MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	CT	3	6	8005	8010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018655	GA	3	6	44801	44806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018655	TC	4	8	65062	65069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018655	AT	3	6	67783	67788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018655	TA	3	6	69114	69119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018655	AT	3	6	77748	77753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018655	GT	3	6	78050	78055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018655	TA	3	6	78408	78413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018655	TC	3	6	78845	78850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018655	TC	3	6	87012	87017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018655	AT	3	6	87090	87095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018655	TA	3	6	96387	96392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018655	AT	3	6	108950	108955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018655	CT	3	6	113402	113407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018655	AT	3	6	116273	116278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018655	AT	3	6	123833	123838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018655	CT	3	6	124529	124534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018655	AT	3	6	135224	135229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018655	AC	3	6	136057	136062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018655	AT	3	6	136772	136777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018655	TA	3	6	140614	140619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018655	CT	3	6	151198	151203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018655	AT	3	6	152996	153001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018655	TA	3	6	155641	155646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018655	AT	3	6	158114	158119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018655	TG	3	6	179155	179160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018655	CT	4	8	179186	179193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018655	CT	4	8	183567	183574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018655	AC	3	6	184518	184523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018655	TC	3	6	187604	187609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018655	AT	3	6	190447	190452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018655	AT	4	8	193010	193017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018655	TA	4	8	196667	196674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018655	AT	3	6	201533	201538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018655	GA	3	6	218239	218244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018655	AT	3	6	221541	221546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018655	TA	3	6	238426	238431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018655	TG	3	6	240432	240437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018655	TC	3	6	241372	241377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018655	TA	3	6	244533	244538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018655	TC	3	6	247714	247719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018655	TA	3	6	264878	264883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018655	AC	3	6	273023	273028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018655	AT	4	8	274246	274253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018655	TG	3	6	274281	274286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018655	TG	3	6	291100	291105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018655	TG	3	6	294107	294112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018655	CT	3	6	295535	295540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018655	TC	3	6	297114	297119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018655	GA	3	6	315545	315550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018655	CT	3	6	322021	322026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018655	CA	3	6	324885	324890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018655	TG	3	6	333590	333595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018655	GA	3	6	344215	344220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018655	TA	3	6	346070	346075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018655	GC	4	8	352980	352987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018655	TG	3	6	356477	356482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018655	GT	3	6	357050	357055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018655	GA	3	6	374150	374155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018655	AC	4	8	374474	374481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018655	AT	3	6	387636	387641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018655	CA	3	6	391189	391194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018655	TA	3	6	399438	399443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018655	GA	3	6	404051	404056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018655	AT	3	6	410594	410599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018655	AT	3	6	410611	410616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018655	AT	3	6	410619	410624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018655	AT	3	6	410636	410641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018655	CT	3	6	410782	410787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018655	TC	3	6	410816	410821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018655	CT	3	6	410882	410887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018655	TG	3	6	416233	416238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018655	TC	3	6	418244	418249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018655	TA	3	6	418731	418736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018655	CT	3	6	421035	421040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018655	TC	3	6	421356	421361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018655	CA	3	6	424738	424743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018655	TA	3	6	434015	434020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018655	TA	3	6	435795	435800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018655	TA	3	6	439225	439230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018655	CT	3	6	454025	454030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018655	TG	3	6	460074	460079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018655	TC	3	6	461061	461066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018655	AC	3	6	461405	461410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018655	TA	4	8	463127	463134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018655	TG	3	6	481208	481213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018655	AT	3	6	483210	483215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018655	AT	3	6	488477	488482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018655	AT	3	6	488509	488514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018655	TA	3	6	503030	503035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018655	CT	3	6	504190	504195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018655	AT	3	6	519800	519805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018655	TC	3	6	524365	524370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018655	AT	3	6	532087	532092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018655	CG	3	6	535956	535961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018655	AT	3	6	536422	536427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018655	CT	3	6	539807	539812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018655	TG	3	6	551269	551274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018655	CA	3	6	552366	552371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018655	GA	3	6	561889	561894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018655	TG	3	6	571483	571488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018655	GA	3	6	572358	572363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018655	GA	3	6	577448	577453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018655	AT	3	6	608186	608191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018655	TA	3	6	608262	608267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018655	AT	3	6	609014	609019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018655	AT	3	6	609177	609182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018655	AC	3	6	609854	609859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018655	AC	3	6	610082	610087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018655	TG	3	6	615875	615880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018655	TC	3	6	631294	631299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018655	CT	3	6	635397	635402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018655	TG	3	6	640496	640501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018655	TC	3	6	643453	643458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018655	TG	3	6	644230	644235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018655	TG	3	6	645555	645560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018655	AT	3	6	647054	647059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018655	CT	3	6	649335	649340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018655	TA	3	6	649345	649350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018655	AG	3	6	652125	652130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018655	AT	3	6	652139	652144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018655	TG	3	6	674086	674091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018655	CT	3	6	675635	675640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018655	AT	3	6	679314	679319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018655	CT	3	6	679765	679770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018655	GA	3	6	680457	680462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018655	TG	3	6	683323	683328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_018655	GT	3	6	683767	683772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_018655	TC	3	6	709142	709147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018655	GA	3	6	711466	711471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018655	GC	3	6	715841	715846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018655	GT	3	6	715969	715974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018655	TG	3	6	716002	716007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018655	GT	4	8	716208	716215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018655	TC	4	8	721653	721660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018655	TG	3	6	723631	723636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018655	CA	3	6	723652	723657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018655	AT	3	6	724222	724227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018655	TC	3	6	725298	725303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018655	CA	3	6	743573	743578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018655	TG	3	6	754037	754042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018655	AG	3	6	755623	755628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018655	TG	3	6	761647	761652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018655	CA	3	6	761761	761766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018655	TG	3	6	766147	766152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018655	AT	3	6	766363	766368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018655	TC	3	6	768679	768684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_018655	CT	3	6	776633	776638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018655	GA	3	6	779573	779578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018655	AC	3	6	783374	783379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.