MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	TTCCGG	2	12	2278	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484677
2	NC_018659	AGTGTC	2	12	8392	8403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407484686
3	NC_018659	GGAAAA	2	12	15574	15585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484691
4	NC_018659	TTCGTC	2	12	25232	25243	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407484702
5	NC_018659	CGTAGT	2	12	28898	28909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407484705
6	NC_018659	GTGAAA	2	12	37228	37239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407484713
7	NC_018659	ATGCTC	2	12	41080	41091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407484716
8	NC_018659	CCAGCG	2	12	44106	44117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	407484717
9	NC_018659	CCGCGG	2	12	45797	45808	0 %	0 %	50 %	50 %	407484719
10	NC_018659	ATCAAT	2	12	47166	47177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407484721
11	NC_018659	TTGAAG	2	12	47257	47268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484721
12	NC_018659	GGCGCT	2	12	60692	60703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407484740
13	NC_018659	CAGGTG	2	12	60723	60734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407484740
14	NC_018659	GCCGGA	2	12	61064	61075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	407484740
15	NC_018659	GATATC	2	12	74706	74717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407484755
16	NC_018659	TATCAA	2	12	81859	81870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407484765

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.