MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	AACA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018654	TACA	2	8	1568	1575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018654	AATT	2	8	5447	5454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018654	CAGC	2	8	5578	5585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018654	TTAT	2	8	10034	10041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018654	ATTA	2	8	10055	10062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018654	ATTG	2	8	10656	10663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018654	ATTT	2	8	11294	11301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018654	TCAA	2	8	17494	17501	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018654	ATGC	2	8	17736	17743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018654	TTTC	2	8	19220	19227	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018654	CTGG	2	8	20260	20267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018654	ATCA	2	8	20478	20485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018654	CTGA	2	8	20854	20861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018654	GTCT	2	8	23315	23322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018654	GCAA	2	8	23700	23707	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018654	CAGG	2	8	23751	23758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018654	GCTG	2	8	23812	23819	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018654	GTAT	2	8	25721	25728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018654	GTGG	2	8	25901	25908	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018654	ATCA	2	8	26138	26145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018654	GACA	2	8	26369	26376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018654	CATA	2	8	26408	26415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018654	AATA	2	8	26617	26624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018654	AAAC	2	8	28168	28175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018654	ATCA	2	8	28841	28848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018654	GCTG	2	8	29696	29703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018654	GGCT	2	8	29894	29901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018654	CCAA	2	8	30025	30032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018654	TCCA	2	8	30167	30174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018654	TAAT	2	8	30184	30191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018654	GCCT	2	8	30567	30574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018654	AACT	2	8	31094	31101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018654	GAAA	2	8	31273	31280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018654	ATGG	2	8	31421	31428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018654	TGAC	2	8	32577	32584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018654	CTGA	2	8	32720	32727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018654	AAAT	2	8	38006	38013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018654	AAAG	2	8	38097	38104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018654	TCCT	2	8	38267	38274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018654	CTTC	2	8	38348	38355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018654	TTAT	2	8	38807	38814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018654	AATG	2	8	42882	42889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018654	CATT	2	8	42946	42953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018654	ATTA	2	8	47242	47249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018654	TGGA	2	8	47259	47266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018654	TTCT	2	8	48305	48312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018654	ATTT	2	8	50580	50587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018654	AAAT	2	8	50797	50804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018654	ATTA	2	8	51304	51311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018654	TAAA	2	8	51460	51467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018654	CAGC	2	8	52205	52212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018654	GTCT	2	8	59681	59688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018654	GAAA	2	8	59691	59698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018654	ATTT	2	8	63055	63062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018654	CCCG	2	8	64348	64355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_018654	TGGC	2	8	64867	64874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018654	CATT	2	8	66243	66250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018654	GACA	2	8	66284	66291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018654	CCCT	2	8	66406	66413	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_018654	ATCA	2	8	66684	66691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018654	TCCT	2	8	68117	68124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018654	CAAA	2	8	68273	68280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018654	CACT	2	8	69332	69339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018654	ACTG	2	8	70483	70490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018654	TCAT	2	8	70707	70714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018654	TGTC	2	8	70900	70907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018654	TGTT	2	8	70979	70986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018654	GTCG	2	8	71337	71344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018654	TTTC	2	8	72515	72522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018654	ATAA	2	8	72837	72844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018654	AGTG	2	8	73645	73652	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018654	TCGC	2	8	73760	73767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018654	CAGC	2	8	73897	73904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.