MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 1382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	TCTCT	2	10	1541	1550	0 %	60 %	0 %	40 %	407461554
2	NC_018655	TAGAT	2	10	2471	2480	40 %	40 %	20 %	0 %	407461556
3	NC_018655	CTTGC	2	10	2959	2968	0 %	40 %	20 %	40 %	407461556
4	NC_018655	ATCAA	2	10	4864	4873	60 %	20 %	0 %	20 %	407461558
5	NC_018655	ATTTG	2	10	5774	5783	20 %	60 %	20 %	0 %	407461559
6	NC_018655	GCTAA	2	10	7403	7412	40 %	20 %	20 %	20 %	407461561
7	NC_018655	ATTAG	2	10	11499	11508	40 %	40 %	20 %	0 %	407461562
8	NC_018655	CAAAT	2	10	11634	11643	60 %	20 %	0 %	20 %	407461562
9	NC_018655	GTATG	2	10	12114	12123	20 %	40 %	40 %	0 %	407461562
10	NC_018655	ACTCT	2	10	12593	12602	20 %	40 %	0 %	40 %	407461562
11	NC_018655	ATAGT	2	10	12943	12952	40 %	40 %	20 %	0 %	407461562
12	NC_018655	GGATG	2	10	13632	13641	20 %	20 %	60 %	0 %	407461562
13	NC_018655	GAATT	2	10	13780	13789	40 %	40 %	20 %	0 %	407461562
14	NC_018655	CCAAA	2	10	14990	14999	60 %	0 %	0 %	40 %	407461562
15	NC_018655	TATGA	2	10	15141	15150	40 %	40 %	20 %	0 %	407461562
16	NC_018655	TGTCT	2	10	15182	15191	0 %	60 %	20 %	20 %	407461562
17	NC_018655	GTTCA	2	10	15289	15298	20 %	40 %	20 %	20 %	407461562
18	NC_018655	AAAAT	2	10	16963	16972	80 %	20 %	0 %	0 %	407461563
19	NC_018655	TTTGA	2	10	17723	17732	20 %	60 %	20 %	0 %	407461564
20	NC_018655	TTCAG	2	10	18372	18381	20 %	40 %	20 %	20 %	407461565
21	NC_018655	CTTTT	2	10	18755	18764	0 %	80 %	0 %	20 %	407461565
22	NC_018655	GAAAT	2	10	23322	23331	60 %	20 %	20 %	0 %	407461568
23	NC_018655	TGATT	2	10	23530	23539	20 %	60 %	20 %	0 %	407461568
24	NC_018655	GAAAA	2	10	26307	26316	80 %	0 %	20 %	0 %	407461572
25	NC_018655	GCTTT	2	10	28114	28123	0 %	60 %	20 %	20 %	407461575
26	NC_018655	CAAAA	2	10	28534	28543	80 %	0 %	0 %	20 %	407461575
27	NC_018655	AGATT	2	10	32595	32604	40 %	40 %	20 %	0 %	407461579
28	NC_018655	AAATA	2	10	33566	33575	80 %	20 %	0 %	0 %	407461581
29	NC_018655	TGGGT	2	10	34290	34299	0 %	40 %	60 %	0 %	407461582
30	NC_018655	TCAAC	2	10	36063	36072	40 %	20 %	0 %	40 %	407461583
31	NC_018655	TCAAT	2	10	39069	39078	40 %	40 %	0 %	20 %	407461587
32	NC_018655	TCTAA	2	10	39604	39613	40 %	40 %	0 %	20 %	407461588
33	NC_018655	TCAAA	2	10	39951	39960	60 %	20 %	0 %	20 %	407461588
34	NC_018655	AAATA	2	10	40208	40217	80 %	20 %	0 %	0 %	407461588
35	NC_018655	TGAAT	2	10	40269	40278	40 %	40 %	20 %	0 %	407461588
36	NC_018655	TAATT	2	10	45907	45916	40 %	60 %	0 %	0 %	407461591
37	NC_018655	TAATG	2	10	46117	46126	40 %	40 %	20 %	0 %	407461591
38	NC_018655	TTGAT	2	10	46596	46605	20 %	60 %	20 %	0 %	407461592
39	NC_018655	ATTTG	2	10	46633	46642	20 %	60 %	20 %	0 %	407461592
40	NC_018655	TGATT	2	10	48707	48716	20 %	60 %	20 %	0 %	407461593
41	NC_018655	AAAAT	2	10	49095	49104	80 %	20 %	0 %	0 %	407461594
42	NC_018655	ACAAT	2	10	49251	49260	60 %	20 %	0 %	20 %	407461594
43	NC_018655	AATTG	2	10	50089	50098	40 %	40 %	20 %	0 %	407461595
44	NC_018655	AGGAA	2	10	50353	50362	60 %	0 %	40 %	0 %	407461595
45	NC_018655	AAAGT	2	10	50550	50559	60 %	20 %	20 %	0 %	407461595
46	NC_018655	AAAGG	2	10	52227	52236	60 %	0 %	40 %	0 %	407461596
