MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	T	6	6	80	85	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018654	A	6	6	161	166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018654	T	8	8	1618	1625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018654	T	6	6	1667	1672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018654	A	8	8	2069	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	410480056
6	NC_018654	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	410480059
7	NC_018654	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	410480061
8	NC_018654	A	6	6	5357	5362	100 %	0 %	0 %	0 %	410480061
9	NC_018654	A	6	6	5406	5411	100 %	0 %	0 %	0 %	410480061
10	NC_018654	T	7	7	6164	6170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018654	A	7	7	6505	6511	100 %	0 %	0 %	0 %	410480063
12	NC_018654	A	7	7	6692	6698	100 %	0 %	0 %	0 %	410480063
13	NC_018654	G	10	10	6957	6966	0 %	0 %	100 %	0 %	410480063
14	NC_018654	G	6	6	7156	7161	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018654	A	9	9	7269	7277	100 %	0 %	0 %	0 %	410480064
16	NC_018654	A	7	7	7382	7388	100 %	0 %	0 %	0 %	410480064
17	NC_018654	G	6	6	7575	7580	0 %	0 %	100 %	0 %	410480064
18	NC_018654	G	8	8	8766	8773	0 %	0 %	100 %	0 %	410480064
19	NC_018654	A	6	6	9531	9536	100 %	0 %	0 %	0 %	410480064
20	NC_018654	G	12	12	9863	9874	0 %	0 %	100 %	0 %	410480065
21	NC_018654	T	6	6	10092	10097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018654	A	6	6	10143	10148	100 %	0 %	0 %	0 %	410480066
23	NC_018654	G	7	7	10201	10207	0 %	0 %	100 %	0 %	410480066
24	NC_018654	A	6	6	10519	10524	100 %	0 %	0 %	0 %	410480066
25	NC_018654	A	7	7	14301	14307	100 %	0 %	0 %	0 %	410480074
26	NC_018654	T	6	6	14810	14815	0 %	100 %	0 %	0 %	410480076
27	NC_018654	T	6	6	14962	14967	0 %	100 %	0 %	0 %	410480076
28	NC_018654	T	6	6	15090	15095	0 %	100 %	0 %	0 %	410480076
29	NC_018654	T	8	8	15600	15607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018654	T	6	6	15644	15649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018654	T	6	6	15803	15808	0 %	100 %	0 %	0 %	410480077
32	NC_018654	A	7	7	16320	16326	100 %	0 %	0 %	0 %	410480077
33	NC_018654	A	8	8	16590	16597	100 %	0 %	0 %	0 %	410480077
34	NC_018654	T	7	7	16698	16704	0 %	100 %	0 %	0 %	410480077
35	NC_018654	A	6	6	16795	16800	100 %	0 %	0 %	0 %	410480078
36	NC_018654	A	6	6	17969	17974	100 %	0 %	0 %	0 %	410480081
37	NC_018654	A	6	6	19130	19135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018654	T	6	6	19667	19672	0 %	100 %	0 %	0 %	410480083
39	NC_018654	T	6	6	20393	20398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018654	A	6	6	21806	21811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018654	A	6	6	22843	22848	100 %	0 %	0 %	0 %	410480086
42	NC_018654	A	6	6	23154	23159	100 %	0 %	0 %	0 %	410480087
43	NC_018654	C	6	6	26377	26382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_018654	T	7	7	26560	26566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018654	A	6	6	26707	26712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018654	A	6	6	27976	27981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018654	A	6	6	28331	28336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018654	A	6	6	28857	28862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018654	A	6	6	29355	29360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018654	A	7	7	30049	30055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018654	T	8	8	30068	30075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018654	A	6	6	30121	30126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018654	G	10	10	30830	30839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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55	NC_018654	A	8	8	31057	31064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018654	A	6	6	31301	31306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018654	G	6	6	31361	31366	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018654	G	6	6	31427	31432	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018654	A	6	6	31806	31811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018654	G	6	6	31887	31892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018654	T	6	6	32678	32683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018654	T	7	7	33073	33079	0 %	100 %	0 %	0 %	410480094
63	NC_018654	T	6	6	33974	33979	0 %	100 %	0 %	0 %	410480094
64	NC_018654	A	7	7	34528	34534	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
65	NC_018654	A	6	6	34659	34664	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
66	NC_018654	A	6	6	34823	34828	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
67	NC_018654	A	7	7	35168	35174	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
68	NC_018654	A	6	6	35547	35552	100 %	0 %	0 %	0 %	410480096
69	NC_018654	A	6	6	36091	36096	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
70	NC_018654	A	6	6	36256	36261	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
71	NC_018654	A	7	7	36519	36525	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
72	NC_018654	A	6	6	36577	36582	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
73	NC_018654	T	7	7	36742	36748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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84	NC_018654	T	6	6	38625	38630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_018654	T	6	6	41740	41745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_018654	T	7	7	42962	42968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_018654	T	7	7	47378	47384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018654	G	6	6	47407	47412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_018654	A	6	6	48597	48602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_018654	A	6	6	48741	48746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_018654	A	6	6	54839	54844	100 %	0 %	0 %	0 %	410480112
116	NC_018654	G	6	6	56894	56899	0 %	0 %	100 %	0 %	410480112
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119	NC_018654	A	6	6	58463	58468	100 %	0 %	0 %	0 %	410480115
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124	NC_018654	T	7	7	62895	62901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018654	T	6	6	62949	62954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018654	T	6	6	63209	63214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_018654	A	6	6	66021	66026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_018654	A	6	6	67692	67697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_018654	T	9	9	72359	72367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018654	G	7	7	72417	72423	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_018654	A	6	6	72541	72546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018654	C	6	6	72568	72573	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NC_018654	G	6	6	73749	73754	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.