MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	CAGA	2	8	75	82	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018659	CCGC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_018659	CAGG	2	8	688	695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018659	TCTG	2	8	729	736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018659	GCCA	2	8	984	991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018659	CTGT	2	8	1355	1362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018659	ATCA	2	8	1566	1573	50 %	25 %	0 %	25 %	407484677
8	NC_018659	ATGA	2	8	1589	1596	50 %	25 %	25 %	0 %	407484677
9	NC_018659	TGGA	2	8	1833	1840	25 %	25 %	50 %	0 %	407484677
10	NC_018659	CAGA	2	8	2031	2038	50 %	0 %	25 %	25 %	407484677
11	NC_018659	GATA	2	8	2690	2697	50 %	25 %	25 %	0 %	407484679
12	NC_018659	CCAG	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	407484679
13	NC_018659	TGAT	2	8	2797	2804	25 %	50 %	25 %	0 %	407484679
14	NC_018659	CGAT	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	407484680
15	NC_018659	TGGT	2	8	5110	5117	0 %	50 %	50 %	0 %	407484682
16	NC_018659	TTTC	2	8	5540	5547	0 %	75 %	0 %	25 %	407484682
17	NC_018659	GAAC	2	8	5720	5727	50 %	0 %	25 %	25 %	407484683
18	NC_018659	TGGT	2	8	5889	5896	0 %	50 %	50 %	0 %	407484683
19	NC_018659	GCAG	2	8	6380	6387	25 %	0 %	50 %	25 %	407484683
20	NC_018659	GTGC	2	8	6476	6483	0 %	25 %	50 %	25 %	407484683
21	NC_018659	GCTG	2	8	6999	7006	0 %	25 %	50 %	25 %	407484684
22	NC_018659	TTCA	2	8	7309	7316	25 %	50 %	0 %	25 %	407484685
23	NC_018659	GACA	2	8	7418	7425	50 %	0 %	25 %	25 %	407484685
24	NC_018659	CGCT	2	8	7486	7493	0 %	25 %	25 %	50 %	407484685
25	NC_018659	CCTG	2	8	7673	7680	0 %	25 %	25 %	50 %	407484686
26	NC_018659	TCTG	2	8	9069	9076	0 %	50 %	25 %	25 %	407484686
27	NC_018659	AGGA	2	8	9519	9526	50 %	0 %	50 %	0 %	407484686
28	NC_018659	TTTG	2	8	9608	9615	0 %	75 %	25 %	0 %	407484686
29	NC_018659	ATTC	2	8	9683	9690	25 %	50 %	0 %	25 %	407484686
30	NC_018659	TCTG	2	8	10954	10961	0 %	50 %	25 %	25 %	407484686
31	NC_018659	CAGC	2	8	11220	11227	25 %	0 %	25 %	50 %	407484686
32	NC_018659	CGGG	2	8	11253	11260	0 %	0 %	75 %	25 %	407484686
33	NC_018659	GATG	2	8	11665	11672	25 %	25 %	50 %	0 %	407484687
34	NC_018659	GCAT	2	8	11811	11818	25 %	25 %	25 %	25 %	407484687
35	NC_018659	CTTC	2	8	11904	11911	0 %	50 %	0 %	50 %	407484687
36	NC_018659	TGCC	2	8	12719	12726	0 %	25 %	25 %	50 %	407484688
37	NC_018659	TGCC	2	8	13235	13242	0 %	25 %	25 %	50 %	407484688
38	NC_018659	CCGA	2	8	13263	13270	25 %	0 %	25 %	50 %	407484688
39	NC_018659	TGGT	2	8	13301	13308	0 %	50 %	50 %	0 %	407484688
40	NC_018659	CTTC	2	8	13740	13747	0 %	50 %	0 %	50 %	407484689
41	NC_018659	AGCC	2	8	13989	13996	25 %	0 %	25 %	50 %	407484689
42	NC_018659	GTTC	2	8	14493	14500	0 %	50 %	25 %	25 %	407484690
43	NC_018659	CAGC	2	8	14702	14709	25 %	0 %	25 %	50 %	407484690
44	NC_018659	ACAG	2	8	14804	14811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018659	GTTT	2	8	14818	14825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018659	AAAT	2	8	14848	14855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018659	CTGG	2	8	14912	14919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018659	GATT	2	8	15323	15330	25 %	50 %	25 %	0 %	407484691
49	NC_018659	GAAT	2	8	15691	15698	50 %	25 %	25 %	0 %	407484691
