MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium acidurici 9a chromosome

Total Repeats: 9671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018664	AATG	2	8	96	103	50 %	25 %	25 %	0 %	407472533
2	NC_018664	ATGA	2	8	209	216	50 %	25 %	25 %	0 %	407472533
3	NC_018664	ATGC	2	8	569	576	25 %	25 %	25 %	25 %	407472533
4	NC_018664	AAGT	2	8	694	701	50 %	25 %	25 %	0 %	407472533
5	NC_018664	GAAC	2	8	755	762	50 %	0 %	25 %	25 %	407472533
6	NC_018664	AATA	2	8	1721	1728	75 %	25 %	0 %	0 %	407472534
7	NC_018664	TACT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	0 %	25 %	407472534
8	NC_018664	AAGA	2	8	3128	3135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018664	ATTA	2	8	3183	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
10	NC_018664	TAAA	2	8	3224	3231	75 %	25 %	0 %	0 %	407472536
11	NC_018664	AAAC	2	8	3269	3276	75 %	0 %	0 %	25 %	407472536
12	NC_018664	AATA	2	8	3450	3457	75 %	25 %	0 %	0 %	407472536
13	NC_018664	TAAT	2	8	4247	4254	50 %	50 %	0 %	0 %	407472536
14	NC_018664	TAAA	2	8	5210	5217	75 %	25 %	0 %	0 %	407472538
15	NC_018664	AGAT	2	8	5928	5935	50 %	25 %	25 %	0 %	407472538
16	NC_018664	AGTA	2	8	6648	6655	50 %	25 %	25 %	0 %	407472539
17	NC_018664	AATG	2	8	6714	6721	50 %	25 %	25 %	0 %	407472539
18	NC_018664	TAAA	2	8	7361	7368	75 %	25 %	0 %	0 %	407472539
19	NC_018664	AAGC	2	8	7813	7820	50 %	0 %	25 %	25 %	407472539
20	NC_018664	GAAA	2	8	7920	7927	75 %	0 %	25 %	0 %	407472539
21	NC_018664	CAAG	2	8	8293	8300	50 %	0 %	25 %	25 %	407472539
22	NC_018664	TGAA	2	8	8435	8442	50 %	25 %	25 %	0 %	407472539
23	NC_018664	TAAA	2	8	8633	8640	75 %	25 %	0 %	0 %	407472539
24	NC_018664	TATT	2	8	9455	9462	25 %	75 %	0 %	0 %	407472540
25	NC_018664	ACTA	2	8	9710	9717	50 %	25 %	0 %	25 %	407472541
26	NC_018664	TAGA	2	8	10143	10150	50 %	25 %	25 %	0 %	407472542
27	NC_018664	TTTC	2	8	10523	10530	0 %	75 %	0 %	25 %	407472542
28	NC_018664	CCTT	2	8	11258	11265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018664	GTGA	2	8	11533	11540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018664	AGAA	2	8	13129	13136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018664	CATT	2	8	14025	14032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018664	GGTG	2	8	14217	14224	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018664	TAAA	2	8	16417	16424	75 %	25 %	0 %	0 %	407472543
34	NC_018664	AGTT	2	8	16537	16544	25 %	50 %	25 %	0 %	407472543
35	NC_018664	ATTT	2	8	17868	17875	25 %	75 %	0 %	0 %	407472544
36	NC_018664	TCAG	2	8	18034	18041	25 %	25 %	25 %	25 %	407472545
37	NC_018664	TTTA	2	8	18102	18109	25 %	75 %	0 %	0 %	407472545
38	NC_018664	GTTC	2	8	18571	18578	0 %	50 %	25 %	25 %	407472545
39	NC_018664	GGAA	2	8	18741	18748	50 %	0 %	50 %	0 %	407472545
40	NC_018664	AACT	2	8	18965	18972	50 %	25 %	0 %	25 %	407472545
41	NC_018664	TAAA	2	8	19079	19086	75 %	25 %	0 %	0 %	407472545
42	NC_018664	TTTA	2	8	19127	19134	25 %	75 %	0 %	0 %	407472545
43	NC_018664	ATTA	2	8	20368	20375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018664	AATA	2	8	20572	20579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018664	AAAT	2	8	20703	20710	75 %	25 %	0 %	0 %	407472547
46	NC_018664	ATAA	2	8	21317	21324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018664	AAAT	2	8	21560	21567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018664	AAGG	2	8	21571	21578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018664	GATA	2	8	21859	21866	50 %	25 %	25 %	0 %	407472548
