MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 4678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	AATC	2	8	13	20	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018656	AATC	2	8	79	86	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018656	TCAA	2	8	172	179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018656	AAAC	2	8	600	607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018656	CTTT	2	8	868	875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018656	CAAT	2	8	1516	1523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018656	ACAA	2	8	1767	1774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018656	TAAT	2	8	2353	2360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018656	TAAT	2	8	2960	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018656	ATTG	2	8	3951	3958	25 %	50 %	25 %	0 %	407463878
11	NC_018656	ATTT	2	8	4321	4328	25 %	75 %	0 %	0 %	407463878
12	NC_018656	TCAC	2	8	4459	4466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018656	AAAT	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018656	TCTT	2	8	5182	5189	0 %	75 %	0 %	25 %	407463879
15	NC_018656	AATC	2	8	5908	5915	50 %	25 %	0 %	25 %	407463880
16	NC_018656	TACA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	0 %	25 %	407463880
17	NC_018656	AAAC	2	8	6055	6062	75 %	0 %	0 %	25 %	407463880
18	NC_018656	TAAT	2	8	6396	6403	50 %	50 %	0 %	0 %	407463880
19	NC_018656	GGAA	2	8	6416	6423	50 %	0 %	50 %	0 %	407463880
20	NC_018656	ATGA	2	8	6676	6683	50 %	25 %	25 %	0 %	407463881
21	NC_018656	AATG	2	8	6775	6782	50 %	25 %	25 %	0 %	407463881
22	NC_018656	TAAA	2	8	6929	6936	75 %	25 %	0 %	0 %	407463881
23	NC_018656	CTAG	2	8	7537	7544	25 %	25 %	25 %	25 %	407463881
24	NC_018656	CAAG	2	8	7622	7629	50 %	0 %	25 %	25 %	407463882
25	NC_018656	CTTT	2	8	7999	8006	0 %	75 %	0 %	25 %	407463882
26	NC_018656	AATT	2	8	8345	8352	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
27	NC_018656	TTTG	2	8	9266	9273	0 %	75 %	25 %	0 %	407463882
28	NC_018656	ATTA	2	8	9332	9339	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
29	NC_018656	AATT	2	8	9829	9836	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
30	NC_018656	AATT	2	8	10153	10160	50 %	50 %	0 %	0 %	407463882
31	NC_018656	AAAC	2	8	10198	10205	75 %	0 %	0 %	25 %	407463882
32	NC_018656	CTTG	2	8	10310	10317	0 %	50 %	25 %	25 %	407463882
33	NC_018656	TGAT	2	8	10998	11005	25 %	50 %	25 %	0 %	407463883
34	NC_018656	AAAG	2	8	13195	13202	75 %	0 %	25 %	0 %	407463887
35	NC_018656	ATGG	2	8	13285	13292	25 %	25 %	50 %	0 %	407463887
36	NC_018656	CAAA	2	8	13336	13343	75 %	0 %	0 %	25 %	407463887
37	NC_018656	CGTT	2	8	13609	13616	0 %	50 %	25 %	25 %	407463887
38	NC_018656	AAAC	2	8	13623	13630	75 %	0 %	0 %	25 %	407463887
39	NC_018656	AATG	2	8	13731	13738	50 %	25 %	25 %	0 %	407463887
40	NC_018656	TCAT	2	8	13876	13883	25 %	50 %	0 %	25 %	407463887
41	NC_018656	GTTG	2	8	14182	14189	0 %	50 %	50 %	0 %	407463887
42	NC_018656	TCAA	2	8	14353	14360	50 %	25 %	0 %	25 %	407463888
43	NC_018656	ATTA	2	8	15097	15104	50 %	50 %	0 %	0 %	407463890
44	NC_018656	TTAG	2	8	15500	15507	25 %	50 %	25 %	0 %	407463890
45	NC_018656	AATT	2	8	15658	15665	50 %	50 %	0 %	0 %	407463890
46	NC_018656	CAAT	2	8	15745	15752	50 %	25 %	0 %	25 %	407463890
47	NC_018656	TCTT	2	8	15777	15784	0 %	75 %	0 %	25 %	407463890
