MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 chromosome

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018656	AC	3	6	46	51	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018656	CT	3	6	327	332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018656	TC	3	6	27535	27540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018656	CT	3	6	27832	27837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018656	GT	3	6	27899	27904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018656	CT	3	6	28817	28822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018656	GT	3	6	29015	29020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018656	AT	3	6	29055	29060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018656	AT	3	6	41150	41155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018656	AT	3	6	51858	51863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018656	TA	3	6	53184	53189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018656	AT	3	6	61034	61039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018656	TA	3	6	62186	62191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018656	AT	3	6	72755	72760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018656	AT	3	6	74709	74714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018656	AT	3	6	76093	76098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018656	TC	3	6	78666	78671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018656	TA	3	6	79922	79927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018656	TC	3	6	82572	82577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018656	TG	3	6	85102	85107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018656	AT	3	6	86047	86052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018656	TA	3	6	94792	94797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018656	AT	3	6	98434	98439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018656	AT	3	6	118918	118923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018656	TA	3	6	123129	123134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018656	TA	3	6	125548	125553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018656	AT	3	6	136863	136868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018656	TA	3	6	148351	148356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018656	AC	3	6	148770	148775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018656	GT	3	6	156943	156948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018656	GA	3	6	176849	176854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018656	CT	3	6	177754	177759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018656	CT	3	6	182922	182927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018656	TG	3	6	186281	186286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018656	CT	4	8	186312	186319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018656	AT	3	6	197577	197582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018656	AT	3	6	200178	200183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018656	TA	4	8	203845	203852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018656	AG	3	6	205343	205348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018656	AT	3	6	208794	208799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018656	AT	3	6	230953	230958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018656	CT	3	6	232613	232618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018656	TG	3	6	233436	233441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018656	GA	3	6	234312	234317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018656	TA	3	6	249487	249492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018656	TC	3	6	258785	258790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018656	CA	3	6	265078	265083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018656	TG	3	6	269829	269834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018656	TA	3	6	276006	276011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018656	TG	3	6	281907	281912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018656	AT	4	8	284691	284698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018656	TG	3	6	284726	284731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018656	AT	3	6	321607	321612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018656	CT	3	6	332001	332006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018656	AG	3	6	332415	332420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018656	TA	3	6	332536	332541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018656	GC	4	8	339411	339418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018656	TG	3	6	341790	341795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018656	AC	3	6	342704	342709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018656	TG	4	8	346495	346502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018656	AT	3	6	347103	347108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018656	TG	3	6	347580	347585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018656	AT	3	6	349128	349133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018656	AT	3	6	351357	351362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018656	GT	3	6	353261	353266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018656	TG	3	6	354567	354572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018656	TC	3	6	359161	359166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018656	TG	3	6	377162	377167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018656	CT	3	6	388456	388461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018656	AT	3	6	395226	395231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018656	TA	3	6	407543	407548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018656	TA	3	6	409308	409313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018656	TA	3	6	412736	412741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018656	CT	3	6	414124	414129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018656	TC	3	6	427696	427701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018656	GA	3	6	435097	435102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018656	TA	3	6	436896	436901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018656	TA	3	6	462232	462237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018656	AT	3	6	462267	462272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018656	CT	3	6	462427	462432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018656	CT	3	6	470655	470660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018656	GT	3	6	474455	474460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018656	AG	3	6	476476	476481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018656	TC	3	6	476599	476604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018656	CA	4	8	484952	484959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018656	TA	3	6	486508	486513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018656	CT	3	6	486642	486647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018656	TC	3	6	487549	487554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018656	TC	3	6	498146	498151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018656	TC	4	8	502324	502331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018656	TA	3	6	502362	502367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018656	AT	3	6	515464	515469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018656	AT	3	6	519869	519874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018656	TC	3	6	532771	532776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018656	AT	3	6	536088	536093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018656	TG	3	6	536120	536125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018656	TC	3	6	544088	544093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018656	GA	3	6	546769	546774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018656	GA	4	8	549248	549255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018656	AC	3	6	563373	563378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018656	AG	3	6	564957	564962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018656	TC	3	6	564975	564980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018656	AG	3	6	568927	568932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018656	GT	3	6	576601	576606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018656	AT	3	6	584969	584974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018656	TG	3	6	585887	585892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018656	AT	3	6	592208	592213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018656	AG	3	6	595288	595293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018656	TC	3	6	600131	600136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018656	CT	3	6	600239	600244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018656	TA	3	6	605975	605980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018656	TA	3	6	606015	606020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018656	TA	3	6	606074	606079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018656	AT	3	6	608465	608470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018656	CT	3	6	608552	608557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018656	TC	3	6	609063	609068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018656	TA	4	8	609136	609143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018656	TC	4	8	609332	609339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018656	TA	3	6	611368	611373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018656	TC	3	6	617751	617756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018656	TC	3	6	618021	618026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018656	TC	3	6	618788	618793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018656	AC	3	6	618947	618952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018656	AG	3	6	634891	634896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018656	TC	3	6	641455	641460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018656	CA	3	6	644073	644078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018656	AT	3	6	644255	644260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018656	CT	3	6	645500	645505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_018656	AT	3	6	648018	648023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018656	AT	3	6	648036	648041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018656	TC	3	6	667838	667843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018656	TC	4	8	669366	669373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018656	AT	3	6	669838	669843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018656	AT	3	6	671315	671320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018656	AT	3	6	673081	673086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018656	AT	3	6	675283	675288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018656	AC	3	6	678526	678531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018656	CA	4	8	683855	683862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018656	TA	4	8	686534	686541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018656	GT	3	6	687044	687049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018656	TA	3	6	688150	688155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018656	AT	3	6	689138	689143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018656	AT	3	6	701331	701336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018656	TC	3	6	701757	701762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018656	TC	3	6	714732	714737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018656	AT	3	6	714864	714869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018656	CA	3	6	716583	716588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018656	TA	3	6	716600	716605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018656	TA	3	6	717155	717160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018656	AC	3	6	718426	718431	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_018656	AT	3	6	739874	739879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018656	AC	3	6	739960	739965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_018656	AC	3	6	744268	744273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018656	AT	3	6	749286	749291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.