50	NC_018664	TAGA	2	8	22479	22486	50 %	25 %	25 %	0 %	407472548
51	NC_018664	TAGA	2	8	22664	22671	50 %	25 %	25 %	0 %	407472549
52	NC_018664	TAAA	2	8	23051	23058	75 %	25 %	0 %	0 %	407472549
53	NC_018664	GATA	2	8	23067	23074	50 %	25 %	25 %	0 %	407472549
54	NC_018664	AATA	2	8	23332	23339	75 %	25 %	0 %	0 %	407472549
55	NC_018664	AGAT	2	8	23463	23470	50 %	25 %	25 %	0 %	407472549
56	NC_018664	ATAA	2	8	23713	23720	75 %	25 %	0 %	0 %	407472549
57	NC_018664	AAAG	2	8	24296	24303	75 %	0 %	25 %	0 %	407472550
58	NC_018664	GAAG	2	8	24345	24352	50 %	0 %	50 %	0 %	407472550
59	NC_018664	ACTC	2	8	24876	24883	25 %	25 %	0 %	50 %	407472550
60	NC_018664	TAGT	2	8	25160	25167	25 %	50 %	25 %	0 %	407472551
61	NC_018664	GATT	2	8	25520	25527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018664	GAAG	2	8	25810	25817	50 %	0 %	50 %	0 %	407472552
63	NC_018664	AAGG	2	8	25895	25902	50 %	0 %	50 %	0 %	407472552
64	NC_018664	GGAA	2	8	26352	26359	50 %	0 %	50 %	0 %	407472552
65	NC_018664	GGAT	2	8	26515	26522	25 %	25 %	50 %	0 %	407472552
66	NC_018664	TTAA	2	8	26647	26654	50 %	50 %	0 %	0 %	407472553
67	NC_018664	ATAA	2	8	26733	26740	75 %	25 %	0 %	0 %	407472553
68	NC_018664	TGTT	2	8	27152	27159	0 %	75 %	25 %	0 %	407472553
69	NC_018664	GTTT	2	8	27262	27269	0 %	75 %	25 %	0 %	407472553
70	NC_018664	TTTA	2	8	27728	27735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018664	TTAA	2	8	27771	27778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018664	AATT	2	8	28078	28085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018664	AAAC	2	8	28092	28099	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018664	TAAA	2	8	28380	28387	75 %	25 %	0 %	0 %	407472555
75	NC_018664	ACTA	2	8	28415	28422	50 %	25 %	0 %	25 %	407472555
76	NC_018664	ATTT	2	8	28553	28560	25 %	75 %	0 %	0 %	407472556
77	NC_018664	ATCT	2	8	28603	28610	25 %	50 %	0 %	25 %	407472556
78	NC_018664	CGTT	2	8	28668	28675	0 %	50 %	25 %	25 %	407472556
79	NC_018664	TAAT	2	8	28702	28709	50 %	50 %	0 %	0 %	407472556
80	NC_018664	TCAA	2	8	29349	29356	50 %	25 %	0 %	25 %	407472556
81	NC_018664	TAAA	2	8	29419	29426	75 %	25 %	0 %	0 %	407472556
82	NC_018664	AATT	2	8	29860	29867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018664	AATA	2	8	29928	29935	75 %	25 %	0 %	0 %	407472557
84	NC_018664	CAAG	2	8	30312	30319	50 %	0 %	25 %	25 %	407472557
85	NC_018664	GTCT	2	8	31193	31200	0 %	50 %	25 %	25 %	407472557
86	NC_018664	ATTT	2	8	31258	31265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018664	CATA	2	8	31355	31362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018664	TAGA	2	8	31404	31411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018664	GCTT	2	8	31428	31435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018664	CAAA	2	8	31523	31530	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018664	ATTC	2	8	31743	31750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018664	TAAA	2	8	31952	31959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018664	ATTA	2	8	32165	32172	50 %	50 %	0 %	0 %	407472558
94	NC_018664	AATT	2	8	32299	32306	50 %	50 %	0 %	0 %	407472558
