MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018661	ACATAA	2	12	24378	24389	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018661	GATAAA	2	12	149185	149196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018661	GAATAC	2	12	184940	184951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018661	AGGGGC	2	12	185312	185323	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018661	GTTCCC	2	12	185757	185768	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018661	TAAATA	2	12	211276	211287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018661	TCTCCC	2	12	252661	252672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018661	TGAAAT	2	12	264167	264178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018661	GCATCT	2	12	275054	275065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018661	TATTTC	2	12	275943	275954	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018661	CTGGAA	2	12	332591	332602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018661	GTTTTT	2	12	358946	358957	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018661	GAATGA	2	12	377024	377035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018661	TAAATT	2	12	414818	414829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018661	GTATCT	2	12	617087	617098	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018661	ATGCAG	2	12	635799	635810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018661	TTATAT	2	12	651908	651919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018661	ATAAAA	2	12	662674	662685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018661	AATGCA	2	12	664571	664582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018661	CGGTTA	2	12	676832	676843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018661	AGGGAG	2	12	708787	708798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018661	ATCATT	2	12	731399	731410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018661	AAAAAG	2	12	732234	732245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018661	TACAAC	2	12	736909	736920	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018661	GGGGTG	2	12	744700	744711	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018661	TTAAAT	2	12	811292	811303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018661	ACGAAA	2	12	824491	824502	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018661	GAGAAA	2	12	852728	852739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018661	TGACGG	2	12	852763	852774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018661	ATATAA	2	12	884562	884573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018661	ATGTTA	2	12	903827	903838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018661	CTTCAA	2	12	934187	934198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018661	CTCAGT	2	12	966892	966903	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018661	ACGCAG	2	12	980565	980576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018661	CCTCAC	2	12	1003114	1003125	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018661	AACAAA	2	12	1111476	1111487	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018661	TGATCT	2	12	1130554	1130565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018661	TCTTGT	2	12	1136250	1136261	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018661	AAAACC	2	12	1140581	1140592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018661	AAACCG	2	12	1154907	1154918	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018661	ATATCA	2	12	1247519	1247530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018661	TCTCCC	2	12	1271558	1271569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018661	GTAAAA	2	12	1282663	1282674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018661	AAACTG	2	12	1348992	1349003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018661	TGTCCA	2	12	1363596	1363607	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018661	TGCACT	2	12	1514035	1514046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018661	CATAAC	2	12	1531149	1531160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018661	CATCAG	2	12	1550191	1550202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018661	ATATTT	2	12	1566247	1566258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018661	GTTAAC	2	12	1568940	1568951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018661	GTTAAC	2	12	1569004	1569015	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018661	TTTTCT	2	12	1636501	1636512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018661	GTGACA	2	12	1646793	1646804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018661	CATTTA	2	12	1660427	1660438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018661	GGGTAA	2	12	1678292	1678303	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018661	TAGTGG	2	12	1709221	1709232	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018661	GGAAGA	2	12	1786890	1786901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018661	GTAAGG	2	12	1846432	1846443	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018661	GTAAGG	2	12	1847040	1847051	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018661	GTTCCG	2	12	1876539	1876550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018661	AGGGGG	2	12	1898209	1898220	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018661	ACAAAA	2	12	1928064	1928075	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018661	GCTGGG	2	12	1936682	1936693	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018661	CTGTGC	2	12	1983017	1983028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018661	TGTCTG	2	12	2016649	2016660	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018661	ATACAC	2	12	2084048	2084059	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018661	ATAAGA	2	12	2096130	2096141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018661	TGAATT	2	12	2109948	2109959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018661	ATCATT	2	12	2170937	2170948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018661	GACAGT	2	12	2209186	2209197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018661	ATGGTT	2	12	2252841	2252852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018661	AAAGAA	2	12	2256786	2256797	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018661	GTAATA	2	12	2276779	2276790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018661	CTGTTC	2	12	2346229	2346240	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018661	CTTTTT	2	12	2421704	2421715	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018661	AGTCTT	2	12	2430626	2430637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018661	AAAACA	2	12	2430886	2430897	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018661	TTATTT	2	12	2431518	2431529	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018661	TAAGTA	2	12	2445175	2445186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018661	CATCTT	2	12	2528076	2528087	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018661	AGTAAA	2	12	2548116	2548127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018661	GCTAAT	2	12	2562094	2562105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018661	ATTTAA	2	12	2594552	2594563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018661	CATAAC	2	12	2657203	2657214	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018661	TAACGG	2	12	2666034	2666045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018661	TATGAA	2	12	2669321	2669332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018661	ATTAAT	2	12	2680219	2680230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018661	GTTTTT	2	12	2680908	2680919	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018661	CATTAC	2	12	2688238	2688249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018661	AGTTAT	2	12	2850037	2850048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018661	GATCAG	2	12	2942437	2942448	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018661	ACCCCC	2	12	2944695	2944706	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
93	NC_018661	CTTTTG	2	12	2952915	2952926	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018661	CGCAGC	2	12	2972330	2972341	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018661	GGGTAT	2	12	2973996	2974007	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018661	AGCCTG	2	12	3011434	3011445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018661	TCGAGT	2	12	3011566	3011577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018661	AAGCGT	2	12	3011586	3011597	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018661	ACAAAA	2	12	3032224	3032235	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018661	CTTTTT	2	12	3045974	3045985	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018661	TTTTTG	2	12	3164012	3164023	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018661	AAATAA	2	12	3166101	3166112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018661	CGGCTG	2	12	3201388	3201399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018661	TCAGTG	2	12	3239088	3239099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018661	GAAACC	2	12	3242310	3242321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018661	ACAATA	2	12	3244042	3244053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018661	AGACAA	2	12	3250729	3250740	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018661	TGTGGT	2	12	3251133	3251144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018661	CCGAAT	2	12	3264393	3264404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018661	CATTAT	2	12	3401985	3401996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018661	TCCTTA	2	12	3403399	3403410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018661	TGGACA	2	12	3425666	3425677	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018661	ATCTTT	2	12	3446465	3446476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018661	CGGTTA	2	12	3512074	3512085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018661	TTTCTG	2	12	3603089	3603100	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018661	AACGCA	2	12	3678015	3678026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018661	AGGTAA	2	12	3756116	3756127	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018661	TATTTT	2	12	3771280	3771291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018661	CGTCCC	2	12	3786328	3786339	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018661	CGATAA	2	12	3853512	3853523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018661	ATTTGC	2	12	3863074	3863085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018661	CGCCTG	2	12	3974580	3974591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018661	TGAAAA	2	12	3993422	3993433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018661	ATTGTT	2	12	4060729	4060740	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018661	TATCAA	2	12	4081720	4081731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.