MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 plasmid pESBL-EA11

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018659	AG	3	6	1747	1752	50 %	0 %	50 %	0 %	407484677
2	NC_018659	GT	3	6	2169	2174	0 %	50 %	50 %	0 %	407484677
3	NC_018659	TG	3	6	4060	4065	0 %	50 %	50 %	0 %	407484681
4	NC_018659	AT	3	6	4959	4964	50 %	50 %	0 %	0 %	407484682
5	NC_018659	AG	3	6	6227	6232	50 %	0 %	50 %	0 %	407484683
6	NC_018659	GA	3	6	7648	7653	50 %	0 %	50 %	0 %	407484686
7	NC_018659	CT	3	6	8560	8565	0 %	50 %	0 %	50 %	407484686
8	NC_018659	TG	3	6	8695	8700	0 %	50 %	50 %	0 %	407484686
9	NC_018659	GA	3	6	11605	11610	50 %	0 %	50 %	0 %	407484687
10	NC_018659	AT	3	6	11715	11720	50 %	50 %	0 %	0 %	407484687
11	NC_018659	AT	3	6	12526	12531	50 %	50 %	0 %	0 %	407484688
12	NC_018659	AT	3	6	12886	12891	50 %	50 %	0 %	0 %	407484688
13	NC_018659	GA	3	6	14279	14284	50 %	0 %	50 %	0 %	407484689
14	NC_018659	AC	3	6	14598	14603	50 %	0 %	0 %	50 %	407484690
15	NC_018659	GA	3	6	15882	15887	50 %	0 %	50 %	0 %	407484692
16	NC_018659	AT	3	6	17270	17275	50 %	50 %	0 %	0 %	407484693
17	NC_018659	TG	3	6	18537	18542	0 %	50 %	50 %	0 %	407484694
18	NC_018659	AC	3	6	20304	20309	50 %	0 %	0 %	50 %	407484695
19	NC_018659	AT	3	6	21826	21831	50 %	50 %	0 %	0 %	407484697
20	NC_018659	TA	3	6	22095	22100	50 %	50 %	0 %	0 %	407484697
21	NC_018659	AC	3	6	22411	22416	50 %	0 %	0 %	50 %	407484698
22	NC_018659	TA	3	6	22429	22434	50 %	50 %	0 %	0 %	407484698
23	NC_018659	GT	4	8	22782	22789	0 %	50 %	50 %	0 %	407484698
24	NC_018659	GA	3	6	22896	22901	50 %	0 %	50 %	0 %	407484698
25	NC_018659	CT	3	6	22999	23004	0 %	50 %	0 %	50 %	407484699
26	NC_018659	TG	3	6	23630	23635	0 %	50 %	50 %	0 %	407484700
27	NC_018659	AG	3	6	24951	24956	50 %	0 %	50 %	0 %	407484701
28	NC_018659	GC	3	6	26276	26281	0 %	0 %	50 %	50 %	407484702
29	NC_018659	GA	3	6	26490	26495	50 %	0 %	50 %	0 %	407484702
30	NC_018659	TC	3	6	29890	29895	0 %	50 %	0 %	50 %	407484705
31	NC_018659	CT	3	6	29942	29947	0 %	50 %	0 %	50 %	407484705
32	NC_018659	CA	3	6	36947	36952	50 %	0 %	0 %	50 %	407484713
33	NC_018659	GC	3	6	37376	37381	0 %	0 %	50 %	50 %	407484713
34	NC_018659	TA	3	6	39005	39010	50 %	50 %	0 %	0 %	407484714
35	NC_018659	TA	3	6	39054	39059	50 %	50 %	0 %	0 %	407484714
36	NC_018659	TA	3	6	46609	46614	50 %	50 %	0 %	0 %	407484721
37	NC_018659	TG	3	6	51442	51447	0 %	50 %	50 %	0 %	407484727
38	NC_018659	GA	3	6	52049	52054	50 %	0 %	50 %	0 %	407484727