50	NC_018659	ACCT	2	8	16603	16610	25 %	25 %	0 %	50 %	407484692
51	NC_018659	CAAA	2	8	16704	16711	75 %	0 %	0 %	25 %	407484692
52	NC_018659	ATTT	2	8	17285	17292	25 %	75 %	0 %	0 %	407484693
53	NC_018659	GTGA	2	8	18658	18665	25 %	25 %	50 %	0 %	407484694
54	NC_018659	AACG	2	8	19018	19025	50 %	0 %	25 %	25 %	407484694
55	NC_018659	TGTA	2	8	19030	19037	25 %	50 %	25 %	0 %	407484694
56	NC_018659	CAGT	2	8	19364	19371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018659	CGGT	2	8	19600	19607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018659	AATT	2	8	19624	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018659	TTAA	2	8	19815	19822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018659	CTTG	2	8	20337	20344	0 %	50 %	25 %	25 %	407484695
61	NC_018659	CGCA	2	8	20405	20412	25 %	0 %	25 %	50 %	407484696
62	NC_018659	ATAA	2	8	21081	21088	75 %	25 %	0 %	0 %	407484697
63	NC_018659	AGCC	2	8	21424	21431	25 %	0 %	25 %	50 %	407484697
64	NC_018659	AACC	2	8	21451	21458	50 %	0 %	0 %	50 %	407484697
65	NC_018659	CAAT	2	8	22211	22218	50 %	25 %	0 %	25 %	407484697
66	NC_018659	CAGA	2	8	22517	22524	50 %	0 %	25 %	25 %	407484698
67	NC_018659	TAAT	2	8	22732	22739	50 %	50 %	0 %	0 %	407484698
68	NC_018659	TGTC	2	8	23012	23019	0 %	50 %	25 %	25 %	407484699
69	NC_018659	TTAT	2	8	23246	23253	25 %	75 %	0 %	0 %	407484699
70	NC_018659	TTTG	2	8	23373	23380	0 %	75 %	25 %	0 %	407484699
71	NC_018659	CGGG	2	8	23399	23406	0 %	0 %	75 %	25 %	407484699
72	NC_018659	ATAA	2	8	23407	23414	75 %	25 %	0 %	0 %	407484699
73	NC_018659	GTTT	2	8	23502	23509	0 %	75 %	25 %	0 %	407484700
74	NC_018659	GTTA	2	8	23605	23612	25 %	50 %	25 %	0 %	407484700
75	NC_018659	TTTC	2	8	24042	24049	0 %	75 %	0 %	25 %	407484700
76	NC_018659	TTTA	2	8	24105	24112	25 %	75 %	0 %	0 %	407484701
77	NC_018659	AGCC	2	8	24365	24372	25 %	0 %	25 %	50 %	407484701
78	NC_018659	ACAA	2	8	24657	24664	75 %	0 %	0 %	25 %	407484701
79	NC_018659	CATG	2	8	25327	25334	25 %	25 %	25 %	25 %	407484702
80	NC_018659	GCTG	2	8	25657	25664	0 %	25 %	50 %	25 %	407484702
81	NC_018659	TGTA	2	8	25754	25761	25 %	50 %	25 %	0 %	407484702
82	NC_018659	GGCA	2	8	26023	26030	25 %	0 %	50 %	25 %	407484702
83	NC_018659	CAGA	2	8	26068	26075	50 %	0 %	25 %	25 %	407484702
84	NC_018659	ATGG	2	8	27190	27197	25 %	25 %	50 %	0 %	407484703
85	NC_018659	TCGT	2	8	27646	27653	0 %	50 %	25 %	25 %	407484704
86	NC_018659	GGCA	2	8	27931	27938	25 %	0 %	50 %	25 %	407484704
87	NC_018659	CAGA	2	8	28777	28784	50 %	0 %	25 %	25 %	407484705
88	NC_018659	TCAG	2	8	29574	29581	25 %	25 %	25 %	25 %	407484705
89	NC_018659	TGTT	2	8	29930	29937	0 %	75 %	25 %	0 %	407484705
90	NC_018659	TGCC	2	8	30227	30234	0 %	25 %	25 %	50 %	407484706
91	NC_018659	TGCC	2	8	30889	30896	0 %	25 %	25 %	50 %	407484707
92	NC_018659	ACTG	2	8	31339	31346	25 %	25 %	25 %	25 %	407484707
93	NC_018659	GTTA	2	8	31732	31739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018659	TAAG	2	8	31750	31757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018659	TCCG	2	8	32073	32080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018659	TTTA	2	8	32214	32221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018659	AGGC	2	8	32630	32637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018659	AGAA	2	8	33092	33099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018659	GGCC	2	8	33923	33930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018659	TTTC	2	8	33971	33978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018659	TCTT	2	8	34507	34514	0 %	75 %	0 %	25 %	407484710
