MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 2416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	GTAAT	2	10	1858	1867	40 %	40 %	20 %	0 %	407472534
2	NC_018664	AAATT	2	10	3413	3422	60 %	40 %	0 %	0 %	407472536
3	NC_018664	TAGAT	2	10	5988	5997	40 %	40 %	20 %	0 %	407472538
4	NC_018664	GAAAA	2	10	7235	7244	80 %	0 %	20 %	0 %	407472539
5	NC_018664	AATAT	2	10	9688	9697	60 %	40 %	0 %	0 %	407472541
6	NC_018664	TAAAA	2	10	9881	9890	80 %	20 %	0 %	0 %	407472541
7	NC_018664	GAAGA	2	10	16896	16905	60 %	0 %	40 %	0 %	407472543
8	NC_018664	GATCT	2	10	18047	18056	20 %	40 %	20 %	20 %	407472545
9	NC_018664	AGAAA	2	10	21805	21814	80 %	0 %	20 %	0 %	407472548
10	NC_018664	GAATT	2	10	22116	22125	40 %	40 %	20 %	0 %	407472548
11	NC_018664	AAGAA	2	10	22144	22153	80 %	0 %	20 %	0 %	407472548
12	NC_018664	AGTTA	2	10	22494	22503	40 %	40 %	20 %	0 %	407472548
13	NC_018664	AATAA	2	10	23815	23824	80 %	20 %	0 %	0 %	407472549
14	NC_018664	CTAAA	2	10	25415	25424	60 %	20 %	0 %	20 %	407472551
15	NC_018664	CAATC	2	10	26846	26855	40 %	20 %	0 %	40 %	407472553
16	NC_018664	ATTTT	2	10	27307	27316	20 %	80 %	0 %	0 %	407472553
17	NC_018664	TTATT	2	10	27801	27810	20 %	80 %	0 %	0 %	407472554
18	NC_018664	AGAAA	2	10	28475	28484	80 %	0 %	20 %	0 %	407472555
19	NC_018664	GATAA	2	10	28486	28495	60 %	20 %	20 %	0 %	407472555
20	NC_018664	TTTTA	2	10	28580	28589	20 %	80 %	0 %	0 %	407472556
21	NC_018664	TACCT	2	10	28742	28751	20 %	40 %	0 %	40 %	407472556
22	NC_018664	TTTAC	2	10	29382	29391	20 %	60 %	0 %	20 %	407472556
23	NC_018664	CTATA	2	10	30035	30044	40 %	40 %	0 %	20 %	407472557
24	NC_018664	GGTAT	2	10	32025	32034	20 %	40 %	40 %	0 %	407472558
25	NC_018664	AATAT	2	10	33735	33744	60 %	40 %	0 %	0 %	407472560
26	NC_018664	ACTAT	2	10	35399	35408	40 %	40 %	0 %	20 %	407472561
27	NC_018664	ATTAT	2	10	35639	35648	40 %	60 %	0 %	0 %	407472561
28	NC_018664	TATTT	2	10	40113	40122	20 %	80 %	0 %	0 %	407472569
29	NC_018664	ATCTT	2	10	40330	40339	20 %	60 %	0 %	20 %	407472569
30	NC_018664	ATTTA	2	10	43280	43289	40 %	60 %	0 %	0 %	407472572
31	NC_018664	TATCA	2	10	43645	43654	40 %	40 %	0 %	20 %	407472573
32	NC_018664	ATTTA	2	10	45513	45522	40 %	60 %	0 %	0 %	407472574
33	NC_018664	CTTTT	2	10	47217	47226	0 %	80 %	0 %	20 %	407472575
34	NC_018664	TTTAT	2	10	47299	47308	20 %	80 %	0 %	0 %	407472575
35	NC_018664	GGTCA	2	10	47974	47983	20 %	20 %	40 %	20 %	407472576
36	NC_018664	AATTA	2	10	48953	48962	60 %	40 %	0 %	0 %	407472577
37	NC_018664	AAAAG	2	10	48991	49000	80 %	0 %	20 %	0 %	407472577
38	NC_018664	ATAAG	2	10	55040	55049	60 %	20 %	20 %	0 %	407472581
39	NC_018664	ATGCA	2	10	56887	56896	40 %	20 %	20 %	20 %	407472582
40	NC_018664	TAATA	2	10	56917	56926	60 %	40 %	0 %	0 %	407472582
41	NC_018664	AAGCA	2	10	57148	57157	60 %	0 %	20 %	20 %	407472583
42	NC_018664	CTGGA	2	10	57760	57769	20 %	20 %	40 %	20 %	407472584
43	NC_018664	TTAAT	2	10	58475	58484	40 %	60 %	0 %	0 %	407472585
44	NC_018664	TAGAT	2	10	59445	59454	40 %	40 %	20 %	0 %	407472586
45	NC_018664	AATAA	2	10	61051	61060	80 %	20 %	0 %	0 %	407472586
