MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	TAAAAA	2	12	846	857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	407461553
2	NC_018655	TCCTAT	2	12	2416	2427	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407461555
3	NC_018655	TTAAAA	2	12	3919	3930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461558
4	NC_018655	ACACCA	2	12	6029	6040	50 %	0 %	0 %	50 %	407461560
5	NC_018655	TTTACT	2	12	6917	6928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407461560
6	NC_018655	ATTATG	2	12	8152	8163	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461562
7	NC_018655	TCAACT	2	12	9036	9047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
8	NC_018655	TCAACT	2	12	9096	9107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
9	NC_018655	TCAACT	2	12	9156	9167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
10	NC_018655	TCAACT	2	12	9216	9227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
11	NC_018655	TCAACT	2	12	9276	9287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461562
12	NC_018655	AACTAC	2	12	9749	9760	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407461562
13	NC_018655	GAGTTT	2	12	10173	10184	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407461562
14	NC_018655	TGTCCA	2	12	10510	10521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407461562
15	NC_018655	ATTACA	2	12	10815	10826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461562
16	NC_018655	ACTCTC	2	12	11735	11746	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407461562
17	NC_018655	ACTGCA	2	12	12288	12299	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407461562
18	NC_018655	ATCAAT	2	12	12566	12577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461562
19	NC_018655	GTATCA	2	12	12717	12728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461562
20	NC_018655	GTTCCA	5	30	13990	14019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407461562
21	NC_018655	GTAACT	2	12	14328	14339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461562
22	NC_018655	CACAAG	2	12	15472	15483	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407461562
23	NC_018655	CTGATC	2	12	18068	18079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407461565
24	NC_018655	TCAAAA	2	12	19728	19739	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461566
25	NC_018655	AATTGC	2	12	21073	21084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461567
26	NC_018655	ATATTG	2	12	24038	24049	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461569
27	NC_018655	AAAACT	2	12	25192	25203	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461571
28	NC_018655	ATTGAA	2	12	26649	26660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461572
29	NC_018655	CAAAAT	2	12	33272	33283	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461580
30	NC_018655	AATTAC	2	12	34926	34937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461582
31	NC_018655	TCAATT	2	12	36029	36040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407461583
32	NC_018655	ATATTG	2	12	37098	37109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461584
33	NC_018655	TGACTC	2	12	42899	42910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407461589
34	NC_018655	TTCCAT	2	12	42989	43000	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407461589
35	NC_018655	TCTATG	2	12	46223	46234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407461591
36	NC_018655	GGATTT	2	12	51621	51632	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407461596
37	NC_018655	GGTCTT	2	12	53852	53863	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407461599
38	NC_018655	TGATTT	2	12	54922	54933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407461599
39	NC_018655	AATTGG	2	12	55824	55835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461600
40	NC_018655	TCTAAT	2	12	57523	57534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407461601
41	NC_018655	GTTCAA	2	12	57540	57551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461601
42	NC_018655	AATTAC	2	12	59133	59144	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461602
43	NC_018655	ATCTAC	2	12	60242	60253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461603
44	NC_018655	ACTGCA	2	12	62429	62440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407461606
45	NC_018655	CAATGA	2	12	67327	67338	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407461611
46	NC_018655	TCATGA	2	12	67840	67851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461613
47	NC_018655	TGAAGA	2	12	70237	70248	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407461615
48	NC_018655	GATTTT	2	12	74127	74138	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407461619
49	NC_018655	TTCATT	2	12	76129	76140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407461621
50	NC_018655	AAACAA	2	12	80121	80132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407461624
51	NC_018655	ATATTG	2	12	84129	84140	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461629
52	NC_018655	TCAATC	2	12	84400	84411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461629
53	NC_018655	GGTTCT	2	12	89314	89325	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407461635
54	NC_018655	TAGTGG	2	12	89514	89525	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407461635
55	NC_018655	CTAGTG	2	12	90628	90639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407461637
56	NC_018655	GAATTA	2	12	91056	91067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461637
57	NC_018655	ATCTTT	2	12	91325	91336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407461638
58	NC_018655	TTTTGT	2	12	92955	92966	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407461639
59	NC_018655	TTGGTT	2	12	93686	93697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461640
60	NC_018655	ATTTGC	2	12	93866	93877	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407461641
61	NC_018655	ATTTTG	2	12	95460	95471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407461642
62	NC_018655	AACGAA	2	12	101877	101888	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407461648
63	NC_018655	ATTTTA	2	12	104457	104468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461652
64	NC_018655	TTTTTG	2	12	104583	104594	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407461653
65	NC_018655	ATTGCT	2	12	110199	110210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407461656
66	NC_018655	AATTTG	2	12	110263	110274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461657
67	NC_018655	GAAATT	2	12	120586	120597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461669
68	NC_018655	CAGAAA	2	12	120656	120667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407461669
69	NC_018655	GAATAC	2	12	121312	121323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407461669
70	NC_018655	GTTTTT	2	12	127073	127084	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407461677
71	NC_018655	TCCAAA	2	12	128748	128759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407461679
72	NC_018655	TGCCGA	2	12	131381	131392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407461685
73	NC_018655	TGCAGG	2	12	132789	132800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407461686
74	NC_018655	GGAAAA	2	12	133174	133185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461686
75	NC_018655	TTTGCC	2	12	139482	139493	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407461695
76	NC_018655	CCATAA	2	12	139993	140004	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407461695
77	NC_018655	TTTGTC	2	12	141118	141129	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407461697
78	NC_018655	CAGGAA	2	12	145198	145209	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407461702
79	NC_018655	TAATTG	2	12	145363	145374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461702
80	NC_018655	CATTTG	2	12	146370	146381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407461706
81	NC_018655	CTCATC	2	12	146382	146393	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407461706
82	NC_018655	AATTCA	2	12	152788	152799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461712
83	NC_018655	AATGGA	2	12	153141	153152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407461713
84	NC_018655	TAATGT	2	12	158681	158692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461721
