MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 1507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	ATTTC	2	10	3861	3870	20 %	60 %	0 %	20 %	407463878
2	NC_018656	TTTGA	2	10	5161	5170	20 %	60 %	20 %	0 %	407463879
3	NC_018656	GACAT	2	10	5301	5310	40 %	20 %	20 %	20 %	407463879
4	NC_018656	ATCTG	2	10	5584	5593	20 %	40 %	20 %	20 %	407463880
5	NC_018656	AAGAA	2	10	5971	5980	80 %	0 %	20 %	0 %	407463880
6	NC_018656	ATCAA	2	10	6497	6506	60 %	20 %	0 %	20 %	407463881
7	NC_018656	AATTC	2	10	6548	6557	40 %	40 %	0 %	20 %	407463881
8	NC_018656	AAATC	2	10	11545	11554	60 %	20 %	0 %	20 %	407463884
9	NC_018656	TAAAT	2	10	15148	15157	60 %	40 %	0 %	0 %	407463890
10	NC_018656	ATTTT	2	10	15891	15900	20 %	80 %	0 %	0 %	407463890
11	NC_018656	TTAGA	2	10	16335	16344	40 %	40 %	20 %	0 %	407463890
12	NC_018656	AAATT	2	10	18410	18419	60 %	40 %	0 %	0 %	407463893
13	NC_018656	TGAAT	2	10	18647	18656	40 %	40 %	20 %	0 %	407463893
14	NC_018656	TTTTC	2	10	18665	18674	0 %	80 %	0 %	20 %	407463893
15	NC_018656	CAAAA	2	10	19454	19463	80 %	0 %	0 %	20 %	407463894
16	NC_018656	ATCAA	2	10	20864	20873	60 %	20 %	0 %	20 %	407463896
17	NC_018656	AATCA	2	10	20944	20953	60 %	20 %	0 %	20 %	407463896
18	NC_018656	TTTGT	2	10	21279	21288	0 %	80 %	20 %	0 %	407463896
19	NC_018656	AATCC	2	10	21925	21934	40 %	20 %	0 %	40 %	407463897
20	NC_018656	AACAA	2	10	23053	23062	80 %	0 %	0 %	20 %	407463898
21	NC_018656	TATTT	2	10	24206	24215	20 %	80 %	0 %	0 %	407463899
22	NC_018656	ATTCA	2	10	24369	24378	40 %	40 %	0 %	20 %	407463899
23	NC_018656	AAATT	2	10	24660	24669	60 %	40 %	0 %	0 %	407463899
24	NC_018656	TATCT	2	10	25796	25805	20 %	60 %	0 %	20 %	407463900
25	NC_018656	ATTCT	2	10	29770	29779	20 %	60 %	0 %	20 %	407463903
26	NC_018656	CAATA	2	10	29986	29995	60 %	20 %	0 %	20 %	407463903
27	NC_018656	ACACA	2	10	31914	31923	60 %	0 %	0 %	40 %	407463904
28	NC_018656	TAATA	2	10	32128	32137	60 %	40 %	0 %	0 %	407463904
29	NC_018656	TCTTT	2	10	32804	32813	0 %	80 %	0 %	20 %	407463905
30	NC_018656	ATCCA	2	10	33571	33580	40 %	20 %	0 %	40 %	407463906
31	NC_018656	TTGTA	2	10	34529	34538	20 %	60 %	20 %	0 %	407463907
32	NC_018656	TCTAT	2	10	34800	34809	20 %	60 %	0 %	20 %	407463907
33	NC_018656	GGATT	2	10	36582	36591	20 %	40 %	40 %	0 %	407463909
34	NC_018656	ACAAT	2	10	36718	36727	60 %	20 %	0 %	20 %	407463909
35	NC_018656	TGGAT	2	10	37294	37303	20 %	40 %	40 %	0 %	407463910
36	NC_018656	CTACA	2	10	38380	38389	40 %	20 %	0 %	40 %	407463910
37	NC_018656	GAAAT	2	10	39462	39471	60 %	20 %	20 %	0 %	407463911
38	NC_018656	TAAAA	2	10	39820	39829	80 %	20 %	0 %	0 %	407463912
39	NC_018656	AAATC	2	10	39916	39925	60 %	20 %	0 %	20 %	407463912
40	NC_018656	AATTC	2	10	43531	43540	40 %	40 %	0 %	20 %	407463914
41	NC_018656	TCCAT	2	10	44378	44387	20 %	40 %	0 %	40 %	407463915
42	NC_018656	CATTA	2	10	45739	45748	40 %	40 %	0 %	20 %	407463915
43	NC_018656	TGTAT	2	10	47282	47291	20 %	60 %	20 %	0 %	407463917
44	NC_018656	ACTAC	2	10	48028	48037	40 %	20 %	0 %	40 %	407463919
45	NC_018656	TCTTT	2	10	48089	48098	0 %	80 %	0 %	20 %	407463919
