MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	ACATAA	2	12	23621	23632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018658	GATAAA	2	12	156679	156690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018658	GAATAC	2	12	195450	195461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018658	AGGGGC	2	12	195822	195833	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018658	GTTCCC	2	12	196267	196278	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018658	TAAATA	2	12	221786	221797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018658	TCTCCC	2	12	262688	262699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018658	TGAAAT	2	12	274192	274203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018658	GCATCT	2	12	284302	284313	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018658	TATTTC	2	12	285191	285202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018658	CTGGAA	2	12	339290	339301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_018658	GTTTTT	2	12	365645	365656	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018658	GAATGA	2	12	383723	383734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018658	TAAATT	2	12	421517	421528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018658	GTATCT	2	12	623789	623800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018658	ATGCAG	2	12	642501	642512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018658	TTATAT	2	12	658610	658621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018658	ATAAAA	2	12	669376	669387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018658	AATGCA	2	12	671273	671284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018658	CGGTTA	2	12	683308	683319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018658	AGGGAG	2	12	715263	715274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018658	ATCATT	2	12	737875	737886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018658	AAAAAG	2	12	738710	738721	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018658	TACAAC	2	12	743385	743396	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018658	GGGGTG	2	12	751176	751187	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018658	TTAAAT	2	12	817768	817779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018658	ACGAAA	2	12	830967	830978	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018658	GAGAAA	2	12	859204	859215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018658	TGACGG	2	12	859239	859250	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018658	ATATAA	2	12	891037	891048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018658	ATGTTA	2	12	912571	912582	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018658	CTTCAA	2	12	941080	941091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018658	CTCAGT	2	12	973785	973796	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018658	ACGCAG	2	12	987458	987469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018658	CCTCAC	2	12	1010007	1010018	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018658	TCGCGA	2	12	1017826	1017837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018658	AACAAA	2	12	1118274	1118285	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018658	TGATCT	2	12	1137352	1137363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018658	TCTTGT	2	12	1143048	1143059	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018658	AAAACC	2	12	1147379	1147390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018658	AAACCG	2	12	1161705	1161716	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018658	ATATCA	2	12	1254041	1254052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018658	TCTCCC	2	12	1277805	1277816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018658	GTAAAA	2	12	1288910	1288921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018658	AAACTG	2	12	1355239	1355250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018658	TGTCCA	2	12	1369843	1369854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018658	TGCACT	2	12	1520282	1520293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018658	CATAAC	2	12	1537396	1537407	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018658	CATCAG	2	12	1555237	1555248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018658	ATATTT	2	12	1571293	1571304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018658	GTTAAC	2	12	1573986	1573997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018658	GTTAAC	2	12	1574050	1574061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018658	TTTTCT	2	12	1641547	1641558	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018658	GTGACA	2	12	1651839	1651850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018658	CATTTA	2	12	1665473	1665484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018658	GGGTAA	2	12	1683338	1683349	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018658	TAGTGG	2	12	1714267	1714278	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018658	GGAAGA	2	12	1791936	1791947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018658	GTAAGG	2	12	1851478	1851489	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018658	GTAAGG	2	12	1852086	1852097	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018658	GTTCCG	2	12	1880808	1880819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018658	AGGGGG	2	12	1902478	1902489	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018658	ACAAAA	2	12	1932333	1932344	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_018658	GCTGGG	2	12	1940951	1940962	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_018658	CTGTGC	2	12	1987286	1987297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018658	TGTCTG	2	12	2020918	2020929	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018658	ATACAC	2	12	2088318	2088329	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018658	ATAAGA	2	12	2100400	2100411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018658	TGAATT	2	12	2114218	2114229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018658	GACAGT	2	12	2210857	2210868	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_018658	ATGGTT	2	12	2254512	2254523	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018658	AAAGAA	2	12	2258457	2258468	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018658	GTAATA	2	12	2278450	2278461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018658	CTGTTC	2	12	2347900	2347911	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018658	CTTTTT	2	12	2424574	2424585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018658	AGTCTT	2	12	2433496	2433507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018658	AAAACA	2	12	2433756	2433767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_018658	TTATTT	2	12	2434388	2434399	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018658	TAAGTA	2	12	2448045	2448056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018658	CATCTT	2	12	2530851	2530862	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018658	AGTAAA	2	12	2550891	2550902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018658	GCTAAT	2	12	2564869	2564880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018658	ATTTAA	2	12	2597327	2597338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018658	CATAAC	2	12	2658779	2658790	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018658	TAACGG	2	12	2667610	2667621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018658	TATGAA	2	12	2670897	2670908	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018658	ATTAAT	2	12	2681795	2681806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018658	GTTTTT	2	12	2682484	2682495	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018658	CATTAC	2	12	2689814	2689825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018658	AGTTAT	2	12	2851613	2851624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018658	GATCAG	2	12	2943672	2943683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018658	ACCCCC	2	12	2945930	2945941	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
93	NC_018658	CTTTTG	2	12	2954150	2954161	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018658	CGCAGC	2	12	2973565	2973576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018658	GGGTAT	2	12	2975231	2975242	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018658	AGCCTG	2	12	3012669	3012680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018658	TCGAGT	2	12	3012801	3012812	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018658	AAGCGT	2	12	3012821	3012832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_018658	ACAAAA	2	12	3033459	3033470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_018658	CTTTTT	2	12	3047208	3047219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018658	TTTTTG	2	12	3116644	3116655	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018658	AAATAA	2	12	3118733	3118744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018658	CGGCTG	2	12	3151507	3151518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018658	TCAGTG	2	12	3189207	3189218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018658	GAAACC	2	12	3192429	3192440	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018658	ACAATA	2	12	3194161	3194172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018658	AGACAA	2	12	3200848	3200859	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_018658	TGTGGT	2	12	3201252	3201263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018658	CCGAAT	2	12	3214512	3214523	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018658	CATTAT	2	12	3352364	3352375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018658	TCCTTA	2	12	3353778	3353789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018658	TGGACA	2	12	3376045	3376056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018658	ATCTTT	2	12	3396844	3396855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_018658	CGGTTA	2	12	3462454	3462465	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018658	TTTCTG	2	12	3553469	3553480	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018658	AACGCA	2	12	3628388	3628399	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018658	AGGTAA	2	12	3706489	3706500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018658	TATTTT	2	12	3721653	3721664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018658	CGTCCC	2	12	3736701	3736712	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018658	CGATAA	2	12	3803885	3803896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018658	ATTTGC	2	12	3813447	3813458	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018658	CGCCTG	2	12	3924952	3924963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018658	TGAAAA	2	12	3943794	3943805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018658	ATTGTT	2	12	4011101	4011112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.