MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	CTGA	2	8	568	575	25 %	25 %	25 %	25 %	410480054
2	NC_018654	ATCA	2	8	862	869	50 %	25 %	0 %	25 %	410480054
3	NC_018654	AACA	2	8	883	890	75 %	0 %	0 %	25 %	410480054
4	NC_018654	GAAA	3	12	2060	2071	75 %	0 %	25 %	0 %	410480056
5	NC_018654	AAAT	2	8	2687	2694	75 %	25 %	0 %	0 %	410480057
6	NC_018654	GTTA	2	8	2807	2814	25 %	50 %	25 %	0 %	410480057
7	NC_018654	CAGC	2	8	3321	3328	25 %	0 %	25 %	50 %	410480058
8	NC_018654	GTGA	2	8	4397	4404	25 %	25 %	50 %	0 %	410480060
9	NC_018654	AGAA	2	8	4632	4639	75 %	0 %	25 %	0 %	410480060
10	NC_018654	TAAA	2	8	5436	5443	75 %	25 %	0 %	0 %	410480061
11	NC_018654	ATAA	2	8	6070	6077	75 %	25 %	0 %	0 %	410480062
12	NC_018654	TTCG	2	8	6753	6760	0 %	50 %	25 %	25 %	410480063
13	NC_018654	AAAT	2	8	6824	6831	75 %	25 %	0 %	0 %	410480063
14	NC_018654	ATTA	2	8	7327	7334	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
15	NC_018654	CCAC	2	8	7494	7501	25 %	0 %	0 %	75 %	410480064
16	NC_018654	TATG	2	8	8190	8197	25 %	50 %	25 %	0 %	410480064
17	NC_018654	AAGT	2	8	8234	8241	50 %	25 %	25 %	0 %	410480064
18	NC_018654	CATT	2	8	8446	8453	25 %	50 %	0 %	25 %	410480064
19	NC_018654	GAAA	2	8	9385	9392	75 %	0 %	25 %	0 %	410480064
20	NC_018654	CAGT	2	8	9498	9505	25 %	25 %	25 %	25 %	410480064
21	NC_018654	TAGT	2	8	10184	10191	25 %	50 %	25 %	0 %	410480066
22	NC_018654	TCGC	2	8	11681	11688	0 %	25 %	25 %	50 %	410480069
23	NC_018654	CGGC	2	8	12815	12822	0 %	0 %	50 %	50 %	410480072
24	NC_018654	ATGC	2	8	12865	12872	25 %	25 %	25 %	25 %	410480072
25	NC_018654	CTGA	2	8	12918	12925	25 %	25 %	25 %	25 %	410480072
26	NC_018654	CATC	2	8	13085	13092	25 %	25 %	0 %	50 %	410480072
27	NC_018654	CGCC	2	8	13202	13209	0 %	0 %	25 %	75 %	410480072
28	NC_018654	GCTG	2	8	13378	13385	0 %	25 %	50 %	25 %	410480072
29	NC_018654	ACTG	2	8	13886	13893	25 %	25 %	25 %	25 %	410480073
30	NC_018654	AATC	2	8	14946	14953	50 %	25 %	0 %	25 %	410480076
31	NC_018654	CAGT	2	8	15099	15106	25 %	25 %	25 %	25 %	410480076
32	NC_018654	TTTA	2	8	15912	15919	25 %	75 %	0 %	0 %	410480077
33	NC_018654	AAAG	2	8	16068	16075	75 %	0 %	25 %	0 %	410480077
34	NC_018654	CATT	2	8	17890	17897	25 %	50 %	0 %	25 %	410480080
35	NC_018654	ATCA	2	8	17912	17919	50 %	25 %	0 %	25 %	410480080
36	NC_018654	AAGG	2	8	18010	18017	50 %	0 %	50 %	0 %	410480081
37	NC_018654	TGCA	2	8	18272	18279	25 %	25 %	25 %	25 %	410480082
38	NC_018654	GCTG	2	8	18459	18466	0 %	25 %	50 %	25 %	410480082
39	NC_018654	GTTC	2	8	19475	19482	0 %	50 %	25 %	25 %	410480083
40	NC_018654	ATGC	2	8	19659	19666	25 %	25 %	25 %	25 %	410480083
41	NC_018654	GAAC	2	8	19742	19749	50 %	0 %	25 %	25 %	410480083
42	NC_018654	TCAG	2	8	20108	20115	25 %	25 %	25 %	25 %	410480083
