MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	T	6	6	734	739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018662	A	6	6	815	820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018662	C	6	6	1359	1364	0 %	0 %	0 %	100 %	407471878
4	NC_018662	G	6	6	2540	2545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018662	T	6	6	2567	2572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018662	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018662	C	7	7	2690	2696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_018662	A	9	9	2746	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018662	A	6	6	4218	4223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018662	A	6	6	4717	4722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018662	A	8	8	4855	4862	100 %	0 %	0 %	0 %	407471884
12	NC_018662	T	6	6	7416	7421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018662	T	7	7	7432	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018662	T	6	6	9087	9092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018662	T	6	6	9107	9112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018662	T	6	6	10619	10624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018662	A	6	6	11899	11904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018662	A	6	6	12159	12164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018662	A	7	7	12212	12218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018662	T	6	6	12272	12277	0 %	100 %	0 %	0 %	407471895
21	NC_018662	A	7	7	12847	12853	100 %	0 %	0 %	0 %	407471896
22	NC_018662	A	6	6	13021	13026	100 %	0 %	0 %	0 %	407471896
23	NC_018662	T	8	8	16435	16442	0 %	100 %	0 %	0 %	407471902
24	NC_018662	T	6	6	16645	16650	0 %	100 %	0 %	0 %	407471902
25	NC_018662	T	7	7	16831	16837	0 %	100 %	0 %	0 %	407471902
26	NC_018662	A	6	6	17108	17113	100 %	0 %	0 %	0 %	407471903
27	NC_018662	C	6	6	18214	18219	0 %	0 %	0 %	100 %	407471905
28	NC_018662	T	6	6	20269	20274	0 %	100 %	0 %	0 %	407471905
29	NC_018662	T	6	6	20965	20970	0 %	100 %	0 %	0 %	407471905
30	NC_018662	C	6	6	21405	21410	0 %	0 %	0 %	100 %	407471905
31	NC_018662	C	7	7	21771	21777	0 %	0 %	0 %	100 %	407471906
32	NC_018662	A	6	6	22800	22805	100 %	0 %	0 %	0 %	407471907
33	NC_018662	A	7	7	24337	24343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018662	A	6	6	24716	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	407471910
35	NC_018662	A	6	6	25025	25030	100 %	0 %	0 %	0 %	407471910
36	NC_018662	T	6	6	26380	26385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018662	C	6	6	26399	26404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_018662	T	6	6	26524	26529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018662	T	6	6	26636	26641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018662	C	6	6	27714	27719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_018662	A	7	7	27742	27748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018662	T	8	8	27761	27768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018662	A	6	6	27814	27819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018662	G	10	10	28520	28529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018662	C	6	6	28720	28725	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_018662	A	8	8	28747	28754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018662	A	6	6	28991	28996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018662	G	6	6	29117	29122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018662	A	6	6	29496	29501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018662	G	6	6	29577	29582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018662	A	6	6	29743	29748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018662	A	6	6	31051	31056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018662	A	7	7	32159	32165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018662	T	6	6	32267	32272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018662	A	6	6	33383	33388	100 %	0 %	0 %	0 %	407471915
56	NC_018662	A	7	7	33936	33942	100 %	0 %	0 %	0 %	407471916
57	NC_018662	A	6	6	34696	34701	100 %	0 %	0 %	0 %	407471916
58	NC_018662	T	6	6	35195	35200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018662	A	6	6	36497	36502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018662	A	6	6	36890	36895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018662	T	6	6	36921	36926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018662	A	6	6	37216	37221	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
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64	NC_018662	T	6	6	37610	37615	0 %	100 %	0 %	0 %	407471918
65	NC_018662	A	7	7	37783	37789	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
66	NC_018662	T	6	6	37875	37880	0 %	100 %	0 %	0 %	407471918
67	NC_018662	A	6	6	37986	37991	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
68	NC_018662	A	6	6	38278	38283	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
69	NC_018662	A	8	8	38334	38341	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
70	NC_018662	A	7	7	38379	38385	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
71	NC_018662	T	6	6	38545	38550	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
72	NC_018662	T	7	7	38602	38608	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
73	NC_018662	T	6	6	38866	38871	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
74	NC_018662	T	6	6	39031	39036	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
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77	NC_018662	T	6	6	40299	40304	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
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79	NC_018662	T	7	7	40593	40599	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
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81	NC_018662	A	7	7	42048	42054	100 %	0 %	0 %	0 %	407471922
82	NC_018662	A	6	6	42444	42449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_018662	C	6	6	43761	43766	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
87	NC_018662	T	6	6	43821	43826	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
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90	NC_018662	C	9	9	44288	44296	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
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93	NC_018662	T	7	7	45071	45077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018662	T	6	6	45766	45771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018662	T	6	6	46264	46269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018662	T	6	6	46790	46795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_018662	T	6	6	48414	48419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018662	A	7	7	48560	48566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018662	G	6	6	48744	48749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018662	G	6	6	51269	51274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_018662	T	6	6	54657	54662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018662	A	6	6	56070	56075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_018662	T	8	8	59871	59878	0 %	100 %	0 %	0 %	407471939
112	NC_018662	T	7	7	60142	60148	0 %	100 %	0 %	0 %	407471939
113	NC_018662	A	6	6	60660	60665	100 %	0 %	0 %	0 %	407471939
114	NC_018662	A	6	6	60819	60824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018662	A	8	8	60861	60868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018662	A	6	6	61373	61378	100 %	0 %	0 %	0 %	407471940
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118	NC_018662	A	6	6	61653	61658	100 %	0 %	0 %	0 %	407471940
119	NC_018662	T	7	7	62161	62167	0 %	100 %	0 %	0 %	407471942
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129	NC_018662	T	9	9	69190	69198	0 %	100 %	0 %	0 %	407471951
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132	NC_018662	T	7	7	69769	69775	0 %	100 %	0 %	0 %	407471952
133	NC_018662	T	7	7	69956	69962	0 %	100 %	0 %	0 %	407471952
134	NC_018662	A	7	7	70303	70309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_018662	T	6	6	71111	71116	0 %	100 %	0 %	0 %	407471955
137	NC_018662	T	6	6	71539	71544	0 %	100 %	0 %	0 %	407471955
138	NC_018662	T	6	6	72457	72462	0 %	100 %	0 %	0 %	407471957
139	NC_018662	T	8	8	74397	74404	0 %	100 %	0 %	0 %	407471960
140	NC_018662	A	6	6	74801	74806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018662	A	8	8	74848	74855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.