MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	TCAAGT	12	72	6200	6271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018654	TCAATA	2	12	10109	10120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018654	GCACCT	2	12	12699	12710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410480072
4	NC_018654	CTGTTT	2	12	16817	16828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410480078
5	NC_018654	ATAAGT	2	12	20762	20773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018654	GCAGAA	2	12	25959	25970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018654	AGCTAG	2	12	26204	26215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018654	ATCTTG	2	12	28267	28278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018654	TCTTGC	2	12	28564	28575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410480092
10	NC_018654	ATGCTG	2	12	28980	28991	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018654	TGATGT	2	12	34542	34553	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410480095
12	NC_018654	TATTAA	2	12	37086	37097	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
13	NC_018654	TCCGCC	2	12	40341	40352	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410480100
14	NC_018654	CCAGTT	2	12	41230	41241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	410480100
15	NC_018654	CATCAG	2	12	41907	41918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410480101
16	NC_018654	GGAGCA	2	12	42220	42231	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	410480102
17	NC_018654	GCATCA	2	12	44526	44537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410480104
18	NC_018654	TCCTGT	2	12	51503	51514	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018654	ATGTGG	2	12	54776	54787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	410480112
20	NC_018654	TGGGGC	2	12	55082	55093	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	410480112
21	NC_018654	TGCCCT	2	12	55875	55886	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	410480112
22	NC_018654	AACACG	2	12	57323	57334	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410480114
23	NC_018654	TGCTCC	2	12	59194	59205	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	410480116
24	NC_018654	GCTGAT	2	12	59506	59517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410480117
25	NC_018654	GGCGGA	2	12	59638	59649	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018654	CGGCCC	2	12	66427	66438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018654	TATCCA	2	12	70144	70155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480133
28	NC_018654	GTGTCA	2	12	70342	70353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410480133
29	NC_018654	GACAGC	2	12	72979	72990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480137

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.