MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 plasmid pAA-09EL71

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018662	C	6	6	1359	1364	0 %	0 %	0 %	100 %	407471878
2	NC_018662	A	8	8	4855	4862	100 %	0 %	0 %	0 %	407471884
3	NC_018662	T	6	6	12272	12277	0 %	100 %	0 %	0 %	407471895
4	NC_018662	A	7	7	12847	12853	100 %	0 %	0 %	0 %	407471896
5	NC_018662	A	6	6	13021	13026	100 %	0 %	0 %	0 %	407471896
6	NC_018662	T	8	8	16435	16442	0 %	100 %	0 %	0 %	407471902
7	NC_018662	T	6	6	16645	16650	0 %	100 %	0 %	0 %	407471902
8	NC_018662	T	7	7	16831	16837	0 %	100 %	0 %	0 %	407471902
9	NC_018662	A	6	6	17108	17113	100 %	0 %	0 %	0 %	407471903
10	NC_018662	C	6	6	18214	18219	0 %	0 %	0 %	100 %	407471905
11	NC_018662	T	6	6	20269	20274	0 %	100 %	0 %	0 %	407471905
12	NC_018662	T	6	6	20965	20970	0 %	100 %	0 %	0 %	407471905
13	NC_018662	C	6	6	21405	21410	0 %	0 %	0 %	100 %	407471905
14	NC_018662	C	7	7	21771	21777	0 %	0 %	0 %	100 %	407471906
15	NC_018662	A	6	6	22800	22805	100 %	0 %	0 %	0 %	407471907
16	NC_018662	A	6	6	24716	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	407471910
17	NC_018662	A	6	6	25025	25030	100 %	0 %	0 %	0 %	407471910
18	NC_018662	A	6	6	33383	33388	100 %	0 %	0 %	0 %	407471915
19	NC_018662	A	7	7	33936	33942	100 %	0 %	0 %	0 %	407471916
20	NC_018662	A	6	6	34696	34701	100 %	0 %	0 %	0 %	407471916
21	NC_018662	A	6	6	37216	37221	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
22	NC_018662	A	7	7	37590	37596	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
23	NC_018662	T	6	6	37610	37615	0 %	100 %	0 %	0 %	407471918
24	NC_018662	A	7	7	37783	37789	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
25	NC_018662	T	6	6	37875	37880	0 %	100 %	0 %	0 %	407471918
26	NC_018662	A	6	6	37986	37991	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
27	NC_018662	A	6	6	38278	38283	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
28	NC_018662	A	8	8	38334	38341	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
29	NC_018662	A	7	7	38379	38385	100 %	0 %	0 %	0 %	407471918
30	NC_018662	T	6	6	38545	38550	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
31	NC_018662	T	7	7	38602	38608	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
32	NC_018662	T	6	6	38866	38871	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
33	NC_018662	T	6	6	39031	39036	0 %	100 %	0 %	0 %	407471919
34	NC_018662	T	6	6	39575	39580	0 %	100 %	0 %	0 %	407471920
35	NC_018662	T	7	7	39953	39959	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
36	NC_018662	T	6	6	40299	40304	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
37	NC_018662	T	6	6	40463	40468	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
38	NC_018662	T	7	7	40593	40599	0 %	100 %	0 %	0 %	407471921
39	NC_018662	A	6	6	41148	41153	100 %	0 %	0 %	0 %	407471922
40	NC_018662	A	7	7	42048	42054	100 %	0 %	0 %	0 %	407471922
41	NC_018662	C	6	6	43235	43240	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
42	NC_018662	T	6	6	43316	43321	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
43	NC_018662	C	6	6	43695	43700	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
44	NC_018662	C	6	6	43761	43766	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
45	NC_018662	T	6	6	43821	43826	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
46	NC_018662	T	8	8	44063	44070	0 %	100 %	0 %	0 %	407471925
47	NC_018662	G	6	6	44092	44097	0 %	0 %	100 %	0 %	407471925
48	NC_018662	C	9	9	44288	44296	0 %	0 %	0 %	100 %	407471925
49	NC_018662	T	6	6	53620	53625	0 %	100 %	0 %	0 %	407471930
50	NC_018662	A	6	6	56796	56801	100 %	0 %	0 %	0 %	407471933
51	NC_018662	T	6	6	58494	58499	0 %	100 %	0 %	0 %	407471935
52	NC_018662	T	6	6	59668	59673	0 %	100 %	0 %	0 %	407471938
53	NC_018662	A	7	7	59764	59770	100 %	0 %	0 %	0 %	407471939
54	NC_018662	T	8	8	59871	59878	0 %	100 %	0 %	0 %	407471939
55	NC_018662	T	7	7	60142	60148	0 %	100 %	0 %	0 %	407471939
56	NC_018662	A	6	6	60660	60665	100 %	0 %	0 %	0 %	407471939
57	NC_018662	A	6	6	61373	61378	100 %	0 %	0 %	0 %	407471940
58	NC_018662	A	6	6	61501	61506	100 %	0 %	0 %	0 %	407471940
59	NC_018662	A	6	6	61653	61658	100 %	0 %	0 %	0 %	407471940
60	NC_018662	T	7	7	62161	62167	0 %	100 %	0 %	0 %	407471942
61	NC_018662	T	6	6	65943	65948	0 %	100 %	0 %	0 %	407471949
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63	NC_018662	T	6	6	66319	66324	0 %	100 %	0 %	0 %	407471949
64	NC_018662	C	11	11	66594	66604	0 %	0 %	0 %	100 %	407471950
65	NC_018662	T	6	6	66931	66936	0 %	100 %	0 %	0 %	407471951
66	NC_018662	C	8	8	67694	67701	0 %	0 %	0 %	100 %	407471951
67	NC_018662	C	6	6	68887	68892	0 %	0 %	0 %	100 %	407471951
68	NC_018662	T	7	7	69079	69085	0 %	100 %	0 %	0 %	407471951
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77	NC_018662	T	8	8	74397	74404	0 %	100 %	0 %	0 %	407471960

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.