47	NC_018655	TTGAA	2	10	54430	54439	40 %	40 %	20 %	0 %	407461599
48	NC_018655	TCCAT	2	10	58336	58345	20 %	40 %	0 %	40 %	407461602
49	NC_018655	CATTA	2	10	59697	59706	40 %	40 %	0 %	20 %	407461602
50	NC_018655	CAAAA	2	10	61473	61482	80 %	0 %	0 %	20 %	407461605
51	NC_018655	CATTC	2	10	62872	62881	20 %	40 %	0 %	40 %	407461607
52	NC_018655	AGTTT	2	10	65259	65268	20 %	60 %	20 %	0 %	407461609
53	NC_018655	AATGT	2	10	65482	65491	40 %	40 %	20 %	0 %	407461609
54	NC_018655	CAAAG	2	10	67262	67271	60 %	0 %	20 %	20 %	407461611
55	NC_018655	GGGAA	2	10	67465	67474	40 %	0 %	60 %	0 %	407461611
56	NC_018655	CATGC	2	10	67753	67762	20 %	20 %	20 %	40 %	407461612
57	NC_018655	AATCA	2	10	69919	69928	60 %	20 %	0 %	20 %	407461615
58	NC_018655	TTGCT	2	10	70896	70905	0 %	60 %	20 %	20 %	407461616
59	NC_018655	AAACA	2	10	74323	74332	80 %	0 %	0 %	20 %	407461619
60	NC_018655	ATATG	2	10	76073	76082	40 %	40 %	20 %	0 %	407461621
61	NC_018655	ATACA	2	10	76590	76599	60 %	20 %	0 %	20 %	407461621
62	NC_018655	CCATT	2	10	79205	79214	20 %	40 %	0 %	40 %	407461623
63	NC_018655	GTGAT	2	10	79427	79436	20 %	40 %	40 %	0 %	407461623
64	NC_018655	TAAAT	2	10	80827	80836	60 %	40 %	0 %	0 %	407461625
65	NC_018655	CTTGA	2	10	80877	80886	20 %	40 %	20 %	20 %	407461625
66	NC_018655	TAATC	2	10	80949	80958	40 %	40 %	0 %	20 %	407461625
67	NC_018655	TCAAT	2	10	81716	81725	40 %	40 %	0 %	20 %	407461626
68	NC_018655	ATTTT	2	10	81808	81817	20 %	80 %	0 %	0 %	407461626
69	NC_018655	GTAAT	2	10	81833	81842	40 %	40 %	20 %	0 %	407461626
70	NC_018655	ATATT	2	10	83436	83445	40 %	60 %	0 %	0 %	407461627
71	NC_018655	TAAAT	2	10	85828	85837	60 %	40 %	0 %	0 %	407461630
72	NC_018655	TTATT	2	10	86100	86109	20 %	80 %	0 %	0 %	407461631
73	NC_018655	CAAAT	2	10	90418	90427	60 %	20 %	0 %	20 %	407461637
74	NC_018655	ATTGT	2	10	92469	92478	20 %	60 %	20 %	0 %	407461639
75	NC_018655	GAAAT	2	10	94141	94150	60 %	20 %	20 %	0 %	407461641
76	NC_018655	AAAAG	2	10	94272	94281	80 %	0 %	20 %	0 %	407461641
77	NC_018655	TGGAA	2	10	94958	94967	40 %	20 %	40 %	0 %	407461641
78	NC_018655	GCTTT	2	10	94968	94977	0 %	60 %	20 %	20 %	407461641
79	NC_018655	TTCTC	2	10	95573	95582	0 %	60 %	0 %	40 %	407461642
80	NC_018655	AAATC	2	10	98253	98262	60 %	20 %	0 %	20 %	407461643
81	NC_018655	ATTCA	2	10	99577	99586	40 %	40 %	0 %	20 %	407461645
82	NC_018655	AATTT	2	10	101248	101257	40 %	60 %	0 %	0 %	407461647
83	NC_018655	ATTGT	2	10	102232	102241	20 %	60 %	20 %	0 %	407461648
84	NC_018655	TTAGA	2	10	102456	102465	40 %	40 %	20 %	0 %	407461649
85	NC_018655	AAAAT	2	10	102477	102486	80 %	20 %	0 %	0 %	407461649
86	NC_018655	TTTTG	2	10	102797	102806	0 %	80 %	20 %	0 %	407461649
87	NC_018655	ATTCT	2	10	102904	102913	20 %	60 %	0 %	20 %	407461649
88	NC_018655	TATGA	2	10	103488	103497	40 %	40 %	20 %	0 %	407461650
89	NC_018655	ATTTT	2	10	104734	104743	20 %	80 %	0 %	0 %	407461653
90	NC_018655	ATTAT	2	10	105103	105112	40 %	60 %	0 %	0 %	407461653
91	NC_018655	ATGCA	2	10	105363	105372	40 %	20 %	20 %	20 %	407461653
92	NC_018655	TTCTT	2	10	106762	106771	0 %	80 %	0 %	20 %	407461654