48	NC_018656	AGTT	2	8	15880	15887	25 %	50 %	25 %	0 %	407463890
49	NC_018656	TTCA	2	8	15956	15963	25 %	50 %	0 %	25 %	407463890
50	NC_018656	TCCC	2	8	16545	16552	0 %	25 %	0 %	75 %	407463890
51	NC_018656	TTTA	2	8	17201	17208	25 %	75 %	0 %	0 %	407463890
52	NC_018656	GAAG	2	8	17673	17680	50 %	0 %	50 %	0 %	407463892
53	NC_018656	CTTT	2	8	18001	18008	0 %	75 %	0 %	25 %	407463892
54	NC_018656	CTTT	2	8	18248	18255	0 %	75 %	0 %	25 %	407463893
55	NC_018656	TAAT	2	8	18433	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	407463893
56	NC_018656	TAAA	2	8	18825	18832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018656	GGAT	2	8	20096	20103	25 %	25 %	50 %	0 %	407463894
58	NC_018656	ATTC	2	8	20586	20593	25 %	50 %	0 %	25 %	407463895
59	NC_018656	ATTG	2	8	20812	20819	25 %	50 %	25 %	0 %	407463895
60	NC_018656	TTAT	2	8	20954	20961	25 %	75 %	0 %	0 %	407463896
61	NC_018656	GTCT	2	8	20962	20969	0 %	50 %	25 %	25 %	407463896
62	NC_018656	CCAA	2	8	21075	21082	50 %	0 %	0 %	50 %	407463896
63	NC_018656	TTAT	2	8	21194	21201	25 %	75 %	0 %	0 %	407463896
64	NC_018656	GTTT	2	8	22934	22941	0 %	75 %	25 %	0 %	407463898
65	NC_018656	ATTT	2	8	23470	23477	25 %	75 %	0 %	0 %	407463898
66	NC_018656	ATTA	2	8	23656	23663	50 %	50 %	0 %	0 %	407463898
67	NC_018656	TTAT	2	8	24159	24166	25 %	75 %	0 %	0 %	407463899
68	NC_018656	TAAT	2	8	24240	24247	50 %	50 %	0 %	0 %	407463899
69	NC_018656	AATC	2	8	24535	24542	50 %	25 %	0 %	25 %	407463899
70	NC_018656	TTCT	2	8	24849	24856	0 %	75 %	0 %	25 %	407463900
71	NC_018656	ATCT	2	8	25027	25034	25 %	50 %	0 %	25 %	407463900
72	NC_018656	TGGA	2	8	25039	25046	25 %	25 %	50 %	0 %	407463900
73	NC_018656	TGGT	2	8	25306	25313	0 %	50 %	50 %	0 %	407463900
74	NC_018656	ATAA	2	8	25894	25901	75 %	25 %	0 %	0 %	407463901
75	NC_018656	ACTT	2	8	26455	26462	25 %	50 %	0 %	25 %	407463902
76	NC_018656	ATTT	2	8	26569	26576	25 %	75 %	0 %	0 %	407463902
77	NC_018656	AACT	2	8	27057	27064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018656	AAAG	2	8	27100	27107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018656	TTCA	2	8	28345	28352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018656	ATTC	2	8	28769	28776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018656	GAAA	2	8	29061	29068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018656	TTGG	2	8	29210	29217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018656	TGAT	2	8	29650	29657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018656	CAAA	2	8	29672	29679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018656	CTTG	2	8	29853	29860	0 %	50 %	25 %	25 %	407463903
86	NC_018656	TTTG	2	8	29940	29947	0 %	75 %	25 %	0 %	407463903
87	NC_018656	TTAA	2	8	30717	30724	50 %	50 %	0 %	0 %	407463903
88	NC_018656	ACTA	2	8	31314	31321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018656	AATT	2	8	32107	32114	50 %	50 %	0 %	0 %	407463904
90	NC_018656	ATTC	2	8	32138	32145	25 %	50 %	0 %	25 %	407463904
91	NC_018656	ATTA	2	8	32609	32616	50 %	50 %	0 %	0 %	407463905
92	NC_018656	TGTA	2	8	32969	32976	25 %	50 %	25 %	0 %	407463905
93	NC_018656	CCAT	2	8	33273	33280	25 %	25 %	0 %	50 %	407463906
94	NC_018656	AAAC	2	8	33616	33623	75 %	0 %	0 %	25 %	407463906
95	NC_018656	CTAT	2	8	33800	33807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018656	ATTA	2	8	33995	34002	50 %	50 %	0 %	0 %	407463907
