MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	TCT	2	6	39	44	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018659	TGT	2	6	206	211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018659	GTG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018659	ATG	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018659	GCC	2	6	345	350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018659	GCT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018659	TTC	2	6	417	422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018659	CCG	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018659	GTA	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018659	CTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018659	ACG	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018659	TCT	2	6	917	922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018659	TCA	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018659	CAA	2	6	1396	1401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018659	AGG	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018659	GAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018659	CCT	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018659	CCG	2	6	11429	11434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018659	GTG	2	6	12072	12077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018659	TGG	2	6	12086	12091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018659	ACC	2	6	12096	12101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018659	ATG	2	6	12203	12208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018659	GTT	2	6	12227	12232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018659	GAT	2	6	14812	14817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018659	ATT	2	6	14899	14904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018659	GTC	2	6	14927	14932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018659	ATG	2	6	14986	14991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018659	CGA	2	6	14999	15004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018659	AAC	2	6	17026	17031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018659	TCC	2	6	17909	17914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018659	AAT	2	6	17978	17983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018659	GTT	2	6	18015	18020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018659	ATG	2	6	18049	18054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018659	CAA	2	6	19241	19246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018659	GTA	2	6	19297	19302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018659	ATG	2	6	19447	19452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018659	ATG	2	6	19480	19485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018659	GTC	2	6	19542	19547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018659	GCT	2	6	19578	19583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018659	TAA	2	6	19618	19623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018659	ATC	2	6	19654	19659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018659	CGG	2	6	19681	19686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018659	GTG	2	6	19692	19697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018659	TGA	2	6	19780	19785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018659	CCA	2	6	19865	19870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018659	GTT	2	6	19912	19917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018659	ACC	2	6	19942	19947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018659	TGT	2	6	20025	20030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018659	ATC	3	9	20113	20121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018659	CCA	2	6	20681	20686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_018659	ACT	2	6	20750	20755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018659	CAG	2	6	20774	20779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018659	CGT	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018659	ATT	2	6	31763	31768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018659	TTG	2	6	31868	31873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018659	ATT	2	6	31886	31891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018659	GAC	2	6	32061	32066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018659	TAA	2	6	32168	32173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018659	TCA	2	6	32263	32268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018659	TTA	2	6	32269	32274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018659	TCT	2	6	32387	32392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018659	AAG	2	6	32436	32441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018659	AGT	2	6	32455	32460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018659	ACC	2	6	32479	32484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018659	TTA	2	6	32608	32613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018659	AGG	2	6	32656	32661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018659	ATC	2	6	32704	32709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018659	AGT	2	6	33083	33088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018659	AGA	2	6	33881	33886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018659	TGG	2	6	34024	34029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018659	ATG	2	6	34673	34678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018659	CAG	2	6	34776	34781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018659	AAT	2	6	34945	34950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018659	TTA	2	6	34977	34982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018659	GAA	2	6	35568	35573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018659	CGA	2	6	35588	35593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018659	ATG	2	6	35739	35744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018659	TGT	2	6	35861	35866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018659	TAT	2	6	35900	35905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018659	ATT	2	6	35993	35998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018659	AAG	2	6	36065	36070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018659	GAG	2	6	36154	36159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018659	TTA	2	6	36226	36231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018659	GCG	2	6	36264	36269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018659	AGA	2	6	36334	36339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018659	ACG	2	6	36403	36408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018659	ATC	2	6	37581	37586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018659	TCA	2	6	37695	37700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018659	GTT	2	6	37713	37718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018659	AAG	2	6	37755	37760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018659	ATT	2	6	37804	37809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018659	CGC	2	6	37828	37833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018659	GCA	2	6	38014	38019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018659	GCC	2	6	38051	38056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018659	AAC	2	6	38074	38079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018659	TGT	2	6	38098	38103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018659	ATC	2	6	38113	38118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018659	TCT	2	6	38127	38132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018659	TCC	2	6	38142	38147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018659	CGG	2	6	38336	38341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018659	GCC	2	6	38374	38379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018659	CGT	2	6	38528	38533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018659	TTA	2	6	38612	38617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018659	TAA	2	6	39823	39828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018659	TAA	2	6	39879	39884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018659	GTA	2	6	39913	39918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018659	TGT	2	6	39997	40002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018659	AGA	3	9	40041	40049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018659	TGT	2	6	41537	41542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018659	TGC	2	6	41593	41598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018659	CAG	2	6	41607	41612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018659	TAA	2	6	41689	41694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018659	AAT	2	6	44512	44517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018659	CGG	2	6	44678	44683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018659	AAC	3	9	46073	46081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018659	GAA	2	6	46141	46146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018659	ATT	2	6	46174	46179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018659	ACC	2	6	46184	46189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018659	TAC	2	6	47578	47583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018659	TAT	2	6	47593	47598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018659	TAA	2	6	48078	48083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018659	ATA	2	6	48712	48717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018659	AAT	2	6	48842	48847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018659	TAT	2	6	50911	50916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018659	ATT	2	6	50984	50989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018659	GTT	2	6	51014	51019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018659	ACA	2	6	51055	51060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018659	TAA	2	6	53122	53127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018659	TTG	2	6	53154	53159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018659	CTG	2	6	53202	53207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018659	GCT	2	6	53211	53216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018659	CCT	2	6	53335	53340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018659	TCG	2	6	53355	53360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018659	TCC	3	9	53362	53370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018659	GAG	2	6	53458	53463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018659	CTC	2	6	54458	54463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018659	TGA	2	6	54603	54608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018659	GAC	2	6	54653	54658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018659	CAC	2	6	54732	54737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018659	GTT	2	6	54776	54781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.