93	NC_018655	ACATG	2	10	107250	107259	40 %	20 %	20 %	20 %	407461654
94	NC_018655	TTTGG	2	10	107871	107880	0 %	60 %	40 %	0 %	407461655
95	NC_018655	AGGAA	2	10	108558	108567	60 %	0 %	40 %	0 %	407461655
96	NC_018655	ATTAA	2	10	108730	108739	60 %	40 %	0 %	0 %	407461655
97	NC_018655	TTTAT	2	10	110310	110319	20 %	80 %	0 %	0 %	407461657
98	NC_018655	CAGAG	2	10	111124	111133	40 %	0 %	40 %	20 %	407461658
99	NC_018655	CGAAC	2	10	112112	112121	40 %	0 %	20 %	40 %	407461658
100	NC_018655	TCTTT	2	10	112679	112688	0 %	80 %	0 %	20 %	407461658
101	NC_018655	CTTGT	2	10	112867	112876	0 %	60 %	20 %	20 %	407461659
102	NC_018655	TGCTT	2	10	113184	113193	0 %	60 %	20 %	20 %	407461659
103	NC_018655	GATAA	2	10	115977	115986	60 %	20 %	20 %	0 %	407461662
104	NC_018655	AAAAT	2	10	116809	116818	80 %	20 %	0 %	0 %	407461664
105	NC_018655	AAGAA	2	10	117704	117713	80 %	0 %	20 %	0 %	407461666
106	NC_018655	GAATT	2	10	120395	120404	40 %	40 %	20 %	0 %	407461669
107	NC_018655	AATGG	2	10	121221	121230	40 %	20 %	40 %	0 %	407461669
108	NC_018655	AACAA	2	10	121552	121561	80 %	0 %	0 %	20 %	407461670
109	NC_018655	ATGTG	2	10	121682	121691	20 %	40 %	40 %	0 %	407461670
110	NC_018655	AAAAG	2	10	121783	121792	80 %	0 %	20 %	0 %	407461670
111	NC_018655	TGATT	2	10	122204	122213	20 %	60 %	20 %	0 %	407461671
112	NC_018655	TTTTC	2	10	122716	122725	0 %	80 %	0 %	20 %	407461672
113	NC_018655	AATAA	2	10	123971	123980	80 %	20 %	0 %	0 %	407461674
114	NC_018655	ATCCA	2	10	124110	124119	40 %	20 %	0 %	40 %	407461674
115	NC_018655	TGTTT	2	10	124990	124999	0 %	80 %	20 %	0 %	407461675
116	NC_018655	GATTC	2	10	125053	125062	20 %	40 %	20 %	20 %	407461675
117	NC_018655	CTTTT	2	10	126426	126435	0 %	80 %	0 %	20 %	407461676
118	NC_018655	GTTTT	2	10	129301	129310	0 %	80 %	20 %	0 %	407461680
119	NC_018655	TTATC	2	10	131814	131823	20 %	60 %	0 %	20 %	407461686
120	NC_018655	ATCAA	2	10	135380	135389	60 %	20 %	0 %	20 %	407461690
121	NC_018655	GAAAA	2	10	135805	135814	80 %	0 %	20 %	0 %	407461690
122	NC_018655	TTTGA	2	10	136491	136500	20 %	60 %	20 %	0 %	407461691
123	NC_018655	ATGGA	2	10	140400	140409	40 %	20 %	40 %	0 %	407461696
124	NC_018655	TTTTC	2	10	141185	141194	0 %	80 %	0 %	20 %	407461697
125	NC_018655	CGTAC	2	10	142382	142391	20 %	20 %	20 %	40 %	407461698
126	NC_018655	ATTAT	2	10	144578	144587	40 %	60 %	0 %	0 %	407461701
127	NC_018655	TATCT	2	10	146812	146821	20 %	60 %	0 %	20 %	407461707
128	NC_018655	AAAAT	2	10	151671	151680	80 %	20 %	0 %	0 %	407461712
129	NC_018655	CGATC	2	10	153487	153496	20 %	20 %	20 %	40 %	407461713
130	NC_018655	AATCC	2	10	154745	154754	40 %	20 %	0 %	40 %	407461714
131	NC_018655	ATCTA	2	10	155477	155486	40 %	40 %	0 %	20 %	407461715
132	NC_018655	TTTTG	2	10	157872	157881	0 %	80 %	20 %	0 %	407461720
133	NC_018655	AGAAT	2	10	159256	159265	60 %	20 %	20 %	0 %	407461721
134	NC_018655	AATTC	2	10	160479	160488	40 %	40 %	0 %	20 %	407461722
135	NC_018655	ATCTT	2	10	164238	164247	20 %	60 %	0 %	20 %	407461728
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263	NC_018655	CTTTC	2	10	307912	307921	0 %	60 %	0 %	40 %	407461880
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