97	NC_018656	ATTT	2	8	34517	34524	25 %	75 %	0 %	0 %	407463907
98	NC_018656	ATTC	2	8	35363	35370	25 %	50 %	0 %	25 %	407463908
99	NC_018656	TAAT	2	8	35856	35863	50 %	50 %	0 %	0 %	407463908
100	NC_018656	CAAT	2	8	36210	36217	50 %	25 %	0 %	25 %	407463908
101	NC_018656	ATTT	2	8	37108	37115	25 %	75 %	0 %	0 %	407463910
102	NC_018656	AATT	2	8	37668	37675	50 %	50 %	0 %	0 %	407463910
103	NC_018656	TGGT	2	8	37764	37771	0 %	50 %	50 %	0 %	407463910
104	NC_018656	CAGG	2	8	37880	37887	25 %	0 %	50 %	25 %	407463910
105	NC_018656	GAAA	2	8	37988	37995	75 %	0 %	25 %	0 %	407463910
106	NC_018656	AATG	2	8	39362	39369	50 %	25 %	25 %	0 %	407463911
107	NC_018656	GAAA	2	8	39381	39388	75 %	0 %	25 %	0 %	407463911
108	NC_018656	TGAT	2	8	39576	39583	25 %	50 %	25 %	0 %	407463911
109	NC_018656	TATT	2	8	40206	40213	25 %	75 %	0 %	0 %	407463912
110	NC_018656	TTAA	2	8	40533	40540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018656	TTCA	2	8	40882	40889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018656	TGAA	2	8	41557	41564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018656	ATTT	2	8	42995	43002	25 %	75 %	0 %	0 %	407463914
114	NC_018656	AAAG	2	8	43335	43342	75 %	0 %	25 %	0 %	407463914
115	NC_018656	TTAA	2	8	43929	43936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018656	CTTT	2	8	43998	44005	0 %	75 %	0 %	25 %	407463915
117	NC_018656	ATCA	2	8	44323	44330	50 %	25 %	0 %	25 %	407463915
118	NC_018656	TGAC	2	8	44405	44412	25 %	25 %	25 %	25 %	407463915
119	NC_018656	AATC	2	8	44466	44473	50 %	25 %	0 %	25 %	407463915
120	NC_018656	TGAC	2	8	44996	45003	25 %	25 %	25 %	25 %	407463915
121	NC_018656	TCCT	2	8	45075	45082	0 %	50 %	0 %	50 %	407463915
122	NC_018656	TCCA	2	8	45205	45212	25 %	25 %	0 %	50 %	407463915
123	NC_018656	TAGG	2	8	46212	46219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018656	TGTA	2	8	46548	46555	25 %	50 %	25 %	0 %	407463916
125	NC_018656	GAAA	2	8	46784	46791	75 %	0 %	25 %	0 %	407463916
126	NC_018656	AGGT	2	8	46907	46914	25 %	25 %	50 %	0 %	407463916
127	NC_018656	AAGA	2	8	46926	46933	75 %	0 %	25 %	0 %	407463916
128	NC_018656	AAAG	3	12	46951	46962	75 %	0 %	25 %	0 %	407463916
129	NC_018656	TTCC	2	8	47614	47621	0 %	50 %	0 %	50 %	407463918
130	NC_018656	CTCC	2	8	47756	47763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_018656	CCTA	2	8	47956	47963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018656	ATTG	2	8	48136	48143	25 %	50 %	25 %	0 %	407463919
133	NC_018656	ATCC	2	8	48348	48355	25 %	25 %	0 %	50 %	407463919
134	NC_018656	AACC	2	8	48356	48363	50 %	0 %	0 %	50 %	407463919
135	NC_018656	ATTA	2	8	48711	48718	50 %	50 %	0 %	0 %	407463919
136	NC_018656	ATGA	2	8	49089	49096	50 %	25 %	25 %	0 %	407463920
137	NC_018656	GCAA	2	8	49426	49433	50 %	0 %	25 %	25 %	407463920
138	NC_018656	ATAG	2	8	49780	49787	50 %	25 %	25 %	0 %	407463920
139	NC_018656	AGTT	2	8	49842	49849	25 %	50 %	25 %	0 %	407463920
140	NC_018656	ATGA	2	8	50335	50342	50 %	25 %	25 %	0 %	407463921
141	NC_018656	TTCT	2	8	50461	50468	0 %	75 %	0 %	25 %	407463921
142	NC_018656	AGAA	2	8	50648	50655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_018656	TGAT	2	8	51179	51186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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