MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	AATC	2	8	13	20	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018656	AATC	2	8	79	86	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018656	TCAA	2	8	172	179	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018656	AAAC	2	8	600	607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018656	CTTT	2	8	868	875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018656	CAAT	2	8	1516	1523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018656	ACAA	2	8	1767	1774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018656	TAAT	2	8	2353	2360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018656	TAAT	2	8	2960	2967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018656	TCAC	2	8	4459	4466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018656	AAAT	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018656	TAAA	2	8	18825	18832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018656	AACT	2	8	27057	27064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018656	AAAG	2	8	27100	27107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018656	TTCA	2	8	28345	28352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018656	ATTC	2	8	28769	28776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018656	GAAA	2	8	29061	29068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018656	TTGG	2	8	29210	29217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018656	TGAT	2	8	29650	29657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018656	CAAA	2	8	29672	29679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018656	ACTA	2	8	31314	31321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018656	CTAT	2	8	33800	33807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018656	TTAA	2	8	40533	40540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018656	TTCA	2	8	40882	40889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018656	TGAA	2	8	41557	41564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018656	TTAA	2	8	43929	43936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018656	TAGG	2	8	46212	46219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018656	CTCC	2	8	47756	47763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_018656	CCTA	2	8	47956	47963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018656	AGAA	2	8	50648	50655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018656	TGAA	2	8	51081	51088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018656	TGAT	2	8	51179	51186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018656	GCCT	2	8	51208	51215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018656	TTAA	2	8	51237	51244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018656	TGCC	2	8	53140	53147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018656	CAAT	2	8	53238	53245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018656	GAAA	2	8	53261	53268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018656	TGTA	2	8	64811	64818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018656	TATG	2	8	74691	74698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018656	ATTT	2	8	75392	75399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018656	TTTC	2	8	78575	78582	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018656	TATT	2	8	79688	79695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018656	AGGT	2	8	82607	82614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018656	TTCA	2	8	85029	85036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018656	GTAA	2	8	86449	86456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018656	TGAT	2	8	90818	90825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018656	CATG	2	8	94752	94759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018656	ATCG	2	8	102000	102007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018656	TTGT	2	8	118886	118893	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018656	TGAT	2	8	137171	137178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018656	TAAA	2	8	137214	137221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018656	AAAG	2	8	138743	138750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018656	ATTC	2	8	140410	140417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018656	AACA	2	8	141134	141141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018656	CAAA	2	8	146686	146693	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018656	TAAT	2	8	148802	148809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018656	GGGA	2	8	149794	149801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018656	TCAT	2	8	152400	152407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018656	TGAG	2	8	157177	157184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018656	TAAA	2	8	157455	157462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018656	AATT	2	8	173396	173403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018656	CTAT	2	8	173414	173421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018656	TACT	2	8	174995	175002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018656	TATT	2	8	176855	176862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018656	AAAT	2	8	177690	177697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018656	ATTT	2	8	177703	177710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018656	ATAG	2	8	177715	177722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018656	ATGT	2	8	177823	177830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018656	TAAT	2	8	179187	179194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018656	TAAT	2	8	179337	179344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018656	ATCT	2	8	184959	184966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018656	ATTA	2	8	187379	187386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018656	GATC	2	8	187422	187429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_018656	TGAT	2	8	196684	196691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018656	TGAA	2	8	205662	205669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018656	AAAT	2	8	208848	208855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018656	ATAA	2	8	209751	209758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018656	TAAA	2	8	227873	227880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018656	TAAA	2	8	229143	229150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018656	TTAT	2	8	229903	229910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018656	TTGA	2	8	231314	231321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018656	TTTC	2	8	232214	232221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018656	AATT	2	8	232294	232301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018656	AATT	2	8	232309	232316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018656	ATTT	2	8	234293	234300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018656	AATA	2	8	237084	237091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018656	CAAT	2	8	240175	240182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018656	TTAA	2	8	246594	246601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018656	TAGT	2	8	247775	247782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018656	CATA	2	8	247834	247841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018656	AATG	2	8	266080	266087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018656	ATGT	2	8	304704	304711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018656	ACAA	2	8	307973	307980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018656	ATAA	2	8	316536	316543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018656	ATTG	2	8	318703	318710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018656	ATTT	2	8	321535	321542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018656	AATA	2	8	325220	325227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018656	ATGA	2	8	329730	329737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018656	GCTT	2	8	331951	331958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018656	CAAG	2	8	332203	332210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018656	CATT	2	8	332247	332254	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018656	TCCC	2	8	339474	339481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_018656	TTAC	2	8	341580	341587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018656	TTAG	2	8	341612	341619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018656	ATAG	2	8	341829	341836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018656	CTAA	2	8	342652	342659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018656	TCAT	2	8	346652	346659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018656	AAAC	2	8	347269	347276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018656	TCTA	2	8	349181	349188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018656	AATT	2	8	350309	350316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018656	GAAT	2	8	352579	352586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018656	TAAA	2	8	352637	352644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018656	GTTT	2	8	353189	353196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018656	CAAA	2	8	354625	354632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018656	ATTT	2	8	354702	354709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018656	TAAA	2	8	354773	354780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018656	GAAA	2	8	355380	355387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018656	TTAT	2	8	355516	355523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018656	TAAT	2	8	358473	358480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018656	TTTG	2	8	358856	358863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018656	AACA	2	8	359212	359219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018656	TAAA	2	8	362668	362675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018656	AAAC	2	8	380985	380992	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018656	CTTT	2	8	382191	382198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018656	TAAA	2	8	384817	384824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018656	ACAG	2	8	384836	384843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018656	TAGA	2	8	388210	388217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018656	CAAC	2	8	388390	388397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018656	ATGT	2	8	388554	388561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018656	TCTT	2	8	402183	402190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018656	TTCA	2	8	409354	409361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018656	AAAC	2	8	414829	414836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018656	ACAA	2	8	414956	414963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018656	TTTC	2	8	415079	415086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018656	TTAA	2	8	427742	427749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018656	AGAT	2	8	427860	427867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018656	TGAT	2	8	427940	427947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018656	TCTT	2	8	443402	443409	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018656	AGTT	2	8	443810	443817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018656	TTTA	2	8	453361	453368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018656	ATTG	2	8	456410	456417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018656	TACA	2	8	462289	462296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018656	ATTA	2	8	463933	463940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018656	GATT	2	8	465407	465414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018656	ATTT	2	8	471599	471606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018656	TAAT	2	8	472095	472102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018656	TTGC	2	8	474233	474240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018656	TTAT	2	8	474494	474501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018656	ATTG	2	8	475177	475184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018656	AATT	2	8	475926	475933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018656	GAAT	2	8	476870	476877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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