85	NC_018655	AAGCAA	2	12	158860	158871	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407461721
86	NC_018655	ATCTGA	2	12	161955	161966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461724
87	NC_018655	TTTTGG	2	12	164252	164263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461728
88	NC_018655	TGATGG	2	12	167915	167926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407461733
89	NC_018655	AAAAGA	2	12	171029	171040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	407461738
90	NC_018655	TGATTC	2	12	172344	172355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407461741
91	NC_018655	TAATTG	2	12	173078	173089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407461741
92	NC_018655	ACTAAA	2	12	173592	173603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461741
93	NC_018655	TGAAAA	2	12	175138	175149	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407461744
94	NC_018655	CGATAT	2	12	176185	176196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461746
95	NC_018655	CACACG	2	12	179015	179026	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407461749
96	NC_018655	CTTTTT	2	12	179613	179624	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407461750
97	NC_018655	TCTTTT	2	12	186950	186961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407461756
98	NC_018655	AAAAGC	2	12	198655	198666	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407461768
99	NC_018655	ATTAGA	2	12	204693	204704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461774
100	NC_018655	ACGAAT	2	12	205865	205876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407461776
101	NC_018655	CTAGAA	2	12	207923	207934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407461777
102	NC_018655	AGTAGA	2	12	210436	210447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407461782
103	NC_018655	GATCCA	2	12	211018	211029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407461783
104	NC_018655	TGGATT	2	12	212274	212285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407461784
105	NC_018655	AGAATT	2	12	213187	213198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461784
106	NC_018655	ATTGCA	2	12	214493	214504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461787
107	NC_018655	TGCAAT	3	18	215304	215321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461788
108	NC_018655	TTCTGG	2	12	216523	216534	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	407461789
109	NC_018655	TGCAAT	2	12	218496	218507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461790
110	NC_018655	ATTGCA	2	12	219292	219303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461790
111	NC_018655	ATTCTG	2	12	220465	220476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407461791
112	NC_018655	CAAAAT	2	12	223534	223545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461795
113	NC_018655	TTTTAA	2	12	229501	229512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461800
114	NC_018655	AGATCG	2	12	231115	231126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407461804
115	NC_018655	AATTGA	2	12	231607	231618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407461804
116	NC_018655	TTTCAA	2	12	235243	235254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407461808
117	NC_018655	TCTTTA	2	12	242553	242564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407461816
118	NC_018655	ATTGTG	2	12	242641	242652	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407461816
119	NC_018655	TTATTT	2	12	246323	246334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407461821
120	NC_018655	ATTTTA	2	12	248795	248806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461824
121	NC_018655	GTTTTT	2	12	252683	252694	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407461827
122	NC_018655	ACTGTA	2	12	252752	252763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461827
123	NC_018655	ATTCAA	2	12	252901	252912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461827
124	NC_018655	TGTTCT	2	12	253366	253377	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407461828
125	NC_018655	CAATTA	2	12	254867	254878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407461830
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127	NC_018655	ACTTTT	2	12	256643	256654	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407461832
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132	NC_018655	CCAGAA	2	12	262392	262403	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407461835
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134	NC_018655	CCAGAA	2	12	262422	262433	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407461835
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140	NC_018655	AACTAA	2	12	279553	279564	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461850
141	NC_018655	GTTATG	2	12	279855	279866	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407461850
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216	NC_018655	CATCTG	2	12	424902	424913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407462008
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218	NC_018655	ATTTCC	2	12	425443	425454	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407462008
219	NC_018655	TGAGGA	2	12	427419	427430	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407462011
220	NC_018655	TACAGT	2	12	427836	427847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407462011
221	NC_018655	TTCCTA	2	12	428466	428477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407462013
222	NC_018655	TTGATG	2	12	434420	434431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407462019
223	NC_018655	CTTTGA	2	12	435579	435590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407462019
224	NC_018655	AATGAA	2	12	435886	435897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407462020
225	NC_018655	TCATTA	2	12	440020	440031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407462026
226	NC_018655	TGCAAT	2	12	442215	442226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407462028
227	NC_018655	GATTCT	2	12	442279	442290	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407462028
228	NC_018655	ATGCTG	2	12	447361	447372	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407462033
229	NC_018655	GGGATA	2	12	454879	454890	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	407462043
230	NC_018655	CTGCTC	2	12	455959	455970	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	407462046
231	NC_018655	GTTGGA	2	12	458298	458309	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407462048
232	NC_018655	TACTCT	2	12	463835	463846	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407462053
233	NC_018655	TGTTAC	2	12	465049	465060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407462056
234	NC_018655	TGATTC	2	12	467100	467111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407462059
235	NC_018655	ACAATA	2	12	468500	468511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407462060
236	NC_018655	AAAGTG	2	12	469743	469754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407462063
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239	NC_018655	TTCTAA	2	12	477826	477837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407462074
240	NC_018655	CAATTC	2	12	478039	478050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407462074
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251	NC_018655	TTGGCA	2	12	503924	503935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407462105
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260	NC_018655	GGTGTT	2	12	523628	523639	0 %	50 %	50 %	0 %	407462132
261	NC_018655	TAAAAT	2	12	526048	526059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407462135
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453	NC_018655	TCCTTT	2	12	931391	931402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407462620
454	NC_018655	TTGTTT	2	12	931714	931725	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407462621
455	NC_018655	CAATGT	2	12	932253	932264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407462622
456	NC_018655	TGATAT	2	12	933068	933079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407462623
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