MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	GAT	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471877
2	NC_018662	TTC	2	6	39	44	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471877
3	NC_018662	CCT	2	6	67	72	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471877
4	NC_018662	TCA	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471877
5	NC_018662	TCT	2	6	215	220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471877
6	NC_018662	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471877
7	NC_018662	CAC	2	6	614	619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471877
8	NC_018662	TTA	2	6	1160	1165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471878
9	NC_018662	CTG	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471878
10	NC_018662	TTC	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471878
11	NC_018662	GGC	2	6	1288	1293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471878
12	NC_018662	GTT	2	6	1305	1310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471878
13	NC_018662	CAG	2	6	1417	1422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471878
14	NC_018662	GCG	2	6	1429	1434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471878
15	NC_018662	CAG	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471878
16	NC_018662	TCA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471878
17	NC_018662	ACA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471878
18	NC_018662	CTT	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471879
19	NC_018662	GGT	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471879
20	NC_018662	CAT	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471879
21	NC_018662	CAC	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471879
22	NC_018662	CAG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471879
23	NC_018662	AAT	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471879
24	NC_018662	AGC	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471880
25	NC_018662	GCT	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471880
26	NC_018662	CAA	2	6	2785	2790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471881
27	NC_018662	CGA	2	6	2962	2967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471881
28	NC_018662	CGC	2	6	3054	3059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471882
29	NC_018662	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471882
30	NC_018662	ACC	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471882
31	NC_018662	CCA	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471882
32	NC_018662	AAC	2	6	3298	3303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471882
33	NC_018662	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471882
34	NC_018662	TAC	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471883
35	NC_018662	CAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471883
36	NC_018662	GTC	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471884
37	NC_018662	AAC	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471884
38	NC_018662	GAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471884
39	NC_018662	GAA	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471884
40	NC_018662	TCA	2	6	5089	5094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471884
41	NC_018662	CTA	2	6	5214	5219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471884
42	NC_018662	CTT	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471884
43	NC_018662	ATG	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471884
44	NC_018662	GCA	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471885
45	NC_018662	TCG	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471885
46	NC_018662	ACG	3	9	6309	6317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471885
47	NC_018662	GTG	2	6	6325	6330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471885
48	NC_018662	ATC	2	6	6331	6336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471885
49	NC_018662	CAG	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471885
50	NC_018662	TTC	2	6	6632	6637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471885
51	NC_018662	AAT	2	6	7145	7150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471886
52	NC_018662	GCT	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471887
53	NC_018662	AAC	2	6	7832	7837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471888
54	NC_018662	GGC	2	6	7903	7908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471888
55	NC_018662	CTC	3	9	8112	8120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471889
56	NC_018662	GGC	2	6	8181	8186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471889
57	NC_018662	TTG	2	6	8240	8245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471889
58	NC_018662	ACG	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471890
59	NC_018662	ACG	2	6	9367	9372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471890
60	NC_018662	GCG	2	6	9529	9534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471890
61	NC_018662	AGC	2	6	9612	9617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471890
62	NC_018662	GTG	2	6	9752	9757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471890
63	NC_018662	GCA	2	6	9810	9815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471890
64	NC_018662	GCA	2	6	9837	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471890
65	NC_018662	TTG	2	6	9992	9997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471891
66	NC_018662	CAT	2	6	10309	10314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471893
67	NC_018662	CAT	2	6	10845	10850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471894
68	NC_018662	TGC	2	6	11027	11032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471894
69	NC_018662	CAC	2	6	11154	11159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471894
70	NC_018662	CAT	2	6	11160	11165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471894
71	NC_018662	AGC	2	6	11186	11191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471894
72	NC_018662	ATG	2	6	11251	11256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471894
73	NC_018662	TGG	2	6	11270	11275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471894
74	NC_018662	CCA	2	6	11279	11284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471894
75	NC_018662	AGC	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471894
76	NC_018662	CAC	2	6	11430	11435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471894
77	NC_018662	GAG	2	6	11485	11490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471894
78	NC_018662	GAG	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471894
79	NC_018662	AGC	2	6	11603	11608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471894
80	NC_018662	CAT	2	6	11688	11693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471894
81	NC_018662	GCT	2	6	11733	11738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471894
82	NC_018662	ATT	2	6	12232	12237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471895
83	NC_018662	GCT	2	6	12267	12272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471895
84	NC_018662	CTG	2	6	12334	12339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471895
85	NC_018662	AAT	2	6	12553	12558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471896
86	NC_018662	CAT	2	6	12562	12567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471896
87	NC_018662	GAA	2	6	12632	12637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471896
88	NC_018662	GTA	2	6	12693	12698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471896
89	NC_018662	CGG	2	6	12860	12865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471896
90	NC_018662	CTG	2	6	13007	13012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471896
91	NC_018662	TAA	2	6	13069	13074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471896
92	NC_018662	TGT	2	6	13130	13135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471896
93	NC_018662	TTA	2	6	13190	13195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471896