95	NC_018664	ATTT	2	8	32620	32627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018664	TAAC	2	8	32810	32817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018664	TGGT	2	8	33447	33454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018664	TAAA	2	8	34937	34944	75 %	25 %	0 %	0 %	407472560
99	NC_018664	AAAT	2	8	35090	35097	75 %	25 %	0 %	0 %	407472561
100	NC_018664	CTTT	2	8	35329	35336	0 %	75 %	0 %	25 %	407472561
101	NC_018664	TGTT	2	8	35371	35378	0 %	75 %	25 %	0 %	407472561
102	NC_018664	TGTA	2	8	35455	35462	25 %	50 %	25 %	0 %	407472561
103	NC_018664	TAAT	2	8	35718	35725	50 %	50 %	0 %	0 %	407472561
104	NC_018664	TATT	2	8	35828	35835	25 %	75 %	0 %	0 %	407472561
105	NC_018664	CTTC	2	8	35877	35884	0 %	50 %	0 %	50 %	407472561
106	NC_018664	ATTA	2	8	36057	36064	50 %	50 %	0 %	0 %	407472562
107	NC_018664	TAAT	2	8	36929	36936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018664	ATAA	2	8	37015	37022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018664	ACTT	2	8	37397	37404	25 %	50 %	0 %	25 %	407472564
110	NC_018664	AGAA	2	8	38423	38430	75 %	0 %	25 %	0 %	407472565
111	NC_018664	TAGA	2	8	38819	38826	50 %	25 %	25 %	0 %	407472565
112	NC_018664	ATTT	2	8	38863	38870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018664	ATAG	2	8	39253	39260	50 %	25 %	25 %	0 %	407472566
114	NC_018664	TCTT	2	8	39558	39565	0 %	75 %	0 %	25 %	407472567
115	NC_018664	AGAA	2	8	39692	39699	75 %	0 %	25 %	0 %	407472567
116	NC_018664	ATAA	2	8	39749	39756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018664	CCTT	2	8	40031	40038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018664	ATTG	2	8	40546	40553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018664	AATT	2	8	40833	40840	50 %	50 %	0 %	0 %	407472570
120	NC_018664	ATAG	2	8	40868	40875	50 %	25 %	25 %	0 %	407472570
121	NC_018664	AAAT	2	8	40887	40894	75 %	25 %	0 %	0 %	407472570
122	NC_018664	GATA	2	8	41050	41057	50 %	25 %	25 %	0 %	407472570
123	NC_018664	AAAC	2	8	41061	41068	75 %	0 %	0 %	25 %	407472570
124	NC_018664	TAGA	2	8	41234	41241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018664	ATTA	2	8	41345	41352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018664	TAAC	2	8	41378	41385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018664	AAAT	2	8	41424	41431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018664	AGAA	2	8	41478	41485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018664	TCTA	2	8	42164	42171	25 %	50 %	0 %	25 %	407472571
130	NC_018664	ATAA	2	8	42318	42325	75 %	25 %	0 %	0 %	407472571
131	NC_018664	ATTT	2	8	42349	42356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018664	AGTT	2	8	42707	42714	25 %	50 %	25 %	0 %	407472572
133	NC_018664	AAAC	2	8	42935	42942	75 %	0 %	0 %	25 %	407472572
134	NC_018664	TAGA	2	8	43109	43116	50 %	25 %	25 %	0 %	407472572
135	NC_018664	AATA	2	8	43329	43336	75 %	25 %	0 %	0 %	407472572
136	NC_018664	GAAA	2	8	43383	43390	75 %	0 %	25 %	0 %	407472572
137	NC_018664	AATA	2	8	43408	43415	75 %	25 %	0 %	0 %	407472572
138	NC_018664	TTGC	2	8	43614	43621	0 %	50 %	25 %	25 %	407472573
139	NC_018664	TACC	2	8	43677	43684	25 %	25 %	0 %	50 %	407472573
140	NC_018664	GTTA	2	8	44254	44261	25 %	50 %	25 %	0 %	407472573
141	NC_018664	AAAT	2	8	44458	44465	75 %	25 %	0 %	0 %	407472573
142	NC_018664	AGTT	2	8	44943	44950	25 %	50 %	25 %	0 %	407472574
143	NC_018664	AAAC	2	8	45171	45178	75 %	0 %	0 %	25 %	407472574
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