MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 20440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	TAT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
2	NC_018656	TGA	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463878
3	NC_018656	TCT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
4	NC_018656	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
5	NC_018656	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
6	NC_018656	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
7	NC_018656	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463878
8	NC_018656	CAA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
9	NC_018656	AAC	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463878
10	NC_018656	CTT	2	6	3694	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
11	NC_018656	CTT	4	12	3982	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463878
12	NC_018656	CAT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463878
13	NC_018656	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
14	NC_018656	TAT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463878
15	NC_018656	ATC	3	9	4527	4535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
16	NC_018656	AAC	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
17	NC_018656	TCC	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463879
18	NC_018656	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
19	NC_018656	GAA	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463879
20	NC_018656	TCT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463879
21	NC_018656	CAA	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463879
22	NC_018656	GTT	2	6	4826	4831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463879
23	NC_018656	TAA	2	6	4896	4901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463879
24	NC_018656	CAT	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
25	NC_018656	TCA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
26	NC_018656	TCA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
27	NC_018656	CAT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463879
28	NC_018656	GCA	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463880
29	NC_018656	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463880
30	NC_018656	TGA	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
31	NC_018656	TGA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463880
32	NC_018656	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
33	NC_018656	AAC	2	6	6100	6105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
34	NC_018656	CCA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463880
35	NC_018656	CAA	2	6	6224	6229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463880
36	NC_018656	ATT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463880
37	NC_018656	CAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463880
38	NC_018656	ATA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463880
39	NC_018656	GAT	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
40	NC_018656	TCC	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463881
41	NC_018656	CTA	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463881
42	NC_018656	GAA	2	6	7083	7088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463881
43	NC_018656	ATT	2	6	7107	7112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463881
44	NC_018656	TGA	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
45	NC_018656	AAT	2	6	7188	7193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463881
46	NC_018656	CTT	2	6	7220	7225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463881
47	NC_018656	TGA	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
48	NC_018656	TGA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463881
49	NC_018656	GCA	2	6	7510	7515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463881
50	NC_018656	CCT	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463882
51	NC_018656	TTG	2	6	7669	7674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
52	NC_018656	ATT	2	6	7677	7682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
53	NC_018656	AAT	2	6	7793	7798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
54	NC_018656	GCA	2	6	7833	7838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
55	NC_018656	TCT	2	6	7849	7854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
56	NC_018656	GGT	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463882
57	NC_018656	GGA	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
58	NC_018656	CAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
59	NC_018656	ATC	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463882
60	NC_018656	CTT	2	6	7986	7991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
61	NC_018656	GCA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
62	NC_018656	GTT	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
63	NC_018656	CGT	2	6	8138	8143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463882
64	NC_018656	CCA	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463882
65	NC_018656	GCA	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
66	NC_018656	AAT	2	6	8231	8236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
67	NC_018656	AAT	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
68	NC_018656	AAT	2	6	8438	8443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
69	NC_018656	TTG	2	6	8512	8517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
70	NC_018656	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
71	NC_018656	CAA	2	6	8607	8612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
72	NC_018656	ATG	2	6	8644	8649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
73	NC_018656	ATG	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
74	NC_018656	ATA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
75	NC_018656	AGC	2	6	8762	8767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
76	NC_018656	TTC	2	6	8830	8835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
77	NC_018656	TTC	2	6	9000	9005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463882
78	NC_018656	ATT	2	6	9038	9043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
79	NC_018656	GGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407463882
80	NC_018656	CCA	3	9	9138	9146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407463882
81	NC_018656	ATT	2	6	9437	9442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
82	NC_018656	GAT	2	6	9453	9458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
83	NC_018656	AGA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
84	NC_018656	TAT	2	6	9654	9659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
85	NC_018656	CCT	2	6	9672	9677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463882
86	NC_018656	GTA	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
87	NC_018656	CAG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
88	NC_018656	ATA	2	6	9922	9927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463882
89	NC_018656	TGG	2	6	9986	9991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407463882
90	NC_018656	GTT	2	6	9993	9998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463882
91	NC_018656	GCA	2	6	10017	10022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407463882
92	NC_018656	TGC	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463882
93	NC_018656	GAA	2	6	10097	10102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
94	NC_018656	ACA	2	6	10122	10127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463882
95	NC_018656	TGA	2	6	10136	10141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463882
96	NC_018656	ATT	2	6	10190	10195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463882
97	NC_018656	GAA	2	6	10302	10307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463882
98	NC_018656	CTT	2	6	10461	10466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463883
99	NC_018656	GTT	2	6	10467	10472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463883
100	NC_018656	ATT	2	6	10593	10598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463883
101	NC_018656	ATA	2	6	10669	10674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463883
102	NC_018656	ATT	2	6	10902	10907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463883
103	NC_018656	GAA	3	9	11038	11046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463884
104	NC_018656	TTG	2	6	11056	11061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463884
105	NC_018656	GAT	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463884
106	NC_018656	GTA	2	6	11110	11115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463884
107	NC_018656	GTA	2	6	11189	11194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463884
108	NC_018656	AAT	2	6	11244	11249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
109	NC_018656	TCA	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407463884
110	NC_018656	ATT	2	6	11278	11283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463884
111	NC_018656	TCC	2	6	11295	11300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407463884
112	NC_018656	TTC	2	6	11309	11314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463884
113	NC_018656	ACA	2	6	11334	11339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463884
114	NC_018656	AAC	2	6	11417	11422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463884
115	NC_018656	GAA	2	6	11467	11472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463884
116	NC_018656	TCT	2	6	11512	11517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407463884
117	NC_018656	AAT	2	6	11530	11535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
118	NC_018656	AAT	2	6	11644	11649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463884
119	NC_018656	CAA	2	6	11736	11741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407463884
120	NC_018656	GAT	2	6	11917	11922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463884
121	NC_018656	ATT	2	6	11930	11935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407463884
122	NC_018656	GAT	3	9	12166	12174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407463885
123	NC_018656	GTC	2	6	12261	12266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463885
124	NC_018656	AAT	2	6	12490	12495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407463886
125	NC_018656	GTT	2	6	12615	12620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407463886
126	NC_018656	TGC	2	6	12695	12700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407463886
127	NC_018656	AGA	2	6	12794	12799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463886
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129	NC_018656	AGA	2	6	12866	12871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407463886
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