MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	AT	3	6	110	115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018654	AT	3	6	1232	1237	50 %	50 %	0 %	0 %	410480055
3	NC_018654	AG	3	6	1251	1256	50 %	0 %	50 %	0 %	410480055
4	NC_018654	TG	3	6	1317	1322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018654	GT	3	6	1658	1663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018654	TG	3	6	2535	2540	0 %	50 %	50 %	0 %	410480056
7	NC_018654	GC	3	6	2798	2803	0 %	0 %	50 %	50 %	410480057
8	NC_018654	TG	3	6	3416	3421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018654	GA	3	6	4022	4027	50 %	0 %	50 %	0 %	410480059
10	NC_018654	GC	3	6	4248	4253	0 %	0 %	50 %	50 %	410480059
11	NC_018654	CA	3	6	4257	4262	50 %	0 %	0 %	50 %	410480059
12	NC_018654	GC	3	6	4626	4631	0 %	0 %	50 %	50 %	410480060
13	NC_018654	CT	3	6	4849	4854	0 %	50 %	0 %	50 %	410480061
14	NC_018654	TC	4	8	4898	4905	0 %	50 %	0 %	50 %	410480061
15	NC_018654	TC	3	6	5369	5374	0 %	50 %	0 %	50 %	410480061
16	NC_018654	GT	3	6	5857	5862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018654	TA	3	6	6912	6917	50 %	50 %	0 %	0 %	410480063
18	NC_018654	TA	3	6	7046	7051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018654	AT	3	6	7253	7258	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
20	NC_018654	AT	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
21	NC_018654	TA	3	6	8614	8619	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
22	NC_018654	AC	3	6	8996	9001	50 %	0 %	0 %	50 %	410480064
23	NC_018654	GT	3	6	9568	9573	0 %	50 %	50 %	0 %	410480064
24	NC_018654	AG	3	6	9697	9702	50 %	0 %	50 %	0 %	410480065
25	NC_018654	TA	3	6	9770	9775	50 %	50 %	0 %	0 %	410480065
26	NC_018654	GA	3	6	9889	9894	50 %	0 %	50 %	0 %	410480065
27	NC_018654	AT	4	8	9985	9992	50 %	50 %	0 %	0 %	410480065
28	NC_018654	AT	3	6	10923	10928	50 %	50 %	0 %	0 %	410480067
29	NC_018654	AG	3	6	11626	11631	50 %	0 %	50 %	0 %	410480069
30	NC_018654	AG	3	6	12428	12433	50 %	0 %	50 %	0 %	410480071
31	NC_018654	AT	3	6	15668	15673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018654	TA	3	6	16784	16789	50 %	50 %	0 %	0 %	410480078
33	NC_018654	AT	3	6	16829	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	410480078
34	NC_018654	AT	3	6	17211	17216	50 %	50 %	0 %	0 %	410480079
35	NC_018654	TC	3	6	17818	17823	0 %	50 %	0 %	50 %	410480080
36	NC_018654	GA	3	6	19046	19051	50 %	0 %	50 %	0 %	410480082
37	NC_018654	AT	3	6	21323	21328	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
38	NC_018654	AT	3	6	21375	21380	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
39	NC_018654	AT	3	6	21620	21625	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
40	NC_018654	CT	3	6	21632	21637	0 %	50 %	0 %	50 %	410480085
41	NC_018654	TA	3	6	21713	21718	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
42	NC_018654	GC	3	6	22321	22326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018654	AC	3	6	25738	25743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018654	TC	3	6	26576	26581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018654	TA	3	6	26597	26602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018654	AT	3	6	26720	26725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018654	GA	3	6	27892	27897	50 %	0 %	50 %	0 %	410480091
48	NC_018654	AT	3	6	28240	28245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018654	GA	3	6	28259	28264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018654	TA	3	6	28664	28669	50 %	50 %	0 %	0 %	410480092
51	NC_018654	AT	3	6	30230	30235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018654	GC	3	6	30919	30924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018654	AT	3	6	32827	32832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018654	CA	3	6	32849	32854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018654	TA	3	6	32884	32889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018654	TA	4	8	32918	32925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018654	AT	3	6	33212	33217	50 %	50 %	0 %	0 %	410480094
58	NC_018654	AG	3	6	33625	33630	50 %	0 %	50 %	0 %	410480094
59	NC_018654	AG	3	6	33646	33651	50 %	0 %	50 %	0 %	410480094
60	NC_018654	TA	3	6	34325	34330	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
61	NC_018654	AT	3	6	34456	34461	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
62	NC_018654	GA	3	6	34556	34561	50 %	0 %	50 %	0 %	410480095
63	NC_018654	AT	3	6	34643	34648	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
64	NC_018654	GA	3	6	34723	34728	50 %	0 %	50 %	0 %	410480095
65	NC_018654	TA	3	6	35186	35191	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
