MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 1942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018661	ATCG	2	8	8533	8540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018661	TCAC	2	8	14370	14377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018661	TACT	2	8	16813	16820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018661	CTTA	2	8	17319	17326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018661	GGGA	2	8	30764	30771	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018661	TAAA	2	8	31349	31356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018661	CGGG	2	8	31814	31821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018661	ATGC	2	8	37453	37460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018661	TATG	2	8	46433	46440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018661	AATT	2	8	47864	47871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018661	AAAT	2	8	48433	48440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018661	ATTC	2	8	48476	48483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018661	ATGA	2	8	52437	52444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018661	CGAT	2	8	56941	56948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018661	CGAT	2	8	56954	56961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018661	ATCG	2	8	56971	56978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018661	TCTG	2	8	58042	58049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018661	TCAG	2	8	58953	58960	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018661	TTTA	2	8	59398	59405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018661	GACG	2	8	59626	59633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018661	GATA	2	8	59757	59764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018661	TTAT	2	8	60425	60432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018661	CCGT	2	8	61041	61048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018661	CTGC	2	8	61296	61303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018661	GTGA	2	8	63006	63013	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018661	TCCC	2	8	63678	63685	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_018661	TTGA	2	8	65475	65482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018661	CAAT	2	8	65540	65547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018661	CTGG	2	8	65724	65731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018661	GCGG	2	8	65785	65792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018661	CAGC	2	8	65877	65884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018661	GATT	2	8	74566	74573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018661	TAAC	2	8	86142	86149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018661	AAAT	2	8	86320	86327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018661	TCTG	2	8	103846	103853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018661	AAAG	2	8	104023	104030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018661	TCAA	2	8	104090	104097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018661	AAAG	2	8	104971	104978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018661	AAAT	2	8	111279	111286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018661	AGGA	2	8	114334	114341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018661	TGAT	2	8	114387	114394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018661	ATAA	2	8	125952	125959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018661	ATCA	2	8	127001	127008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018661	TTAT	2	8	127079	127086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018661	GCTG	2	8	134636	134643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018661	TACA	2	8	138637	138644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018661	AATG	2	8	142431	142438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018661	GAAA	2	8	148495	148502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018661	TTAA	2	8	148598	148605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018661	ATTA	2	8	149304	149311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018661	GAGT	2	8	156015	156022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018661	TAAA	2	8	156037	156044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018661	TCAT	2	8	156054	156061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018661	CTTA	2	8	156259	156266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018661	TTGC	2	8	156792	156799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018661	ACCT	2	8	157060	157067	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018661	TGTT	2	8	159998	160005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018661	TTCC	2	8	160008	160015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018661	TAAA	2	8	160056	160063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018661	ATTT	2	8	164326	164333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018661	ATTA	2	8	168364	168371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018661	AAAT	2	8	168379	168386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018661	TGTC	2	8	179048	179055	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018661	TGAT	2	8	180723	180730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018661	AAGG	2	8	183681	183688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018661	GTTT	2	8	183916	183923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018661	GGCG	2	8	183944	183951	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018661	GCTG	2	8	185413	185420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018661	ATCC	2	8	185482	185489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018661	TGGA	2	8	185538	185545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018661	AGGA	2	8	185825	185832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018661	ATTC	2	8	191176	191183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_018661	GCGA	2	8	192462	192469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018661	CGAT	2	8	193978	193985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018661	CCTG	2	8	195450	195457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018661	TAAT	3	12	195494	195505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018661	ATAA	2	8	197605	197612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018661	TCCA	2	8	197978	197985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018661	CCTT	2	8	198001	198008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018661	CAGA	2	8	201246	201253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018661	ATTT	2	8	201571	201578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018661	CGAT	2	8	201609	201616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018661	TATT	2	8	201617	201624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018661	GTAA	2	8	205511	205518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018661	TCAT	2	8	209816	209823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018661	AAAT	2	8	211168	211175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018661	AATT	2	8	211328	211335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018661	GTTT	2	8	217163	217170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018661	TTCG	2	8	218984	218991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018661	TGGC	2	8	219326	219333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018661	TTTG	2	8	219529	219536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018661	AGAA	2	8	226774	226781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018661	GCAA	2	8	230882	230889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018661	ATTA	2	8	231869	231876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018661	CTGG	2	8	250371	250378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018661	TAAA	2	8	254228	254235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018661	CAGC	2	8	257548	257555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018661	GGCT	2	8	257567	257574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018661	ATTG	2	8	259512	259519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018661	AAAT	2	8	261224	261231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018661	TGCT	2	8	262822	262829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018661	ATTT	2	8	262932	262939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018661	ATCA	2	8	262940	262947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018661	ATTA	2	8	262975	262982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018661	TAAG	2	8	271419	271426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018661	CTTT	2	8	271610	271617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018661	AATA	2	8	277194	277201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018661	ACTA	2	8	277653	277660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018661	CAGA	2	8	278793	278800	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018661	CTGG	2	8	281581	281588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018661	CTGG	2	8	281812	281819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018661	GTAA	2	8	284535	284542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018661	CTAT	2	8	290050	290057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018661	TACT	2	8	293582	293589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018661	GTTT	2	8	302662	302669	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018661	ATCT	2	8	304018	304025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018661	AACC	2	8	304179	304186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018661	AGTT	2	8	304190	304197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018661	GGCT	2	8	309700	309707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018661	ATTT	2	8	311265	311272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018661	TAAA	2	8	324036	324043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018661	ATTG	2	8	327670	327677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018661	GGAA	2	8	328611	328618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018661	ATAA	2	8	330015	330022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018661	GGAT	2	8	330080	330087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018661	TTAA	2	8	331364	331371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018661	GGCA	2	8	332142	332149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018661	TTTA	2	8	332518	332525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018661	CGAT	2	8	333014	333021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018661	TAAT	2	8	333376	333383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018661	GCAT	2	8	333616	333623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018661	GGAT	2	8	333857	333864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018661	GAAA	2	8	339119	339126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018661	AAGG	2	8	339226	339233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018661	GCGT	2	8	339329	339336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018661	ATCT	2	8	339768	339775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018661	TCAT	2	8	348914	348921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018661	TACG	2	8	349659	349666	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018661	TATC	2	8	361089	361096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018661	GCGG	2	8	362416	362423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018661	TTGA	2	8	366129	366136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018661	TAAA	2	8	374319	374326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018661	TTAT	2	8	376264	376271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018661	AAAT	2	8	376365	376372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018661	AAGG	2	8	376379	376386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018661	AGCC	2	8	377117	377124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018661	GCCT	2	8	379135	379142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018661	CTCG	2	8	379156	379163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018661	ATCT	2	8	379311	379318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018661	GGAT	2	8	380377	380384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018661	TTGT	2	8	399390	399397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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