43	NC_018654	TTCC	2	8	20620	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	410480084
44	NC_018654	CTTC	2	8	21673	21680	0 %	50 %	0 %	50 %	410480085
45	NC_018654	TTAC	2	8	23258	23265	25 %	50 %	0 %	25 %	410480088
46	NC_018654	GGGC	2	8	23284	23291	0 %	0 %	75 %	25 %	410480088
47	NC_018654	TGGC	2	8	24028	24035	0 %	25 %	50 %	25 %	410480089
48	NC_018654	CTGG	2	8	25182	25189	0 %	25 %	50 %	25 %	410480089
49	NC_018654	AAGG	2	8	26856	26863	50 %	0 %	50 %	0 %	410480090
50	NC_018654	TGCA	2	8	27118	27125	25 %	25 %	25 %	25 %	410480091
51	NC_018654	GCTG	2	8	27305	27312	0 %	25 %	50 %	25 %	410480091
52	NC_018654	TTCT	3	12	33247	33258	0 %	75 %	0 %	25 %	410480094
53	NC_018654	TCTT	2	8	33601	33608	0 %	75 %	0 %	25 %	410480094
54	NC_018654	TTTC	2	8	34207	34214	0 %	75 %	0 %	25 %	410480095
55	NC_018654	ACAG	2	8	34358	34365	50 %	0 %	25 %	25 %	410480095
56	NC_018654	TTTA	2	8	34371	34378	25 %	75 %	0 %	0 %	410480095
57	NC_018654	TAAT	2	8	34491	34498	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
58	NC_018654	TTTA	2	8	34890	34897	25 %	75 %	0 %	0 %	410480095
59	NC_018654	GAAA	2	8	35068	35075	75 %	0 %	25 %	0 %	410480095
60	NC_018654	AACT	2	8	35157	35164	50 %	25 %	0 %	25 %	410480095
61	NC_018654	AAAG	2	8	35507	35514	75 %	0 %	25 %	0 %	410480096
62	NC_018654	CTAG	2	8	35553	35560	25 %	25 %	25 %	25 %	410480096
63	NC_018654	GAAT	2	8	36023	36030	50 %	25 %	25 %	0 %	410480096
64	NC_018654	GAGT	2	8	36777	36784	25 %	25 %	50 %	0 %	410480098
65	NC_018654	ATTG	2	8	37021	37028	25 %	50 %	25 %	0 %	410480098
66	NC_018654	GACA	2	8	39186	39193	50 %	0 %	25 %	25 %	410480099
67	NC_018654	AATC	2	8	39433	39440	50 %	25 %	0 %	25 %	410480099
68	NC_018654	ACCG	2	8	39833	39840	25 %	0 %	25 %	50 %	410480099
69	NC_018654	TCAG	2	8	40013	40020	25 %	25 %	25 %	25 %	410480099
70	NC_018654	TTTC	2	8	40292	40299	0 %	75 %	0 %	25 %	410480100
71	NC_018654	CTGC	2	8	40720	40727	0 %	25 %	25 %	50 %	410480100
72	NC_018654	AATA	2	8	42815	42822	75 %	25 %	0 %	0 %	410480103
73	NC_018654	CCAC	2	8	43707	43714	25 %	0 %	0 %	75 %	410480104
74	NC_018654	TAAA	2	8	43783	43790	75 %	25 %	0 %	0 %	410480104
75	NC_018654	CATT	2	8	43879	43886	25 %	50 %	0 %	25 %	410480104
76	NC_018654	AAGG	2	8	43964	43971	50 %	0 %	50 %	0 %	410480104
77	NC_018654	CTGG	2	8	44187	44194	0 %	25 %	50 %	25 %	410480104
78	NC_018654	CTGG	2	8	45173	45180	0 %	25 %	50 %	25 %	410480104
79	NC_018654	GGCT	2	8	45360	45367	0 %	25 %	50 %	25 %	410480104
80	NC_018654	CTTT	2	8	46156	46163	0 %	75 %	0 %	25 %	410480104
81	NC_018654	TAGT	2	8	46335	46342	25 %	50 %	25 %	0 %	410480104
82	NC_018654	AGGC	2	8	46862	46869	25 %	0 %	50 %	25 %	410480104
83	NC_018654	TCAG	2	8	47730	47737	25 %	25 %	25 %	25 %	410480105
84	NC_018654	ATTT	2	8	49324	49331	25 %	75 %	0 %	0 %	410480106
