MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	TG	3	6	588	593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018659	AG	3	6	1286	1291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018659	AG	3	6	1747	1752	50 %	0 %	50 %	0 %	407484677
4	NC_018659	GT	3	6	2169	2174	0 %	50 %	50 %	0 %	407484677
5	NC_018659	AT	3	6	3025	3030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018659	TG	3	6	4060	4065	0 %	50 %	50 %	0 %	407484681
7	NC_018659	AT	3	6	4959	4964	50 %	50 %	0 %	0 %	407484682
8	NC_018659	AG	3	6	6227	6232	50 %	0 %	50 %	0 %	407484683
9	NC_018659	GA	3	6	7648	7653	50 %	0 %	50 %	0 %	407484686
10	NC_018659	CT	3	6	8560	8565	0 %	50 %	0 %	50 %	407484686
11	NC_018659	TG	3	6	8695	8700	0 %	50 %	50 %	0 %	407484686
12	NC_018659	GA	3	6	11605	11610	50 %	0 %	50 %	0 %	407484687
13	NC_018659	AT	3	6	11715	11720	50 %	50 %	0 %	0 %	407484687
14	NC_018659	AT	3	6	12526	12531	50 %	50 %	0 %	0 %	407484688
15	NC_018659	AT	3	6	12886	12891	50 %	50 %	0 %	0 %	407484688
16	NC_018659	GA	3	6	14279	14284	50 %	0 %	50 %	0 %	407484689
17	NC_018659	AC	3	6	14598	14603	50 %	0 %	0 %	50 %	407484690
18	NC_018659	GA	3	6	15882	15887	50 %	0 %	50 %	0 %	407484692
19	NC_018659	AT	3	6	17270	17275	50 %	50 %	0 %	0 %	407484693
20	NC_018659	TG	3	6	18537	18542	0 %	50 %	50 %	0 %	407484694
21	NC_018659	AC	3	6	20169	20174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018659	AC	3	6	20304	20309	50 %	0 %	0 %	50 %	407484695
23	NC_018659	GT	3	6	20829	20834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018659	AT	3	6	21826	21831	50 %	50 %	0 %	0 %	407484697
25	NC_018659	TA	3	6	22095	22100	50 %	50 %	0 %	0 %	407484697
26	NC_018659	AC	3	6	22411	22416	50 %	0 %	0 %	50 %	407484698
27	NC_018659	TA	3	6	22429	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	407484698
28	NC_018659	GT	4	8	22782	22789	0 %	50 %	50 %	0 %	407484698
29	NC_018659	GA	3	6	22896	22901	50 %	0 %	50 %	0 %	407484698
30	NC_018659	CT	3	6	22999	23004	0 %	50 %	0 %	50 %	407484699
31	NC_018659	TG	3	6	23630	23635	0 %	50 %	50 %	0 %	407484700
32	NC_018659	AG	3	6	24951	24956	50 %	0 %	50 %	0 %	407484701
33	NC_018659	GC	3	6	26276	26281	0 %	0 %	50 %	50 %	407484702
34	NC_018659	GA	3	6	26490	26495	50 %	0 %	50 %	0 %	407484702
35	NC_018659	TC	3	6	29890	29895	0 %	50 %	0 %	50 %	407484705
36	NC_018659	CT	3	6	29942	29947	0 %	50 %	0 %	50 %	407484705
37	NC_018659	AT	3	6	30184	30189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018659	TA	3	6	31719	31724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018659	GA	3	6	31805	31810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018659	AT	3	6	32115	32120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018659	GT	3	6	32336	32341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018659	AC	3	6	32710	32715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018659	TC	3	6	33898	33903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018659	AT	3	6	34920	34925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018659	GA	3	6	36306	36311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018659	CA	3	6	36947	36952	50 %	0 %	0 %	50 %	407484713
47	NC_018659	GC	3	6	37376	37381	0 %	0 %	50 %	50 %	407484713
48	NC_018659	CG	3	6	37941	37946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018659	TA	3	6	38427	38432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018659	AT	3	6	38442	38447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018659	TA	3	6	39005	39010	50 %	50 %	0 %	0 %	407484714
52	NC_018659	TA	3	6	39054	39059	50 %	50 %	0 %	0 %	407484714
53	NC_018659	AT	3	6	39978	39983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018659	TC	3	6	39984	39989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018659	TA	3	6	44592	44597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018659	GT	3	6	46104	46109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018659	CA	3	6	46161	46166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018659	TA	3	6	46609	46614	50 %	50 %	0 %	0 %	407484721
