MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	CAGA	2	8	75	82	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018659	CCGC	2	8	564	571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_018659	CAGG	2	8	688	695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018659	TCTG	2	8	729	736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018659	GCCA	2	8	984	991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018659	CTGT	2	8	1355	1362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018659	ACAG	2	8	14804	14811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018659	GTTT	2	8	14818	14825	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018659	AAAT	2	8	14848	14855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018659	CTGG	2	8	14912	14919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018659	CAGT	2	8	19364	19371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018659	CGGT	2	8	19600	19607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018659	AATT	2	8	19624	19631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018659	TTAA	2	8	19815	19822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018659	GTTA	2	8	31732	31739	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018659	TAAG	2	8	31750	31757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018659	TCCG	2	8	32073	32080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018659	TTTA	2	8	32214	32221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018659	AGGC	2	8	32630	32637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018659	AGAA	2	8	33092	33099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018659	GGCC	2	8	33923	33930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018659	TTTC	2	8	33971	33978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018659	TCTT	2	8	36381	36388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018659	CAAA	2	8	37740	37747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018659	AATA	2	8	37865	37872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018659	GGCT	2	8	39803	39810	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018659	ATAA	2	8	40009	40016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018659	TACT	2	8	40106	40113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018659	CGTT	2	8	44567	44574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018659	GGAA	2	8	44764	44771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018659	TTTC	2	8	47652	47659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018659	CCTG	2	8	47971	47978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018659	GATT	2	8	49758	49765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018659	TACC	2	8	50880	50887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018659	ATTA	2	8	51037	51044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018659	CGGG	2	8	54411	54418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018659	ACGG	2	8	57800	57807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018659	TCAG	2	8	59205	59212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018659	TCGT	2	8	64150	64157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018659	GCCT	2	8	64882	64889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018659	CTAT	2	8	66054	66061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018659	TTCA	2	8	66484	66491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018659	ATAA	2	8	68434	68441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018659	TACA	2	8	68699	68706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018659	ATTT	2	8	78159	78166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018659	ATCA	2	8	78319	78326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018659	GTTG	2	8	79584	79591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018659	ATCA	2	8	79740	79747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018659	TGGT	2	8	80376	80383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018659	GTGG	2	8	80500	80507	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018659	TTTA	2	8	81544	81551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018659	CAAA	2	8	81577	81584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018659	GCCC	2	8	87049	87056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_018659	GCCT	2	8	87708	87715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.