MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	AT	3	6	110	115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018654	TG	3	6	1317	1322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018654	GT	3	6	1658	1663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018654	TG	3	6	3416	3421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018654	GT	3	6	5857	5862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018654	TA	3	6	7046	7051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018654	AT	3	6	15668	15673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018654	GC	3	6	22321	22326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018654	AC	3	6	25738	25743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018654	TC	3	6	26576	26581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018654	TA	3	6	26597	26602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018654	AT	3	6	26720	26725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018654	AT	3	6	28240	28245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018654	GA	3	6	28259	28264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018654	AT	3	6	30230	30235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018654	GC	3	6	30919	30924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018654	AT	3	6	32827	32832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018654	CA	3	6	32849	32854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018654	TA	3	6	32884	32889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018654	TA	4	8	32918	32925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018654	CT	3	6	38089	38094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018654	AT	3	6	38296	38301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018654	TC	4	8	38307	38314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018654	TA	3	6	38387	38392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018654	TA	3	6	38856	38861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018654	TA	3	6	42615	42620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018654	AT	3	6	48156	48161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018654	AT	4	8	49775	49782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018654	TG	4	8	49844	49851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018654	TG	3	6	51415	51420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018654	AT	3	6	51781	51786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018654	AG	3	6	58688	58693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018654	TG	3	6	63015	63020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018654	AT	3	6	63086	63091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018654	CT	3	6	66623	66628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018654	AT	3	6	67818	67823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018654	CT	3	6	68100	68105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018654	CG	3	6	68287	68292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018654	TA	3	6	69134	69139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018654	AT	3	6	72383	72388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018654	AT	3	6	72905	72910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018654	GC	3	6	73718	73723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.