MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	GGT	2	6	280	285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480054
2	NC_018654	TTG	2	6	314	319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480054
3	NC_018654	AAG	2	6	679	684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480054
4	NC_018654	TGA	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480054
5	NC_018654	AGG	2	6	828	833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480054
6	NC_018654	GAA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480054
7	NC_018654	TGG	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480055
8	NC_018654	CTT	3	9	1051	1059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480055
9	NC_018654	GTC	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480055
10	NC_018654	TGA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
11	NC_018654	GGA	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480056
12	NC_018654	GAT	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
13	NC_018654	TGT	2	6	1936	1941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480056
14	NC_018654	CAG	2	6	1961	1966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480056
15	NC_018654	CAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480056
16	NC_018654	TTC	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480056
17	NC_018654	GAT	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
18	NC_018654	GGT	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480056
19	NC_018654	TTA	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480056
20	NC_018654	ATG	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
21	NC_018654	TCA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480056
22	NC_018654	TGG	3	9	2542	2550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480056
23	NC_018654	GAA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480056
24	NC_018654	TGA	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
25	NC_018654	GGT	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480056
26	NC_018654	TGA	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480056
27	NC_018654	GCT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480057
28	NC_018654	GCG	2	6	2820	2825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480057
29	NC_018654	GAT	2	6	2892	2897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480057
30	NC_018654	TAA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480057
31	NC_018654	CTC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480057
32	NC_018654	AGA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480057
33	NC_018654	TCA	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480058
34	NC_018654	AAT	2	6	3284	3289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480058
35	NC_018654	GTC	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480059
36	NC_018654	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480059
37	NC_018654	CTG	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480059
38	NC_018654	GGT	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480059
39	NC_018654	CTT	2	6	3647	3652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480059
40	NC_018654	TTG	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480059
41	NC_018654	TGA	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480059
42	NC_018654	TCA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480059
43	NC_018654	TCT	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480059
44	NC_018654	CAG	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480060
45	NC_018654	CAG	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480060
46	NC_018654	CTG	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480060
47	NC_018654	AAC	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480060
48	NC_018654	GCG	2	6	4855	4860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480061
49	NC_018654	TCC	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480061
50	NC_018654	TGA	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480061
51	NC_018654	GTT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480061
52	NC_018654	GAC	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480061
53	NC_018654	ATC	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480061
54	NC_018654	CTG	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480061
55	NC_018654	TGC	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480061
56	NC_018654	ACG	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480061
57	NC_018654	GAA	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480061
58	NC_018654	GAA	2	6	5286	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480061
59	NC_018654	TAA	2	6	6060	6065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480062
60	NC_018654	AGA	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480062
61	NC_018654	GAA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480063
62	NC_018654	CAA	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480063
63	NC_018654	TTC	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480063
64	NC_018654	TTA	2	6	6448	6453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480063
65	NC_018654	TAT	2	6	6490	6495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480063
66	NC_018654	GCC	2	6	6568	6573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480063
67	NC_018654	TCC	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480063
68	NC_018654	AGA	2	6	6677	6682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480063
69	NC_018654	GAT	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480063
70	NC_018654	TCT	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480063
71	NC_018654	GTG	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480063
72	NC_018654	GGT	2	6	6996	7001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480063
73	NC_018654	AGA	2	6	7347	7352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480064
74	NC_018654	AGA	2	6	7437	7442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480064
75	NC_018654	GAT	2	6	7534	7539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
76	NC_018654	TTG	2	6	7555	7560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480064
77	NC_018654	TTC	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480064
78	NC_018654	TGA	2	6	7845	7850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
79	NC_018654	GGT	2	6	8011	8016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
80	NC_018654	TAC	2	6	8076	8081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480064
