA	2	10	1718606	1718615	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
497	NC_018664	ATTAA	3	15	1718764	1718778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_018664	TCTTT	2	10	1719711	1719720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
499	NC_018664	TGCAC	2	10	1721429	1721438	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
500	NC_018664	TTTAT	2	10	1721448	1721457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

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