MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 8303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018658	CTT	2	6	8368	8373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018658	CCT	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018658	GTA	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018658	CAA	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018658	TAC	2	6	8486	8491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018658	TCA	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018658	TAC	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018658	AGA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018658	TCA	2	6	14400	14405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018658	ATG	2	6	14450	14455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018658	TGA	2	6	16068	16073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018658	CAT	3	9	16101	16109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018658	GGC	2	6	16123	16128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018658	TGC	2	6	16149	16154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018658	GCC	2	6	16763	16768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018658	CTT	2	6	16843	16848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018658	TGG	2	6	17321	17326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018658	CAA	2	6	17349	17354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018658	GTC	2	6	20058	20063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018658	ACG	2	6	23547	23552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018658	TGA	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018658	CGG	2	6	26877	26882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018658	ATT	2	6	26885	26890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018658	CCT	2	6	27353	27358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018658	TGA	2	6	29922	29927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018658	ACC	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018658	CTG	2	6	30168	30173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018658	AGA	2	6	30176	30181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018658	TGT	2	6	30414	30419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018658	TTG	2	6	30451	30456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018658	CAC	2	6	30498	30503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018658	AAC	2	6	33116	33121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018658	TGC	2	6	36679	36684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018658	ATT	3	9	39967	39975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018658	ATT	2	6	39998	40003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018658	GTT	2	6	40054	40059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018658	TCC	2	6	40093	40098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_018658	CGC	2	6	42013	42018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018658	AAG	2	6	43356	43361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018658	AGT	2	6	43370	43375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018658	TAA	2	6	43884	43889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018658	ATT	2	6	47084	47089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018658	ATT	2	6	47225	47230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018658	ACA	2	6	47315	47320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018658	GGT	2	6	49763	49768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018658	AGA	2	6	50573	50578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018658	TCA	2	6	51646	51651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018658	GGT	2	6	52753	52758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018658	TAA	2	6	52774	52779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018658	ATG	2	6	53085	53090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018658	ATG	2	6	56135	56140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018658	CAG	2	6	56236	56241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018658	AGG	2	6	56262	56267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018658	ATA	2	6	57279	57284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018658	ATT	2	6	57295	57300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018658	CTG	2	6	58326	58331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018658	TTA	3	9	58445	58453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018658	ACA	2	6	58500	58505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018658	TTA	2	6	58525	58530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018658	TCA	2	6	58693	58698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018658	ATG	2	6	58921	58926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018658	ATT	2	6	59045	59050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018658	ACT	2	6	59106	59111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018658	GGT	2	6	59133	59138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018658	ACA	2	6	59178	59183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018658	GCT	2	6	59228	59233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018658	CCT	2	6	59688	59693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018658	CGC	2	6	59704	59709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018658	TCA	3	9	59783	59791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018658	TCA	2	6	60055	60060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018658	TAC	2	6	60368	60373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018658	GAA	2	6	60395	60400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018658	TTC	2	6	60447	60452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018658	GCA	2	6	60511	60516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018658	TGG	2	6	60618	60623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018658	GCA	2	6	61402	61407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018658	CTG	2	6	61437	61442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018658	TCC	2	6	61683	61688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_018658	TGT	2	6	61692	61697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018658	CAC	2	6	61729	61734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_018658	AAC	2	6	61747	61752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018658	GTT	2	6	61844	61849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018658	GAT	2	6	61889	61894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018658	TAT	2	6	62025	62030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018658	AGC	2	6	62115	62120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018658	GTG	2	6	62277	62282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018658	TGA	2	6	62369	62374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018658	CGT	2	6	62421	62426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018658	CTG	2	6	62820	62825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018658	GGC	2	6	62885	62890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018658	GCA	2	6	63068	63073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018658	TAT	2	6	63079	63084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018658	TAC	2	6	63097	63102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018658	CTC	2	6	63140	63145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018658	GAC	2	6	63214	63219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018658	TGA	2	6	63937	63942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018658	CCA	2	6	63954	63959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018658	GTC	2	6	64045	64050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018658	CAC	2	6	64726	64731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018658	CAC	2	6	64772	64777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018658	GCG	2	6	64918	64923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018658	AGA	2	6	65077	65082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018658	TGT	2	6	65113	65118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018658	TGC	2	6	69156	69161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018658	CGC	2	6	69255	69260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018658	GGC	2	6	69267	69272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018658	GAT	2	6	69528	69533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018658	ACT	2	6	69586	69591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018658	GAA	2	6	71096	71101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018658	TTC	2	6	71140	71145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018658	ACA	2	6	72534	72539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018658	CGG	2	6	72998	73003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018658	AGG	2	6	74728	74733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018658	GGT	2	6	77385	77390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018658	ATC	2	6	77400	77405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018658	TGA	2	6	79854	79859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018658	TAA	4	12	80721	80732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018658	GAT	2	6	83352	83357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018658	CAC	2	6	83366	83371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018658	GGT	2	6	83409	83414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018658	ATC	2	6	83424	83429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018658	TTA	2	6	85338	85343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018658	ATA	2	6	85357	85362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018658	GCA	2	6	85471	85476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018658	CTG	2	6	86057	86062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018658	TGC	2	6	86074	86079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018658	TGC	2	6	86118	86123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018658	GCT	2	6	87331	87336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018658	TCT	2	6	87372	87377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018658	GGT	2	6	87393	87398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018658	CGG	3	9	87491	87499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018658	TCG	2	6	87503	87508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018658	GGA	2	6	87524	87529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018658	ACC	2	6	87532	87537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_018658	GAC	2	6	91418	91423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018658	TAT	2	6	91427	91432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018658	ATG	2	6	91558	91563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018658	TCC	2	6	92329	92334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018658	TCC	2	6	93588	93593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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