66	NC_018654	TA	3	6	35829	35834	50 %	50 %	0 %	0 %	410480096
67	NC_018654	AT	3	6	36291	36296	50 %	50 %	0 %	0 %	410480097
68	NC_018654	TC	3	6	36471	36476	0 %	50 %	0 %	50 %	410480097
69	NC_018654	AT	3	6	36920	36925	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
70	NC_018654	TA	3	6	37361	37366	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
71	NC_018654	AT	3	6	37653	37658	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
72	NC_018654	CT	3	6	38089	38094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018654	AT	3	6	38296	38301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018654	TC	4	8	38307	38314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018654	TA	3	6	38387	38392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018654	TA	3	6	38856	38861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018654	TC	3	6	39223	39228	0 %	50 %	0 %	50 %	410480099
78	NC_018654	TA	3	6	39825	39830	50 %	50 %	0 %	0 %	410480099
79	NC_018654	TC	3	6	40413	40418	0 %	50 %	0 %	50 %	410480100
80	NC_018654	GT	3	6	40440	40445	0 %	50 %	50 %	0 %	410480100
81	NC_018654	AT	3	6	40611	40616	50 %	50 %	0 %	0 %	410480100
82	NC_018654	AT	3	6	40854	40859	50 %	50 %	0 %	0 %	410480100
83	NC_018654	GT	3	6	40903	40908	0 %	50 %	50 %	0 %	410480100
84	NC_018654	AG	3	6	41663	41668	50 %	0 %	50 %	0 %	410480100
85	NC_018654	TA	3	6	42615	42620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018654	TC	3	6	43279	43284	0 %	50 %	0 %	50 %	410480104
87	NC_018654	TC	3	6	44891	44896	0 %	50 %	0 %	50 %	410480104
88	NC_018654	GC	3	6	46513	46518	0 %	0 %	50 %	50 %	410480104
89	NC_018654	AT	3	6	48156	48161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018654	AT	3	6	48920	48925	50 %	50 %	0 %	0 %	410480106
91	NC_018654	GT	3	6	49167	49172	0 %	50 %	50 %	0 %	410480106
92	NC_018654	AT	4	8	49775	49782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018654	TG	4	8	49844	49851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018654	TG	3	6	51415	51420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018654	AT	3	6	51781	51786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018654	AG	3	6	53805	53810	50 %	0 %	50 %	0 %	410480112
97	NC_018654	CA	3	6	54396	54401	50 %	0 %	0 %	50 %	410480112
98	NC_018654	GA	3	6	54895	54900	50 %	0 %	50 %	0 %	410480112
99	NC_018654	CA	3	6	55017	55022	50 %	0 %	0 %	50 %	410480112
100	NC_018654	GT	3	6	55895	55900	0 %	50 %	50 %	0 %	410480112
101	NC_018654	AC	3	6	56015	56020	50 %	0 %	0 %	50 %	410480112
102	NC_018654	GA	3	6	56759	56764	50 %	0 %	50 %	0 %	410480112
103	NC_018654	AC	3	6	58383	58388	50 %	0 %	0 %	50 %	410480115
104	NC_018654	TG	3	6	58512	58517	0 %	50 %	50 %	0 %	410480115
105	NC_018654	AG	3	6	58688	58693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018654	AT	3	6	59587	59592	50 %	50 %	0 %	0 %	410480117
107	NC_018654	GA	3	6	61868	61873	50 %	0 %	50 %	0 %	410480120
108	NC_018654	CA	3	6	62182	62187	50 %	0 %	0 %	50 %	410480121
109	NC_018654	TG	3	6	63015	63020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018654	AT	3	6	63086	63091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018654	TC	3	6	63293	63298	0 %	50 %	0 %	50 %	410480123
112	NC_018654	GC	3	6	65576	65581	0 %	0 %	50 %	50 %	410480127
113	NC_018654	CT	3	6	66623	66628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018654	CA	3	6	67379	67384	50 %	0 %	0 %	50 %	410480129
115	NC_018654	TG	4	8	67402	67409	0 %	50 %	50 %	0 %	410480130
116	NC_018654	TC	3	6	67522	67527	0 %	50 %	0 %	50 %	410480130
117	NC_018654	GA	3	6	67589	67594	50 %	0 %	50 %	0 %	410480130
118	NC_018654	AT	3	6	67818	67823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018654	CT	3	6	68100	68105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018654	CG	3	6	68287	68292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018654	CA	3	6	68908	68913	50 %	0 %	0 %	50 %	410480132
122	NC_018654	TA	3	6	69134	69139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018654	CT	3	6	69744	69749	0 %	50 %	0 %	50 %	410480133
124	NC_018654	AT	3	6	69921	69926	50 %	50 %	0 %	0 %	410480133
125	NC_018654	CA	3	6	70042	70047	50 %	0 %	0 %	50 %	410480133
126	NC_018654	TG	3	6	71465	71470	0 %	50 %	50 %	0 %	410480134
127	NC_018654	CT	3	6	71747	71752	0 %	50 %	0 %	50 %	410480135
128	NC_018654	AT	3	6	72383	72388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018654	AT	3	6	72905	72910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018654	AG	4	8	73199	73206	50 %	0 %	50 %	0 %	410480138
131	NC_018654	GC	3	6	73718	73723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.