MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 75101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	CCG	2	6	28	33	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479588
2	NC_018658	GCA	2	6	50	55	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
3	NC_018658	TAA	2	6	200	205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479588
4	NC_018658	TGC	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
5	NC_018658	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479588
6	NC_018658	GTT	2	6	533	538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479588
7	NC_018658	GGC	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479588
8	NC_018658	CTG	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
9	NC_018658	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479588
10	NC_018658	CTA	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479588
11	NC_018658	CTG	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
12	NC_018658	CGA	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
13	NC_018658	TAA	2	6	755	760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479588
14	NC_018658	CTG	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479588
15	NC_018658	TGA	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479588
16	NC_018658	CGA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
17	NC_018658	AGA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479588
18	NC_018658	TAC	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479588
19	NC_018658	TGG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479588
20	NC_018658	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479588
21	NC_018658	AGA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479588
22	NC_018658	TTA	2	6	1468	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479589
23	NC_018658	ACA	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479589
24	NC_018658	GGT	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479589
25	NC_018658	CTG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479589
26	NC_018658	TGG	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479589
27	NC_018658	CGA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479589
28	NC_018658	GCG	2	6	1777	1782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479589
29	NC_018658	GAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479589
30	NC_018658	CGG	2	6	2064	2069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479589
31	NC_018658	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479589
32	NC_018658	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479589
33	NC_018658	CCG	2	6	2172	2177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479589
34	NC_018658	GAA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479589
35	NC_018658	CAA	2	6	2322	2327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479589
36	NC_018658	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479589
37	NC_018658	ATG	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479589
38	NC_018658	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479589
39	NC_018658	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479590
40	NC_018658	AGG	2	6	2734	2739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407479590
41	NC_018658	CGG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479590
42	NC_018658	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479590
43	NC_018658	AGC	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479590
44	NC_018658	GCG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479590
45	NC_018658	GAT	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479590
46	NC_018658	TGA	3	9	3464	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479590
47	NC_018658	GCT	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479590
48	NC_018658	CTC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407479591
49	NC_018658	CAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479591
50	NC_018658	GGT	2	6	3768	3773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479591
51	NC_018658	CGA	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479591
52	NC_018658	CGG	3	9	3908	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
53	NC_018658	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
54	NC_018658	GTA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479591
55	NC_018658	AGA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
56	NC_018658	GGC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
57	NC_018658	TCT	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479591
58	NC_018658	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479591
59	NC_018658	CGG	2	6	4473	4478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
60	NC_018658	GCG	2	6	4501	4506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
61	NC_018658	AAG	2	6	4538	4543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
62	NC_018658	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407479591
63	NC_018658	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479591
64	NC_018658	CAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479591
65	NC_018658	CTG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
66	NC_018658	TGC	2	6	4773	4778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
67	NC_018658	GCG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
68	NC_018658	CCG	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479591
69	NC_018658	TGG	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479591
70	NC_018658	GGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
71	NC_018658	CAT	4	12	5118	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479591
72	NC_018658	GCT	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
73	NC_018658	CTT	2	6	5178	5183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479591
74	NC_018658	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479591
75	NC_018658	GAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
76	NC_018658	GAC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479591
77	NC_018658	CGT	2	6	5437	5442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
78	NC_018658	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479591
79	NC_018658	TCG	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
80	NC_018658	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479591
81	NC_018658	CGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
82	NC_018658	TCG	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
83	NC_018658	ACC	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479591
84	NC_018658	GTC	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
85	NC_018658	TGC	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
86	NC_018658	GTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479591
87	NC_018658	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479591
88	NC_018658	CGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479591
89	NC_018658	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479591
90	NC_018658	TTA	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479592
91	NC_018658	CGC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479592
92	NC_018658	AAG	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479592
93	NC_018658	ATC	2	6	6202	6207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479592
94	NC_018658	ATC	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479592
95	NC_018658	TGA	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479593
96	NC_018658	GAG	2	6	6375	6380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407479593
97	NC_018658	GGC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479593
