MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	AT	3	6	1232	1237	50 %	50 %	0 %	0 %	410480055
2	NC_018654	AG	3	6	1251	1256	50 %	0 %	50 %	0 %	410480055
3	NC_018654	TG	3	6	2535	2540	0 %	50 %	50 %	0 %	410480056
4	NC_018654	GC	3	6	2798	2803	0 %	0 %	50 %	50 %	410480057
5	NC_018654	GA	3	6	4022	4027	50 %	0 %	50 %	0 %	410480059
6	NC_018654	GC	3	6	4248	4253	0 %	0 %	50 %	50 %	410480059
7	NC_018654	CA	3	6	4257	4262	50 %	0 %	0 %	50 %	410480059
8	NC_018654	GC	3	6	4626	4631	0 %	0 %	50 %	50 %	410480060
9	NC_018654	CT	3	6	4849	4854	0 %	50 %	0 %	50 %	410480061
10	NC_018654	TC	4	8	4898	4905	0 %	50 %	0 %	50 %	410480061
11	NC_018654	TC	3	6	5369	5374	0 %	50 %	0 %	50 %	410480061
12	NC_018654	TA	3	6	6912	6917	50 %	50 %	0 %	0 %	410480063
13	NC_018654	AT	3	6	7253	7258	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
14	NC_018654	AT	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
15	NC_018654	TA	3	6	8614	8619	50 %	50 %	0 %	0 %	410480064
16	NC_018654	AC	3	6	8996	9001	50 %	0 %	0 %	50 %	410480064
17	NC_018654	GT	3	6	9568	9573	0 %	50 %	50 %	0 %	410480064
18	NC_018654	AG	3	6	9697	9702	50 %	0 %	50 %	0 %	410480065
19	NC_018654	TA	3	6	9770	9775	50 %	50 %	0 %	0 %	410480065
20	NC_018654	GA	3	6	9889	9894	50 %	0 %	50 %	0 %	410480065
21	NC_018654	AT	4	8	9985	9992	50 %	50 %	0 %	0 %	410480065
22	NC_018654	AT	3	6	10923	10928	50 %	50 %	0 %	0 %	410480067
23	NC_018654	AG	3	6	11626	11631	50 %	0 %	50 %	0 %	410480069
24	NC_018654	AG	3	6	12428	12433	50 %	0 %	50 %	0 %	410480071
25	NC_018654	TA	3	6	16784	16789	50 %	50 %	0 %	0 %	410480078
26	NC_018654	AT	3	6	16829	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	410480078
27	NC_018654	AT	3	6	17211	17216	50 %	50 %	0 %	0 %	410480079
28	NC_018654	TC	3	6	17818	17823	0 %	50 %	0 %	50 %	410480080
29	NC_018654	GA	3	6	19046	19051	50 %	0 %	50 %	0 %	410480082
30	NC_018654	AT	3	6	21323	21328	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
31	NC_018654	AT	3	6	21375	21380	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
32	NC_018654	AT	3	6	21620	21625	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
33	NC_018654	CT	3	6	21632	21637	0 %	50 %	0 %	50 %	410480085
34	NC_018654	TA	3	6	21713	21718	50 %	50 %	0 %	0 %	410480085
35	NC_018654	GA	3	6	27892	27897	50 %	0 %	50 %	0 %	410480091
36	NC_018654	TA	3	6	28664	28669	50 %	50 %	0 %	0 %	410480092
37	NC_018654	AT	3	6	33212	33217	50 %	50 %	0 %	0 %	410480094
38	NC_018654	AG	3	6	33625	33630	50 %	0 %	50 %	0 %	410480094
39	NC_018654	AG	3	6	33646	33651	50 %	0 %	50 %	0 %	410480094
40	NC_018654	TA	3	6	34325	34330	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
41	NC_018654	AT	3	6	34456	34461	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
42	NC_018654	GA	3	6	34556	34561	50 %	0 %	50 %	0 %	410480095
43	NC_018654	AT	3	6	34643	34648	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
44	NC_018654	GA	3	6	34723	34728	50 %	0 %	50 %	0 %	410480095
