MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	TTAT	2	8	2269	2276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018662	GAAA	2	8	2591	2598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018662	CGAC	2	8	3769	3776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018662	AAAC	2	8	4126	4133	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018662	AGAC	2	8	4205	4212	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018662	ATGA	2	8	4399	4406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018662	TCAG	2	8	4622	4629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018662	CAGG	2	8	4678	4685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018662	AGTG	2	8	5774	5781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018662	TTTG	2	8	6833	6840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018662	AAGG	2	8	6988	6995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018662	TGAT	2	8	8422	8429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018662	CCAG	2	8	8598	8605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018662	GAGG	2	8	8699	8706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018662	TCTG	2	8	8820	8827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018662	AATG	2	8	8863	8870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018662	GCCA	2	8	10239	10246	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018662	CGGG	2	8	10758	10765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018662	ATAA	2	8	12004	12011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018662	AAAT	2	8	12051	12058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018662	TTTC	2	8	15415	15422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018662	ACTC	2	8	22484	22491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018662	GCTG	2	8	22914	22921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018662	TATT	2	8	23657	23664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018662	TAAT	2	8	23815	23822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018662	ATTT	2	8	24322	24329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018662	AAAT	2	8	24539	24546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018662	AGAA	2	8	26814	26821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018662	TCCA	2	8	27860	27867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018662	TAAT	2	8	27877	27884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018662	GCCT	2	8	28257	28264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018662	AACT	2	8	28784	28791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018662	GAAA	2	8	28963	28970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018662	ATGG	2	8	29111	29118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018662	CCAG	2	8	29947	29954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018662	AAAC	2	8	30926	30933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018662	TCCT	2	8	31155	31162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018662	AATG	2	8	31241	31248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018662	ATTT	2	8	31336	31343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018662	GTGG	2	8	31413	31420	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018662	AATG	2	8	32174	32181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018662	CATT	2	8	32238	32245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018662	GAAG	2	8	36772	36779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018662	AGGA	2	8	36853	36860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018662	CTTT	2	8	37023	37030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018662	ATTT	2	8	37114	37121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018662	TCAG	2	8	42400	42407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018662	AGTC	2	8	42542	42549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018662	ATTA	2	8	44935	44942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018662	TTGG	2	8	45094	45101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018662	AGCC	2	8	45225	45232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018662	CAGC	2	8	45423	45430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018662	ATAA	2	8	45529	45536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018662	TGAT	2	8	46278	46285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018662	GTTT	2	8	46951	46958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018662	GTAT	2	8	48710	48717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018662	TGTC	2	8	48750	48757	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018662	TGAT	2	8	48981	48988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018662	CCAC	2	8	49218	49225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_018662	ATAC	2	8	49398	49405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018662	GGCT	2	8	51252	51259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018662	CAGC	2	8	52438	52445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018662	GCCA	2	8	52654	52661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018662	CCTG	2	8	52717	52724	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018662	CTTG	2	8	52767	52774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018662	CGAC	2	8	52855	52862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018662	CAGA	2	8	53147	53154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018662	GCCC	2	8	53179	53186	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_018662	GTAA	2	8	53204	53211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018662	CCAC	2	8	53218	53225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_018662	TCTT	2	8	53460	53467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018662	ATAA	2	8	54506	54513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018662	TGAT	2	8	55983	55990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018662	GCCA	2	8	56200	56207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018662	GAAA	2	8	57241	57248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018662	GCAT	2	8	58725	58732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018662	TTGA	2	8	58967	58974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018662	AAAT	2	8	65166	65173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018662	CAAT	2	8	65804	65811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018662	TAAT	2	8	66405	66412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018662	ATAA	2	8	66426	66433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018662	ATGT	2	8	69347	69354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018662	GCTG	2	8	70888	70895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018662	TAAT	2	8	71018	71025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018662	TGTA	2	8	74898	74905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018662	TGTT	2	8	75507	75514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.