46	NC_018656	CATTC	2	10	49196	49205	20 %	40 %	0 %	40 %	407463920
47	NC_018656	AGTGT	2	10	49307	49316	20 %	40 %	40 %	0 %	407463920
48	NC_018656	ACATT	2	10	49580	49589	40 %	40 %	0 %	20 %	407463920
49	NC_018656	CAAAA	2	10	50231	50240	80 %	0 %	0 %	20 %	407463921
50	NC_018656	ATGCA	2	10	51374	51383	40 %	20 %	20 %	20 %	407463923
51	NC_018656	TCCTC	2	10	52230	52239	0 %	40 %	0 %	60 %	407463925
52	NC_018656	AATCA	2	10	53991	54000	60 %	20 %	0 %	20 %	407463927
53	NC_018656	ATTAT	2	10	55316	55325	40 %	60 %	0 %	0 %	407463928
54	NC_018656	TTTGT	2	10	57290	57299	0 %	80 %	20 %	0 %	407463931
55	NC_018656	GAAAG	2	10	58808	58817	60 %	0 %	40 %	0 %	407463932
56	NC_018656	CTTTT	2	10	59104	59113	0 %	80 %	0 %	20 %	407463933
57	NC_018656	AGTAT	2	10	59511	59520	40 %	40 %	20 %	0 %	407463933
58	NC_018656	TAAAT	2	10	59641	59650	60 %	40 %	0 %	0 %	407463933
59	NC_018656	CAAAG	2	10	62506	62515	60 %	0 %	20 %	20 %	407463937
60	NC_018656	CATCC	2	10	65777	65786	20 %	20 %	0 %	60 %	407463941
61	NC_018656	ATACA	2	10	66604	66613	60 %	20 %	0 %	20 %	407463942
62	NC_018656	CAATC	2	10	67088	67097	40 %	20 %	0 %	40 %	407463943
63	NC_018656	TTCTA	2	10	67468	67477	20 %	60 %	0 %	20 %	407463944
64	NC_018656	AAATG	2	10	68202	68211	60 %	20 %	20 %	0 %	407463944
65	NC_018656	AGATT	2	10	68597	68606	40 %	40 %	20 %	0 %	407463945
66	NC_018656	CAATT	2	10	70011	70020	40 %	40 %	0 %	20 %	407463948
67	NC_018656	TCGAT	2	10	70404	70413	20 %	40 %	20 %	20 %	407463948
68	NC_018656	CACAT	2	10	72093	72102	40 %	20 %	0 %	40 %	407463951
69	NC_018656	GTACT	2	10	72486	72495	20 %	40 %	20 %	20 %	407463951
70	NC_018656	CATTC	2	10	73113	73122	20 %	40 %	0 %	40 %	407463952
71	NC_018656	ACTTT	2	10	73374	73383	20 %	60 %	0 %	20 %	407463952
72	NC_018656	ATCAA	2	10	74866	74875	60 %	20 %	0 %	20 %	407463955
73	NC_018656	GAAAA	2	10	75291	75300	80 %	0 %	20 %	0 %	407463955
74	NC_018656	ATGTT	2	10	76483	76492	20 %	60 %	20 %	0 %	407463957
75	NC_018656	GATTT	2	10	76835	76844	20 %	60 %	20 %	0 %	407463957
76	NC_018656	TCTTT	2	10	77062	77071	0 %	80 %	0 %	20 %	407463957
77	NC_018656	GAGTT	2	10	77370	77379	20 %	40 %	40 %	0 %	407463957
78	NC_018656	TAATG	2	10	80266	80275	40 %	40 %	20 %	0 %	407463961
79	NC_018656	TGAAT	2	10	80459	80468	40 %	40 %	20 %	0 %	407463961
80	NC_018656	TTCTG	2	10	80950	80959	0 %	60 %	20 %	20 %	407463961
81	NC_018656	CCAAT	2	10	82503	82512	40 %	20 %	0 %	40 %	407463962
82	NC_018656	ACAAA	2	10	82975	82984	80 %	0 %	0 %	20 %	407463963
83	NC_018656	AAAAG	2	10	83052	83061	80 %	0 %	20 %	0 %	407463963
84	NC_018656	ATTTC	2	10	83065	83074	20 %	60 %	0 %	20 %	407463963
85	NC_018656	CTAAT	2	10	83348	83357	40 %	40 %	0 %	20 %	407463963
86	NC_018656	AAAAT	2	10	83928	83937	80 %	20 %	0 %	0 %	407463965
87	NC_018656	ATACA	2	10	86983	86992	60 %	20 %	0 %	20 %	407463969
88	NC_018656	CATAC	2	10	87168	87177	40 %	20 %	0 %	40 %	407463970
89	NC_018656	TTCTG	2	10	87562	87571	0 %	60 %	20 %	20 %	407463970
90	NC_018656	TGTCT	2	10	88191	88200	0 %	60 %	20 %	20 %	407463971
91	NC_018656	GCATT	2	10	89266	89275	20 %	40 %	20 %	20 %	407463974
92	NC_018656	CTTTT	2	10	89297	89306	0 %	80 %	0 %	20 %	407463974
