MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	CAGCGG	2	12	1065	1076	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407471878
2	NC_018662	GCTGTC	2	12	2123	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471880
3	NC_018662	TGACAC	2	12	4760	4771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407471884
4	NC_018662	TGGATA	2	12	4958	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471884
5	NC_018662	GGGCCG	2	12	8675	8686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018662	GCCGGA	2	12	13057	13068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407471896
7	NC_018662	TCCGCC	2	12	15464	15475	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018662	CATCAG	2	12	15595	15606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407471900
9	NC_018662	GGAGCA	2	12	15908	15919	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407471901
10	NC_018662	GCCCCA	2	12	20020	20031	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407471905
11	NC_018662	CCACAT	2	12	20326	20337	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407471905
12	NC_018662	ACAGGA	2	12	23612	23623	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018662	TGATGC	2	12	30590	30601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018662	CTGGAG	2	12	31932	31943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018662	TGCTCC	2	12	32896	32907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407471914
16	NC_018662	GCTGAT	2	12	33208	33219	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407471915
17	NC_018662	GGCGGA	2	12	34776	34787	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	407471916
18	NC_018662	AACATC	2	12	40573	40584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407471921
19	NC_018662	TGGATG	2	12	44946	44957	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018662	AGCAAG	2	12	46550	46561	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407471926
21	NC_018662	CAAGAT	2	12	46848	46859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018662	TCTAGC	2	12	48910	48921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018662	ACTTAT	2	12	55695	55706	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407471932
24	NC_018662	AAACAG	2	12	59640	59651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407471938
25	NC_018662	AGGTGC	2	12	63758	63769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407471944
26	NC_018662	TATTGA	2	12	66347	66358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018662	ACTTGA	13	78	70196	70273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.