39	NC_018659	GC	3	6	52275	52280	0 %	0 %	50 %	50 %	407484727
40	NC_018659	CA	3	6	52284	52289	50 %	0 %	0 %	50 %	407484727
41	NC_018659	GC	3	6	52653	52658	0 %	0 %	50 %	50 %	407484728
42	NC_018659	AC	3	6	53726	53731	50 %	0 %	0 %	50 %	407484730
43	NC_018659	TG	3	6	53931	53936	0 %	50 %	50 %	0 %	407484730
44	NC_018659	CA	3	6	55261	55266	50 %	0 %	0 %	50 %	407484731
45	NC_018659	GC	3	6	55492	55497	0 %	0 %	50 %	50 %	407484732
46	NC_018659	GC	3	6	55857	55862	0 %	0 %	50 %	50 %	407484733
47	NC_018659	TC	3	6	57418	57423	0 %	50 %	0 %	50 %	407484735
48	NC_018659	GC	3	6	58076	58081	0 %	0 %	50 %	50 %	407484736
49	NC_018659	GC	3	6	59445	59450	0 %	0 %	50 %	50 %	407484738
50	NC_018659	AG	3	6	60040	60045	50 %	0 %	50 %	0 %	407484739
51	NC_018659	TC	3	6	62359	62364	0 %	50 %	0 %	50 %	407484741
52	NC_018659	TG	3	6	63784	63789	0 %	50 %	50 %	0 %	407484743
53	NC_018659	CG	3	6	66308	66313	0 %	0 %	50 %	50 %	407484746
54	NC_018659	CA	3	6	68117	68122	50 %	0 %	0 %	50 %	407484750
55	NC_018659	GC	3	6	69088	69093	0 %	0 %	50 %	50 %	407484751
56	NC_018659	TC	3	6	70007	70012	0 %	50 %	0 %	50 %	407484752
57	NC_018659	TC	3	6	70518	70523	0 %	50 %	0 %	50 %	407484753
58	NC_018659	TC	3	6	71226	71231	0 %	50 %	0 %	50 %	407484754
59	NC_018659	CA	3	6	72302	72307	50 %	0 %	0 %	50 %	407484754
60	NC_018659	CA	3	6	72745	72750	50 %	0 %	0 %	50 %	407484754
61	NC_018659	GA	3	6	74788	74793	50 %	0 %	50 %	0 %	407484755
62	NC_018659	CA	3	6	75006	75011	50 %	0 %	0 %	50 %	407484755
63	NC_018659	CA	3	6	76098	76103	50 %	0 %	0 %	50 %	407484756
64	NC_018659	AG	3	6	76535	76540	50 %	0 %	50 %	0 %	407484756
65	NC_018659	CT	3	6	77322	77327	0 %	50 %	0 %	50 %	407484757
66	NC_018659	TG	3	6	77721	77726	0 %	50 %	50 %	0 %	407484757
67	NC_018659	TA	3	6	79238	79243	50 %	50 %	0 %	0 %	407484758
68	NC_018659	TG	3	6	79257	79262	0 %	50 %	50 %	0 %	407484758
69	NC_018659	TG	3	6	79863	79868	0 %	50 %	50 %	0 %	407484759
70	NC_018659	AT	3	6	81254	81259	50 %	50 %	0 %	0 %	407484763
71	NC_018659	TG	3	6	81812	81817	0 %	50 %	50 %	0 %	407484765
72	NC_018659	AT	3	6	81909	81914	50 %	50 %	0 %	0 %	407484765
73	NC_018659	AT	4	8	82727	82734	50 %	50 %	0 %	0 %	407484766
74	NC_018659	CT	3	6	83563	83568	0 %	50 %	0 %	50 %	407484766
75	NC_018659	CA	3	6	84521	84526	50 %	0 %	0 %	50 %	407484766
76	NC_018659	AT	3	6	85465	85470	50 %	50 %	0 %	0 %	407484768
77	NC_018659	GT	3	6	85778	85783	0 %	50 %	50 %	0 %	407484768

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.