59	NC_018659	AT	3	6	47605	47610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018659	AT	3	6	49746	49751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018659	TG	3	6	51442	51447	0 %	50 %	50 %	0 %	407484727
62	NC_018659	GA	3	6	52049	52054	50 %	0 %	50 %	0 %	407484727
63	NC_018659	GC	3	6	52275	52280	0 %	0 %	50 %	50 %	407484727
64	NC_018659	CA	3	6	52284	52289	50 %	0 %	0 %	50 %	407484727
65	NC_018659	GC	3	6	52653	52658	0 %	0 %	50 %	50 %	407484728
66	NC_018659	CA	3	6	53137	53142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018659	GT	3	6	53186	53191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018659	GT	3	6	53317	53322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018659	AC	3	6	53726	53731	50 %	0 %	0 %	50 %	407484730
70	NC_018659	TG	3	6	53931	53936	0 %	50 %	50 %	0 %	407484730
71	NC_018659	CA	3	6	55261	55266	50 %	0 %	0 %	50 %	407484731
72	NC_018659	GC	3	6	55492	55497	0 %	0 %	50 %	50 %	407484732
73	NC_018659	GC	3	6	55857	55862	0 %	0 %	50 %	50 %	407484733
74	NC_018659	TC	3	6	57418	57423	0 %	50 %	0 %	50 %	407484735
75	NC_018659	GC	3	6	58076	58081	0 %	0 %	50 %	50 %	407484736
76	NC_018659	CG	3	6	58487	58492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018659	GT	3	6	58863	58868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018659	GC	3	6	59445	59450	0 %	0 %	50 %	50 %	407484738
79	NC_018659	AG	3	6	60040	60045	50 %	0 %	50 %	0 %	407484739
80	NC_018659	CG	3	6	60054	60059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018659	TC	3	6	62359	62364	0 %	50 %	0 %	50 %	407484741
82	NC_018659	TG	3	6	63784	63789	0 %	50 %	50 %	0 %	407484743
83	NC_018659	GT	3	6	65207	65212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018659	CT	3	6	66007	66012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018659	CG	3	6	66308	66313	0 %	0 %	50 %	50 %	407484746
86	NC_018659	CA	3	6	68117	68122	50 %	0 %	0 %	50 %	407484750
87	NC_018659	GT	3	6	68607	68612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018659	GA	3	6	68736	68741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018659	GC	3	6	69088	69093	0 %	0 %	50 %	50 %	407484751
90	NC_018659	TC	3	6	70007	70012	0 %	50 %	0 %	50 %	407484752
91	NC_018659	TC	3	6	70226	70231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018659	TC	3	6	70518	70523	0 %	50 %	0 %	50 %	407484753
93	NC_018659	TC	3	6	71226	71231	0 %	50 %	0 %	50 %	407484754
94	NC_018659	CA	3	6	72302	72307	50 %	0 %	0 %	50 %	407484754
95	NC_018659	CA	3	6	72745	72750	50 %	0 %	0 %	50 %	407484754
96	NC_018659	GA	3	6	74788	74793	50 %	0 %	50 %	0 %	407484755
97	NC_018659	CA	3	6	75006	75011	50 %	0 %	0 %	50 %	407484755
98	NC_018659	CA	3	6	76098	76103	50 %	0 %	0 %	50 %	407484756
99	NC_018659	AG	3	6	76535	76540	50 %	0 %	50 %	0 %	407484756
100	NC_018659	CT	3	6	77322	77327	0 %	50 %	0 %	50 %	407484757
101	NC_018659	TG	3	6	77721	77726	0 %	50 %	50 %	0 %	407484757
102	NC_018659	TA	3	6	79238	79243	50 %	50 %	0 %	0 %	407484758
103	NC_018659	TG	3	6	79257	79262	0 %	50 %	50 %	0 %	407484758
104	NC_018659	TG	3	6	79863	79868	0 %	50 %	50 %	0 %	407484759
105	NC_018659	TC	3	6	80307	80312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018659	AT	3	6	81254	81259	50 %	50 %	0 %	0 %	407484763
107	NC_018659	TG	3	6	81812	81817	0 %	50 %	50 %	0 %	407484765
108	NC_018659	AT	3	6	81909	81914	50 %	50 %	0 %	0 %	407484765
109	NC_018659	TA	3	6	82241	82246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018659	TC	3	6	82278	82283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018659	AT	3	6	82303	82308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018659	AT	4	8	82727	82734	50 %	50 %	0 %	0 %	407484766
113	NC_018659	CT	3	6	83563	83568	0 %	50 %	0 %	50 %	407484766
114	NC_018659	CA	3	6	84521	84526	50 %	0 %	0 %	50 %	407484766
115	NC_018659	AT	3	6	85465	85470	50 %	50 %	0 %	0 %	407484768
116	NC_018659	GT	3	6	85778	85783	0 %	50 %	50 %	0 %	407484768
117	NC_018659	AG	3	6	87390	87395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018659	AG	3	6	88227	88232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018659	CA	3	6	88233	88238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.