102	NC_018659	AACG	2	8	35126	35133	50 %	0 %	25 %	25 %	407484711
103	NC_018659	AGGT	2	8	35202	35209	25 %	25 %	50 %	0 %	407484711
104	NC_018659	TGCC	2	8	35484	35491	0 %	25 %	25 %	50 %	407484712
105	NC_018659	TCTT	2	8	36381	36388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018659	AACG	2	8	36850	36857	50 %	0 %	25 %	25 %	407484713
107	NC_018659	TCCG	2	8	36880	36887	0 %	25 %	25 %	50 %	407484713
108	NC_018659	CTGC	2	8	37398	37405	0 %	25 %	25 %	50 %	407484713
109	NC_018659	GCTG	2	8	37532	37539	0 %	25 %	50 %	25 %	407484713
110	NC_018659	CAAA	2	8	37740	37747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018659	AATA	2	8	37865	37872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018659	GGGA	2	8	39562	39569	25 %	0 %	75 %	0 %	407484715
113	NC_018659	CTGG	2	8	39603	39610	0 %	25 %	50 %	25 %	407484715
114	NC_018659	GGCT	2	8	39803	39810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018659	ATAA	2	8	40009	40016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018659	TACT	2	8	40106	40113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018659	AAAG	2	8	41179	41186	75 %	0 %	25 %	0 %	407484716
118	NC_018659	CTGC	2	8	42162	42169	0 %	25 %	25 %	50 %	407484717
119	NC_018659	AGTC	2	8	42418	42425	25 %	25 %	25 %	25 %	407484717
120	NC_018659	ATTG	2	8	42883	42890	25 %	50 %	25 %	0 %	407484717
121	NC_018659	GGAG	2	8	43244	43251	25 %	0 %	75 %	0 %	407484717
122	NC_018659	CTGT	2	8	43390	43397	0 %	50 %	25 %	25 %	407484717
123	NC_018659	TGCC	2	8	43486	43493	0 %	25 %	25 %	50 %	407484717
124	NC_018659	CAGC	2	8	43893	43900	25 %	0 %	25 %	50 %	407484717
125	NC_018659	AGCG	2	8	44018	44025	25 %	0 %	50 %	25 %	407484717
126	NC_018659	CGTT	2	8	44567	44574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018659	GGAA	2	8	44764	44771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018659	AAGT	2	8	45247	45254	50 %	25 %	25 %	0 %	407484719
129	NC_018659	GCAG	2	8	45355	45362	25 %	0 %	50 %	25 %	407484719
130	NC_018659	ATAC	2	8	46397	46404	50 %	25 %	0 %	25 %	407484721
131	NC_018659	CTGT	2	8	46428	46435	0 %	50 %	25 %	25 %	407484721
132	NC_018659	CTTT	2	8	46699	46706	0 %	75 %	0 %	25 %	407484721
133	NC_018659	TTAA	2	8	46864	46871	50 %	50 %	0 %	0 %	407484721
134	NC_018659	TTTC	2	8	47652	47659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018659	CCTG	2	8	47971	47978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018659	ACTT	2	8	49265	49272	25 %	50 %	0 %	25 %	407484724
137	NC_018659	TGAA	2	8	49364	49371	50 %	25 %	25 %	0 %	407484724
138	NC_018659	TGGA	2	8	49486	49493	25 %	25 %	50 %	0 %	407484724
139	NC_018659	GGCT	2	8	49536	49543	0 %	25 %	50 %	25 %	407484724
140	NC_018659	GATT	2	8	49758	49765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018659	AACA	2	8	50476	50483	75 %	0 %	0 %	25 %	407484726
142	NC_018659	TACC	2	8	50880	50887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018659	ATTA	2	8	51037	51044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018659	CAGC	2	8	51347	51354	25 %	0 %	25 %	50 %	407484727
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.