46	NC_018664	AATGA	2	10	61983	61992	60 %	20 %	20 %	0 %	407472587
47	NC_018664	ATATT	2	10	62763	62772	40 %	60 %	0 %	0 %	407472588
48	NC_018664	TGAAG	2	10	64574	64583	40 %	20 %	40 %	0 %	407472589
49	NC_018664	TTATT	2	10	65477	65486	20 %	80 %	0 %	0 %	407472589
50	NC_018664	ATAAA	2	10	66087	66096	80 %	20 %	0 %	0 %	407472590
51	NC_018664	AAAAT	2	10	68566	68575	80 %	20 %	0 %	0 %	407472592
52	NC_018664	ATATT	2	10	68791	68800	40 %	60 %	0 %	0 %	407472592
53	NC_018664	TTGCT	2	10	72143	72152	0 %	60 %	20 %	20 %	407472595
54	NC_018664	AATTT	2	10	74551	74560	40 %	60 %	0 %	0 %	407472597
55	NC_018664	ATAAA	2	10	74692	74701	80 %	20 %	0 %	0 %	407472597
56	NC_018664	AGTAA	2	10	75858	75867	60 %	20 %	20 %	0 %	407472598
57	NC_018664	TGAAA	2	10	76796	76805	60 %	20 %	20 %	0 %	407472600
58	NC_018664	TCAGA	2	10	80657	80666	40 %	20 %	20 %	20 %	407472604
59	NC_018664	TAACT	2	10	80751	80760	40 %	40 %	0 %	20 %	407472604
60	NC_018664	ACAAG	2	10	82903	82912	60 %	0 %	20 %	20 %	407472605
61	NC_018664	AAAAG	2	10	83541	83550	80 %	0 %	20 %	0 %	407472606
62	NC_018664	TAGAA	2	10	83966	83975	60 %	20 %	20 %	0 %	407472607
63	NC_018664	AAAAG	2	10	86084	86093	80 %	0 %	20 %	0 %	407472608
64	NC_018664	AGATA	2	10	86527	86536	60 %	20 %	20 %	0 %	407472609
65	NC_018664	AGAGA	2	10	86798	86807	60 %	0 %	40 %	0 %	407472609
66	NC_018664	ACTGG	2	10	87331	87340	20 %	20 %	40 %	20 %	407472610
67	NC_018664	TGAGT	2	10	87941	87950	20 %	40 %	40 %	0 %	407472610
68	NC_018664	AAAAG	2	10	88208	88217	80 %	0 %	20 %	0 %	407472610
69	NC_018664	AGTAT	2	10	89034	89043	40 %	40 %	20 %	0 %	407472611
70	NC_018664	TACCT	2	10	91280	91289	20 %	40 %	0 %	40 %	407472613
71	NC_018664	TGGAA	2	10	92077	92086	40 %	20 %	40 %	0 %	407472614
72	NC_018664	TATCT	2	10	93842	93851	20 %	60 %	0 %	20 %	407472617
73	NC_018664	ACTTA	2	10	94592	94601	40 %	40 %	0 %	20 %	407472618
74	NC_018664	ACTTC	2	10	94848	94857	20 %	40 %	0 %	40 %	407472618
75	NC_018664	TAATA	2	10	97226	97235	60 %	40 %	0 %	0 %	407472620
76	NC_018664	GATAA	2	10	100052	100061	60 %	20 %	20 %	0 %	407472624
77	NC_018664	TCAAC	2	10	102753	102762	40 %	20 %	0 %	40 %	407472626
78	NC_018664	ATGGA	2	10	105164	105173	40 %	20 %	40 %	0 %	407472630
79	NC_018664	AAATA	2	10	105734	105743	80 %	20 %	0 %	0 %	407472631
80	NC_018664	TATAC	2	10	107724	107733	40 %	40 %	0 %	20 %	407472634
81	NC_018664	ATATT	2	10	111554	111563	40 %	60 %	0 %	0 %	407472638
82	NC_018664	AAGAG	2	10	113492	113501	60 %	0 %	40 %	0 %	407472641
83	NC_018664	AATAG	2	10	115651	115660	60 %	20 %	20 %	0 %	407472644
84	NC_018664	TTACT	2	10	115670	115679	20 %	60 %	0 %	20 %	407472644
85	NC_018664	ATCAC	2	10	116631	116640	40 %	20 %	0 %	40 %	407472645
86	NC_018664	GAAGT	2	10	119709	119718	40 %	20 %	40 %	0 %	407472649
87	NC_018664	AAATG	2	10	119819	119828	60 %	20 %	20 %	0 %	407472649
88	NC_018664	GATTA	2	10	121577	121586	40 %	40 %	20 %	0 %	407472650
89	NC_018664	TAGAA	2	10	123177	123186	60 %	20 %	20 %	0 %	407472652
90	NC_018664	AAAAT	2	10	123785	123794	80 %	20 %	0 %	0 %	407472652
91	NC_018664	TAGAG	2	10	124771	124780	40 %	20 %	40 %	0 %	407472653