94	NC_018662	AGC	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471896
95	NC_018662	TGA	2	6	13232	13237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471896
96	NC_018662	CTT	2	6	13519	13524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471897
97	NC_018662	GGC	2	6	13711	13716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471898
98	NC_018662	GAA	2	6	13856	13861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471898
99	NC_018662	TGG	2	6	14002	14007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471898
100	NC_018662	CAG	2	6	14056	14061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471898
101	NC_018662	TGT	2	6	14188	14193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471898
102	NC_018662	CGT	2	6	14246	14251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471898
103	NC_018662	CTG	2	6	14309	14314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471898
104	NC_018662	TGA	2	6	14371	14376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471898
105	NC_018662	TGA	2	6	14446	14451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471898
106	NC_018662	CGG	2	6	14478	14483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471898
107	NC_018662	GGT	2	6	14573	14578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471898
108	NC_018662	CAC	2	6	14680	14685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471898
109	NC_018662	CAG	2	6	14745	14750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471898
110	NC_018662	GGC	2	6	14761	14766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471898
111	NC_018662	CTG	2	6	14873	14878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471898
112	NC_018662	ACA	3	9	14931	14939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471898
113	NC_018662	GGT	2	6	15008	15013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471898
114	NC_018662	GCG	2	6	15020	15025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471898
115	NC_018662	TAC	2	6	15241	15246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471899
116	NC_018662	ACA	2	6	15366	15371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471899
117	NC_018662	CAC	2	6	15375	15380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471899
118	NC_018662	CGC	2	6	15384	15389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471899
119	NC_018662	GAA	2	6	15403	15408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471899
120	NC_018662	TCA	2	6	15482	15487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471900
121	NC_018662	ATC	2	6	15674	15679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471900
122	NC_018662	ATC	2	6	15777	15782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471900
123	NC_018662	AGC	2	6	15818	15823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471901
124	NC_018662	CAT	2	6	15844	15849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471901
125	NC_018662	GTT	2	6	16075	16080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471901
126	NC_018662	CGG	2	6	16175	16180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471901
127	NC_018662	GGC	2	6	16488	16493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471902
128	NC_018662	TCC	3	9	16526	16534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471902
129	NC_018662	AAT	2	6	16739	16744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471902
130	NC_018662	CCA	2	6	16750	16755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471902
131	NC_018662	GCC	2	6	16838	16843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471902
132	NC_018662	GCT	2	6	16859	16864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471902
133	NC_018662	TGG	2	6	16900	16905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471902
134	NC_018662	GTG	2	6	16907	16912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471902
135	NC_018662	TGA	2	6	16917	16922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471902
136	NC_018662	TCA	2	6	17178	17183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471903
137	NC_018662	CCG	2	6	17196	17201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471903
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139	NC_018662	CAG	2	6	17317	17322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471903
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141	NC_018662	GCT	2	6	17384	17389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471903
142	NC_018662	CAC	2	6	17414	17419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471903
143	NC_018662	GCC	2	6	17432	17437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471903
144	NC_018662	ATA	2	6	17488	17493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471903
145	NC_018662	AAT	2	6	17506	17511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471903
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147	NC_018662	TGA	2	6	17694	17699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471903
148	NC_018662	TCA	2	6	17799	17804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471903
149	NC_018662	CTG	2	6	17879	17884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471904
150	NC_018662	GCA	2	6	17896	17901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471904
151	NC_018662	GCA	2	6	17953	17958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471904
152	NC_018662	GCG	2	6	18101	18106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471905
153	NC_018662	CGG	2	6	18117	18122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471905
154	NC_018662	GCT	2	6	18197	18202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471905
155	NC_018662	ACC	2	6	18227	18232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471905
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157	NC_018662	ACC	2	6	18279	18284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471905
158	NC_018662	CGG	2	6	18475	18480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471905
159	NC_018662	TCC	2	6	18566	18571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471905
160	NC_018662	GAA	2	6	18589	18594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471905
161	NC_018662	GCC	2	6	18606	18611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471905
162	NC_018662	TGC	2	6	18768	18773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471905
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164	NC_018662	CCA	2	6	19222	19227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471905
165	NC_018662	CAT	2	6	19354	19359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471905
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167	NC_018662	CCT	2	6	19540	19545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471905
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172	NC_018662	CCA	2	6	19867	19872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471905
173	NC_018662	GCA	2	6	20056	20061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471905
174	NC_018662	ACC	2	6	20124	20129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471905
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245	NC_018662	GCT	2	6	33456	33461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
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247	NC_018662	GAA	2	6	33568	33573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471916
248	NC_018662	CGT	2	6	33655	33660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
249	NC_018662	CTG	2	6	33682	33687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471916
250	NC_018662	AAC	2	6	33689	33694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471916
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252	NC_018662	GAA	2	6	33823	33828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471916
253	NC_018662	AAC	2	6	33884	33889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471916
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257	NC_018662	ATG	2	6	34169	34174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471916
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