81	NC_018654	TGG	2	6	8223	8228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
82	NC_018654	ACA	2	6	8328	8333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480064
83	NC_018654	TGC	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480064
84	NC_018654	ATA	2	6	8504	8509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
85	NC_018654	CGG	2	6	8515	8520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480064
86	NC_018654	CGG	2	6	8574	8579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480064
87	NC_018654	TGA	2	6	8583	8588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
88	NC_018654	AAT	3	9	8677	8685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
89	NC_018654	ATT	2	6	8693	8698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480064
90	NC_018654	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
91	NC_018654	ATG	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
92	NC_018654	GGT	2	6	8953	8958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
93	NC_018654	TGA	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
94	NC_018654	TGC	2	6	9093	9098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480064
95	NC_018654	TGG	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480064
96	NC_018654	ATT	2	6	9199	9204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480064
97	NC_018654	ATA	2	6	9230	9235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480064
98	NC_018654	GTT	2	6	9373	9378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480064
99	NC_018654	GAT	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480064
100	NC_018654	TTA	2	6	9653	9658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480065
101	NC_018654	GAA	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480065
102	NC_018654	TCT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480065
103	NC_018654	GAA	2	6	9923	9928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480065
104	NC_018654	GTG	2	6	10002	10007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480065
105	NC_018654	GAA	2	6	10154	10159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480066
106	NC_018654	CAA	2	6	10222	10227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480066
107	NC_018654	CTC	2	6	10286	10291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480066
108	NC_018654	CAA	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480066
109	NC_018654	TAA	2	6	10407	10412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480066
110	NC_018654	TGC	2	6	10617	10622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480066
111	NC_018654	AAG	2	6	10811	10816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480067
112	NC_018654	CTG	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480067
113	NC_018654	TGT	2	6	11001	11006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480067
114	NC_018654	ACG	2	6	11017	11022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480067
115	NC_018654	TTC	2	6	11035	11040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480067
116	NC_018654	AGT	2	6	11092	11097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480067
117	NC_018654	ACA	2	6	11161	11166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480068
118	NC_018654	ACT	2	6	11181	11186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480068
119	NC_018654	GCA	2	6	11206	11211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480068
120	NC_018654	AGT	2	6	11404	11409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480069
121	NC_018654	TCC	2	6	11476	11481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480069
122	NC_018654	CAG	2	6	11492	11497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480069
123	NC_018654	TGC	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480069
124	NC_018654	TGT	2	6	11571	11576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480069
125	NC_018654	ACA	2	6	11587	11592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480069
126	NC_018654	GCT	2	6	11608	11613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480069
127	NC_018654	CTT	2	6	11619	11624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480069
128	NC_018654	CTG	2	6	11783	11788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480069
129	NC_018654	GAT	2	6	11805	11810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480069
130	NC_018654	CTG	2	6	11971	11976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480070
131	NC_018654	CCT	2	6	12000	12005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480070
132	NC_018654	TGC	2	6	12089	12094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480070
133	NC_018654	GCT	2	6	12126	12131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480070
134	NC_018654	TCT	2	6	12215	12220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480071
135	NC_018654	GAC	2	6	12221	12226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480071
136	NC_018654	CTG	2	6	12233	12238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480071
137	NC_018654	CCG	2	6	12344	12349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480071
138	NC_018654	CCG	2	6	12383	12388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480071
139	NC_018654	GCG	2	6	12549	12554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480072
140	NC_018654	TGC	2	6	12558	12563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480072
141	NC_018654	GCG	2	6	12571	12576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480072
142	NC_018654	CCG	2	6	12604	12609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480072
143	NC_018654	GCT	2	6	12746	12751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480072
144	NC_018654	CTG	2	6	12846	12851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480072
145	NC_018654	GCT	2	6	12878	12883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480072
146	NC_018654	TGA	2	6	12941	12946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480072
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149	NC_018654	GTG	2	6	13117	13122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480072
150	NC_018654	GCC	2	6	13185	13190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480072
151	NC_018654	GGA	2	6	13253	13258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480072
152	NC_018654	CGG	2	6	13315	13320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480072
153	NC_018654	GCT	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480072
154	NC_018654	GAT	2	6	13479	13484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480072
155	NC_018654	TTC	2	6	13560	13565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480072