92	NC_018664	CAGTA	2	10	125515	125524	40 %	20 %	20 %	20 %	407472654
93	NC_018664	AATAA	2	10	127891	127900	80 %	20 %	0 %	0 %	407472656
94	NC_018664	AAGAA	2	10	128115	128124	80 %	0 %	20 %	0 %	407472657
95	NC_018664	CTTAT	2	10	131114	131123	20 %	60 %	0 %	20 %	407472662
96	NC_018664	TTTAT	2	10	131291	131300	20 %	80 %	0 %	0 %	407472662
97	NC_018664	TTACA	2	10	132715	132724	40 %	40 %	0 %	20 %	407472664
98	NC_018664	AAAAC	2	10	134570	134579	80 %	0 %	0 %	20 %	407472664
99	NC_018664	CAAAT	2	10	135067	135076	60 %	20 %	0 %	20 %	407472666
100	NC_018664	GTTTA	2	10	135994	136003	20 %	60 %	20 %	0 %	407472667
101	NC_018664	AAGAA	2	10	136383	136392	80 %	0 %	20 %	0 %	407472667
102	NC_018664	GATAA	2	10	137040	137049	60 %	20 %	20 %	0 %	407472668
103	NC_018664	AATAT	2	10	137761	137770	60 %	40 %	0 %	0 %	407472668
104	NC_018664	AAATG	2	10	139443	139452	60 %	20 %	20 %	0 %	407472669
105	NC_018664	AAATG	2	10	139563	139572	60 %	20 %	20 %	0 %	407472669
106	NC_018664	TTTCC	2	10	140971	140980	0 %	60 %	0 %	40 %	407472670
107	NC_018664	AGGAA	2	10	141041	141050	60 %	0 %	40 %	0 %	407472670
108	NC_018664	AGTTG	2	10	142295	142304	20 %	40 %	40 %	0 %	407472671
109	NC_018664	ATCAG	2	10	144651	144660	40 %	20 %	20 %	20 %	407472674
110	NC_018664	AGAGA	2	10	145538	145547	60 %	0 %	40 %	0 %	407472675
111	NC_018664	GAAGA	2	10	145949	145958	60 %	0 %	40 %	0 %	407472675
112	NC_018664	AAAAT	2	10	147537	147546	80 %	20 %	0 %	0 %	407472676
113	NC_018664	GAATT	2	10	149417	149426	40 %	40 %	20 %	0 %	407472677
114	NC_018664	ACTAG	2	10	151885	151894	40 %	20 %	20 %	20 %	407472680
115	NC_018664	ATTGT	2	10	152919	152928	20 %	60 %	20 %	0 %	407472681
116	NC_018664	AATGT	2	10	153108	153117	40 %	40 %	20 %	0 %	407472681
117	NC_018664	TATTT	2	10	153136	153145	20 %	80 %	0 %	0 %	407472681
118	NC_018664	GGATT	2	10	153664	153673	20 %	40 %	40 %	0 %	407472682
119	NC_018664	AATAG	2	10	153802	153811	60 %	20 %	20 %	0 %	407472682
120	NC_018664	ATATA	2	10	161171	161180	60 %	40 %	0 %	0 %	407472688
121	NC_018664	TAAAT	2	10	162266	162275	60 %	40 %	0 %	0 %	407472689
122	NC_018664	TAAGA	2	10	165731	165740	60 %	20 %	20 %	0 %	407472693
123	NC_018664	CTAAA	2	10	165955	165964	60 %	20 %	0 %	20 %	407472693
124	NC_018664	AAAGT	2	10	167107	167116	60 %	20 %	20 %	0 %	407472693
125	NC_018664	ACAAG	2	10	171378	171387	60 %	0 %	20 %	20 %	407472694
126	NC_018664	GAAAT	2	10	171445	171454	60 %	20 %	20 %	0 %	407472694
127	NC_018664	AATAT	2	10	171478	171487	60 %	40 %	0 %	0 %	407472694
128	NC_018664	ATTAA	2	10	173352	173361	60 %	40 %	0 %	0 %	407472694
129	NC_018664	TGGTA	2	10	174453	174462	20 %	40 %	40 %	0 %	407472695
130	NC_018664	GATAC	2	10	174661	174670	40 %	20 %	20 %	20 %	407472695
131	NC_018664	AAGTT	2	10	177706	177715	40 %	40 %	20 %	0 %	407472697
132	NC_018664	ACTAT	2	10	178018	178027	40 %	40 %	0 %	20 %	407472697
133	NC_018664	AATTA	2	10	178550	178559	60 %	40 %	0 %	0 %	407472697
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135	NC_018664	ATAAG	2	10	181562	181571	60 %	20 %	20 %	0 %	407472699
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