45	NC_018654	TA	3	6	35186	35191	50 %	50 %	0 %	0 %	410480095
46	NC_018654	TA	3	6	35829	35834	50 %	50 %	0 %	0 %	410480096
47	NC_018654	AT	3	6	36291	36296	50 %	50 %	0 %	0 %	410480097
48	NC_018654	TC	3	6	36471	36476	0 %	50 %	0 %	50 %	410480097
49	NC_018654	AT	3	6	36920	36925	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
50	NC_018654	TA	3	6	37361	37366	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
51	NC_018654	AT	3	6	37653	37658	50 %	50 %	0 %	0 %	410480098
52	NC_018654	TC	3	6	39223	39228	0 %	50 %	0 %	50 %	410480099
53	NC_018654	TA	3	6	39825	39830	50 %	50 %	0 %	0 %	410480099
54	NC_018654	TC	3	6	40413	40418	0 %	50 %	0 %	50 %	410480100
55	NC_018654	GT	3	6	40440	40445	0 %	50 %	50 %	0 %	410480100
56	NC_018654	AT	3	6	40611	40616	50 %	50 %	0 %	0 %	410480100
57	NC_018654	AT	3	6	40854	40859	50 %	50 %	0 %	0 %	410480100
58	NC_018654	GT	3	6	40903	40908	0 %	50 %	50 %	0 %	410480100
59	NC_018654	AG	3	6	41663	41668	50 %	0 %	50 %	0 %	410480100
60	NC_018654	TC	3	6	43279	43284	0 %	50 %	0 %	50 %	410480104
61	NC_018654	TC	3	6	44891	44896	0 %	50 %	0 %	50 %	410480104
62	NC_018654	GC	3	6	46513	46518	0 %	0 %	50 %	50 %	410480104
63	NC_018654	AT	3	6	48920	48925	50 %	50 %	0 %	0 %	410480106
64	NC_018654	GT	3	6	49167	49172	0 %	50 %	50 %	0 %	410480106
65	NC_018654	AG	3	6	53805	53810	50 %	0 %	50 %	0 %	410480112
66	NC_018654	CA	3	6	54396	54401	50 %	0 %	0 %	50 %	410480112
67	NC_018654	GA	3	6	54895	54900	50 %	0 %	50 %	0 %	410480112
68	NC_018654	CA	3	6	55017	55022	50 %	0 %	0 %	50 %	410480112
69	NC_018654	GT	3	6	55895	55900	0 %	50 %	50 %	0 %	410480112
70	NC_018654	AC	3	6	56015	56020	50 %	0 %	0 %	50 %	410480112
71	NC_018654	GA	3	6	56759	56764	50 %	0 %	50 %	0 %	410480112
72	NC_018654	AC	3	6	58383	58388	50 %	0 %	0 %	50 %	410480115
73	NC_018654	TG	3	6	58512	58517	0 %	50 %	50 %	0 %	410480115
74	NC_018654	AT	3	6	59587	59592	50 %	50 %	0 %	0 %	410480117
75	NC_018654	GA	3	6	61868	61873	50 %	0 %	50 %	0 %	410480120
76	NC_018654	CA	3	6	62182	62187	50 %	0 %	0 %	50 %	410480121
77	NC_018654	TC	3	6	63293	63298	0 %	50 %	0 %	50 %	410480123
78	NC_018654	GC	3	6	65576	65581	0 %	0 %	50 %	50 %	410480127
79	NC_018654	CA	3	6	67379	67384	50 %	0 %	0 %	50 %	410480129
80	NC_018654	TG	4	8	67402	67409	0 %	50 %	50 %	0 %	410480130
81	NC_018654	TC	3	6	67522	67527	0 %	50 %	0 %	50 %	410480130
82	NC_018654	GA	3	6	67589	67594	50 %	0 %	50 %	0 %	410480130
83	NC_018654	CA	3	6	68908	68913	50 %	0 %	0 %	50 %	410480132
84	NC_018654	CT	3	6	69744	69749	0 %	50 %	0 %	50 %	410480133
85	NC_018654	AT	3	6	69921	69926	50 %	50 %	0 %	0 %	410480133
86	NC_018654	CA	3	6	70042	70047	50 %	0 %	0 %	50 %	410480133
87	NC_018654	TG	3	6	71465	71470	0 %	50 %	50 %	0 %	410480134
88	NC_018654	CT	3	6	71747	71752	0 %	50 %	0 %	50 %	410480135
89	NC_018654	AG	4	8	73199	73206	50 %	0 %	50 %	0 %	410480138

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.