85	NC_018654	ATAA	2	8	50882	50889	75 %	25 %	0 %	0 %	410480108
86	NC_018654	GCCA	2	8	52072	52079	25 %	0 %	25 %	50 %	410480109
87	NC_018654	CGCA	2	8	52923	52930	25 %	0 %	25 %	50 %	410480111
88	NC_018654	TCGC	2	8	53430	53437	0 %	25 %	25 %	50 %	410480112
89	NC_018654	CTGG	2	8	53931	53938	0 %	25 %	50 %	25 %	410480112
90	NC_018654	CCGG	2	8	54135	54142	0 %	0 %	50 %	50 %	410480112
91	NC_018654	GCGA	2	8	54164	54171	25 %	0 %	50 %	25 %	410480112
92	NC_018654	GGGC	2	8	54271	54278	0 %	0 %	75 %	25 %	410480112
93	NC_018654	CCTG	2	8	54291	54298	0 %	25 %	25 %	50 %	410480112
94	NC_018654	CGGA	2	8	56144	56151	25 %	0 %	50 %	25 %	410480112
95	NC_018654	GTGG	2	8	57711	57718	0 %	25 %	75 %	0 %	410480114
96	NC_018654	GCCT	2	8	57860	57867	0 %	25 %	25 %	50 %	410480114
97	NC_018654	GCTG	2	8	57868	57875	0 %	25 %	50 %	25 %	410480114
98	NC_018654	TGCC	2	8	58531	58538	0 %	25 %	25 %	50 %	410480115
99	NC_018654	TGCA	2	8	60451	60458	25 %	25 %	25 %	25 %	410480119
100	NC_018654	TGGA	2	8	60589	60596	25 %	25 %	50 %	0 %	410480119
101	NC_018654	CCGG	2	8	61134	61141	0 %	0 %	50 %	50 %	410480119
102	NC_018654	GGCG	2	8	61479	61486	0 %	0 %	75 %	25 %	410480119
103	NC_018654	CCAG	2	8	61843	61850	25 %	0 %	25 %	50 %	410480120
104	NC_018654	CCGG	2	8	61958	61965	0 %	0 %	50 %	50 %	410480121
105	NC_018654	AGGC	2	8	62336	62343	25 %	0 %	50 %	25 %	410480121
106	NC_018654	TGGA	2	8	62714	62721	25 %	25 %	50 %	0 %	410480122
107	NC_018654	GCCA	2	8	63876	63883	25 %	0 %	25 %	50 %	410480123
108	NC_018654	CAGA	2	8	64551	64558	50 %	0 %	25 %	25 %	410480124
109	NC_018654	GCTC	2	8	65068	65075	0 %	25 %	25 %	50 %	410480125
110	NC_018654	TACC	2	8	65464	65471	25 %	25 %	0 %	50 %	410480127
111	NC_018654	CCGA	2	8	65507	65514	25 %	0 %	25 %	50 %	410480127
112	NC_018654	ACAG	2	8	65604	65611	50 %	0 %	25 %	25 %	410480127
113	NC_018654	AGTG	2	8	68528	68535	25 %	25 %	50 %	0 %	410480132
114	NC_018654	TGGA	2	8	68647	68654	25 %	25 %	50 %	0 %	410480132
115	NC_018654	GTGC	2	8	68688	68695	0 %	25 %	50 %	25 %	410480132
116	NC_018654	CGCC	2	8	68706	68713	0 %	0 %	25 %	75 %	410480132
117	NC_018654	CTGG	2	8	68979	68986	0 %	25 %	50 %	25 %	410480132
118	NC_018654	GACG	2	8	69072	69079	25 %	0 %	50 %	25 %	410480132
119	NC_018654	GACT	2	8	69484	69491	25 %	25 %	25 %	25 %	410480133
120	NC_018654	GAAT	2	8	70110	70117	50 %	25 %	25 %	0 %	410480133
121	NC_018654	CCCA	2	8	70122	70129	25 %	0 %	0 %	75 %	410480133
122	NC_018654	AATA	2	8	71611	71618	75 %	25 %	0 %	0 %	410480134
123	NC_018654	GGCG	2	8	71908	71915	0 %	0 %	75 %	25 %	410480135
124	NC_018654	TTCG	2	8	72111	72118	0 %	50 %	25 %	25 %	410480135
125	NC_018654	CTTC	2	8	72140	72147	0 %	50 %	0 %	50 %	410480136
126	NC_018654	GCTC	2	8	72273	72280	0 %	25 %	25 %	50 %	410480136

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.