98	NC_018658	TGC	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479593
99	NC_018658	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479593
100	NC_018658	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479593
101	NC_018658	CAC	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479593
102	NC_018658	CTG	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479593
103	NC_018658	CTG	2	6	6852	6857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479594
104	NC_018658	CCG	2	6	6877	6882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479594
105	NC_018658	ACG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479594
106	NC_018658	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479594
107	NC_018658	GCC	2	6	7038	7043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479594
108	NC_018658	GAC	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479594
109	NC_018658	CAC	2	6	7145	7150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479594
110	NC_018658	CTA	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479594
111	NC_018658	CCA	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479594
112	NC_018658	TGA	3	9	7270	7278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479594
113	NC_018658	TGA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479594
114	NC_018658	GAA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479594
115	NC_018658	AAG	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479594
116	NC_018658	ATT	2	6	7667	7672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479595
117	NC_018658	ATG	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479595
118	NC_018658	TGC	2	6	7746	7751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479595
119	NC_018658	TCT	2	6	7945	7950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479595
120	NC_018658	AGT	3	9	7961	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479595
121	NC_018658	CTT	2	6	8368	8373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018658	CCT	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018658	GTA	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018658	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018658	TAC	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018658	TCA	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018658	TAC	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018658	AGA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018658	CAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479596
130	NC_018658	TGG	2	6	8912	8917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479596
131	NC_018658	GCA	2	6	8938	8943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479596
132	NC_018658	GAT	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479596
133	NC_018658	CAA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479596
134	NC_018658	TGC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479596
135	NC_018658	GGC	2	6	9237	9242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479596
136	NC_018658	GCA	2	6	9490	9495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479597
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138	NC_018658	GCG	2	6	9637	9642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479597
139	NC_018658	TGA	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479597
140	NC_018658	CAT	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479597
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143	NC_018658	CGG	2	6	10099	10104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479597
144	NC_018658	CGA	2	6	10203	10208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479598
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149	NC_018658	TGA	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479599
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151	NC_018658	CGG	2	6	11123	11128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479599
152	NC_018658	CGG	2	6	11137	11142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479599
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157	NC_018658	ATG	2	6	11596	11601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479599
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159	NC_018658	ACA	2	6	11713	11718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479599
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163	NC_018658	GCA	2	6	12050	12055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479600
164	NC_018658	TGA	2	6	12087	12092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479600
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166	NC_018658	CGG	2	6	12241	12246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479600
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174	NC_018658	CTG	2	6	12935	12940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479600
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184	NC_018658	CGT	2	6	13699	13704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479601
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220	NC_018658	CAT	3	9	16101	16109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
221	NC_018658	GGC	2	6	16123	16128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
222	NC_018658	TGC	2	6	16149	16154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
223	NC_018658	GGC	2	6	16433	16438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479604
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225	NC_018658	GTG	2	6	16550	16555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479604
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229	NC_018658	ACA	2	6	16968	16973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479605
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233	NC_018658	TGG	2	6	17321	17326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
234	NC_018658	CAA	2	6	17349	17354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_018658	TGG	2	6	17527	17532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479606
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237	NC_018658	GGC	2	6	17589	17594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479606
238	NC_018658	TGG	2	6	17603	17608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479606
239	NC_018658	ATC	2	6	17610	17615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479606
240	NC_018658	TGC	2	6	17662	17667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479606
241	NC_018658	CTT	2	6	17732	17737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479606
242	NC_018658	TCA	2	6	17791	17796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407479606
243	NC_018658	GGT	2	6	17799	17804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479606
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249	NC_018658	TGC	2	6	18259	18264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479606
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251	NC_018658	AGG	2	6	18316	18321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407479606
252	NC_018658	GTG	2	6	18369	18374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479606
253	NC_018658	GTT	2	6	18438	18443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479606
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255	NC_018658	GCA	2	6	18575	18580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479606
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367	NC_018658	CGG	2	6	26877	26882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
368	NC_018658	ATT	2	6	26885	26890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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