156	NC_018654	GGA	2	6	13578	13583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480072
157	NC_018654	GCT	2	6	13595	13600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480072
158	NC_018654	ATA	2	6	13822	13827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480073
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162	NC_018654	CGT	2	6	14231	14236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480074
163	NC_018654	ATC	2	6	14283	14288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480074
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199	NC_018654	ATC	2	6	18041	18046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480081
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203	NC_018654	CAT	2	6	18391	18396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480082
204	NC_018654	AGC	2	6	18417	18422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480082
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230	NC_018654	CAT	2	6	20696	20701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480084
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238	NC_018654	TAT	2	6	21519	21524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480085
239	NC_018654	GCT	2	6	21558	21563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480085
240	NC_018654	TCT	2	6	21599	21604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480085
241	NC_018654	CAC	2	6	22719	22724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480086
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243	NC_018654	CTG	2	6	22857	22862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480087
244	NC_018654	CAT	2	6	22953	22958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480087
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246	NC_018654	GTT	2	6	23069	23074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480087
247	NC_018654	GCT	2	6	24000	24005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480089
248	NC_018654	GCG	2	6	24040	24045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480089
249	NC_018654	TCA	2	6	24058	24063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480089
250	NC_018654	CCA	2	6	24348	24353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480089
251	NC_018654	CAT	2	6	24451	24456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480089
252	NC_018654	CTG	2	6	24460	24465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480089
253	NC_018654	CGC	2	6	24478	24483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480089
254	NC_018654	CTG	2	6	24511	24516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480089
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258	NC_018654	CAT	2	6	24615	24620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480089
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378	NC_018654	CAA	2	6	39883	39888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480099
379	NC_018654	CGG	2	6	39950	39955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480099
380	NC_018654	TGC	2	6	39996	40001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480099
381	NC_018654	ATC	2	6	40005	40010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480099
382	NC_018654	TCA	2	6	40359	40364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480100
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384	NC_018654	CCG	2	6	40588	40593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480100
385	NC_018654	CGC	2	6	40669	40674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480100
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406	NC_018654	CGG	2	6	42658	42663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480103
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410	NC_018654	GTA	2	6	42803	42808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480103
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451	NC_018654	ACT	2	6	46889	46894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480104
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454	NC_018654	ATT	2	6	47776	47781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480105
455	NC_018654	ATG	2	6	47850	47855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480105
456	NC_018654	TGT	2	6	47888	47893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480105
457	NC_018654	GTT	2	6	47923	47928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480105
458	NC_018654	ATC	2	6	48939	48944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480106
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470	NC_018654	GAT	2	6	49571	49576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480106
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482	NC_018654	CGG	2	6	52489	52494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480110
483	NC_018654	CAC	2	6	52511	52516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480110
484	NC_018654	AGG	2	6	52534	52539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480110
485	NC_018654	GGC	2	6	52787	52792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480111
486	NC_018654	GCA	2	6	52967	52972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480111
487	NC_018654	GCC	2	6	53060	53065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480111
488	NC_018654	AGC	2	6	53122	53127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480111
489	NC_018654	CAT	2	6	53213	53218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480111
490	NC_018654	GCC	2	6	53344	53349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480111
491	NC_018654	ATG	2	6	53380	53385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480112
492	NC_018654	GCT	2	6	53419	53424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480112
493	NC_018654	CGT	2	6	53488	53493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480112
494	NC_018654	CTG	2	6	53581	53586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480112
495	NC_018654	CCA	2	6	53723	53728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480112
496	NC_018654	TCA	2	6	53729	53734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480112
497	NC_018654	GGT	2	6	54093	54098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480112
498	NC_018654	TCC	2	6	54106	54111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480112
499	NC_018654	CAG	2	6	54117	54122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480112
500	NC_018654	CGG	2	6	54210	54215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480112

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