93	NC_018656	GCTTT	2	10	90775	90784	0 %	60 %	20 %	20 %	407463975
94	NC_018656	GTGAT	2	10	91910	91919	20 %	40 %	40 %	0 %	407463976
95	NC_018656	CTAAA	2	10	92027	92036	60 %	20 %	0 %	20 %	407463976
96	NC_018656	CTGCG	2	10	92995	93004	0 %	20 %	40 %	40 %	407463977
97	NC_018656	GCATT	2	10	94980	94989	20 %	40 %	20 %	20 %	407463979
98	NC_018656	TAAAA	2	10	96670	96679	80 %	20 %	0 %	0 %	407463980
99	NC_018656	ACTGG	2	10	98076	98085	20 %	20 %	40 %	20 %	407463980
100	NC_018656	ATTTC	2	10	100423	100432	20 %	60 %	0 %	20 %	407463985
101	NC_018656	TTTTG	2	10	102351	102360	0 %	80 %	20 %	0 %	407463988
102	NC_018656	TCAAA	2	10	103938	103947	60 %	20 %	0 %	20 %	407463989
103	NC_018656	TTCTT	2	10	104079	104088	0 %	80 %	0 %	20 %	407463990
104	NC_018656	ATGGA	2	10	104294	104303	40 %	20 %	40 %	0 %	407463990
105	NC_018656	GATTG	2	10	105292	105301	20 %	40 %	40 %	0 %	407463991
106	NC_018656	GATTT	2	10	105327	105336	20 %	60 %	20 %	0 %	407463991
107	NC_018656	TTTAA	2	10	106204	106213	40 %	60 %	0 %	0 %	407463992
108	NC_018656	CAAAC	2	10	107826	107835	60 %	0 %	0 %	40 %	407463995
109	NC_018656	ATGAT	2	10	108209	108218	40 %	40 %	20 %	0 %	407463995
110	NC_018656	AGAAA	2	10	109202	109211	80 %	0 %	20 %	0 %	407463996
111	NC_018656	CAAAA	2	10	109999	110008	80 %	0 %	0 %	20 %	407463996
112	NC_018656	TTCTT	2	10	112406	112415	0 %	80 %	0 %	20 %	407464000
113	NC_018656	CAAAA	2	10	112728	112737	80 %	0 %	0 %	20 %	407464000
114	NC_018656	ATTTT	2	10	113074	113083	20 %	80 %	0 %	0 %	407464000
115	NC_018656	GAATT	2	10	113628	113637	40 %	40 %	20 %	0 %	407464001
116	NC_018656	AAATC	2	10	115249	115258	60 %	20 %	0 %	20 %	407464003
117	NC_018656	GAAAA	2	10	115369	115378	80 %	0 %	20 %	0 %	407464003
118	NC_018656	TTCTA	2	10	118051	118060	20 %	60 %	0 %	20 %	407464006
119	NC_018656	AAATC	2	10	119907	119916	60 %	20 %	0 %	20 %	407464008
120	NC_018656	AATAC	2	10	120543	120552	60 %	20 %	0 %	20 %	407464009
121	NC_018656	TAAAA	2	10	121924	121933	80 %	20 %	0 %	0 %	407464011
122	NC_018656	TGATT	2	10	122011	122020	20 %	60 %	20 %	0 %	407464011
123	NC_018656	TCAAA	2	10	122445	122454	60 %	20 %	0 %	20 %	407464011
124	NC_018656	TAGAC	2	10	124329	124338	40 %	20 %	20 %	20 %	407464013
125	NC_018656	AAAGA	2	10	125485	125494	80 %	0 %	20 %	0 %	407464013
126	NC_018656	ATTAG	2	10	125848	125857	40 %	40 %	20 %	0 %	407464014
127	NC_018656	GCAAG	2	10	126706	126715	40 %	0 %	40 %	20 %	407464015
128	NC_018656	TGATA	2	10	127481	127490	40 %	40 %	20 %	0 %	407464015
129	NC_018656	ATTGA	2	10	127817	127826	40 %	40 %	20 %	0 %	407464015
130	NC_018656	AATTC	2	10	127857	127866	40 %	40 %	0 %	20 %	407464016
131	NC_018656	ATTTG	2	10	129561	129570	20 %	60 %	20 %	0 %	407464017
132	NC_018656	AAACC	2	10	129613	129622	60 %	0 %	0 %	40 %	407464017
133	NC_018656	TGATT	2	10	133425	133434	20 %	60 %	20 %	0 %	407464023
134	NC_018656	CATGT	2	10	134143	134152	20 %	40 %	20 %	20 %	407464024
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136	NC_018656	AATTA	2	10	137839	137848	60 %	40 %	0 %	0 %	407464030
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