MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid pAA-09EL50

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018654	A	8	8	2069	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	410480056
2	NC_018654	A	6	6	4011	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	410480059
3	NC_018654	A	6	6	4929	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	410480061
4	NC_018654	A	6	6	5357	5362	100 %	0 %	0 %	0 %	410480061
5	NC_018654	A	6	6	5406	5411	100 %	0 %	0 %	0 %	410480061
6	NC_018654	A	7	7	6505	6511	100 %	0 %	0 %	0 %	410480063
7	NC_018654	A	7	7	6692	6698	100 %	0 %	0 %	0 %	410480063
8	NC_018654	G	10	10	6957	6966	0 %	0 %	100 %	0 %	410480063
9	NC_018654	A	9	9	7269	7277	100 %	0 %	0 %	0 %	410480064
10	NC_018654	A	7	7	7382	7388	100 %	0 %	0 %	0 %	410480064
11	NC_018654	G	6	6	7575	7580	0 %	0 %	100 %	0 %	410480064
12	NC_018654	G	8	8	8766	8773	0 %	0 %	100 %	0 %	410480064
13	NC_018654	A	6	6	9531	9536	100 %	0 %	0 %	0 %	410480064
14	NC_018654	G	12	12	9863	9874	0 %	0 %	100 %	0 %	410480065
15	NC_018654	A	6	6	10143	10148	100 %	0 %	0 %	0 %	410480066
16	NC_018654	G	7	7	10201	10207	0 %	0 %	100 %	0 %	410480066
17	NC_018654	A	6	6	10519	10524	100 %	0 %	0 %	0 %	410480066
18	NC_018654	A	7	7	14301	14307	100 %	0 %	0 %	0 %	410480074
19	NC_018654	T	6	6	14810	14815	0 %	100 %	0 %	0 %	410480076
20	NC_018654	T	6	6	14962	14967	0 %	100 %	0 %	0 %	410480076
21	NC_018654	T	6	6	15090	15095	0 %	100 %	0 %	0 %	410480076
22	NC_018654	T	6	6	15803	15808	0 %	100 %	0 %	0 %	410480077
23	NC_018654	A	7	7	16320	16326	100 %	0 %	0 %	0 %	410480077
24	NC_018654	A	8	8	16590	16597	100 %	0 %	0 %	0 %	410480077
25	NC_018654	T	7	7	16698	16704	0 %	100 %	0 %	0 %	410480077
26	NC_018654	A	6	6	16795	16800	100 %	0 %	0 %	0 %	410480078
27	NC_018654	A	6	6	17969	17974	100 %	0 %	0 %	0 %	410480081
28	NC_018654	T	6	6	19667	19672	0 %	100 %	0 %	0 %	410480083
29	NC_018654	A	6	6	22843	22848	100 %	0 %	0 %	0 %	410480086
30	NC_018654	A	6	6	23154	23159	100 %	0 %	0 %	0 %	410480087
31	NC_018654	T	7	7	33073	33079	0 %	100 %	0 %	0 %	410480094
32	NC_018654	T	6	6	33974	33979	0 %	100 %	0 %	0 %	410480094
33	NC_018654	A	7	7	34528	34534	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
34	NC_018654	A	6	6	34659	34664	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
35	NC_018654	A	6	6	34823	34828	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
36	NC_018654	A	7	7	35168	35174	100 %	0 %	0 %	0 %	410480095
37	NC_018654	A	6	6	35547	35552	100 %	0 %	0 %	0 %	410480096
38	NC_018654	A	6	6	36091	36096	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
39	NC_018654	A	6	6	36256	36261	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
40	NC_018654	A	7	7	36519	36525	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
41	NC_018654	A	6	6	36577	36582	100 %	0 %	0 %	0 %	410480097
42	NC_018654	T	8	8	36786	36793	0 %	100 %	0 %	0 %	410480098
43	NC_018654	T	6	6	36844	36849	0 %	100 %	0 %	0 %	410480098
44	NC_018654	T	6	6	37136	37141	0 %	100 %	0 %	0 %	410480098
45	NC_018654	A	6	6	37247	37252	100 %	0 %	0 %	0 %	410480098
46	NC_018654	T	7	7	37338	37344	0 %	100 %	0 %	0 %	410480098
47	NC_018654	A	6	6	37512	37517	100 %	0 %	0 %	0 %	410480098
48	NC_018654	T	7	7	37531	37537	0 %	100 %	0 %	0 %	410480098
49	NC_018654	T	6	6	37906	37911	0 %	100 %	0 %	0 %	410480098
50	NC_018654	A	6	6	39928	39933	100 %	0 %	0 %	0 %	410480099
51	NC_018654	T	6	6	40427	40432	0 %	100 %	0 %	0 %	410480100
52	NC_018654	T	7	7	41186	41192	0 %	100 %	0 %	0 %	410480100
53	NC_018654	T	6	6	44071	44076	0 %	100 %	0 %	0 %	410480104
54	NC_018654	T	6	6	45379	45384	0 %	100 %	0 %	0 %	410480104
55	NC_018654	C	6	6	45545	45550	0 %	0 %	0 %	100 %	410480104
56	NC_018654	T	6	6	45626	45631	0 %	100 %	0 %	0 %	410480104
57	NC_018654	C	6	6	46005	46010	0 %	0 %	0 %	100 %	410480104
58	NC_018654	T	6	6	46131	46136	0 %	100 %	0 %	0 %	410480104
59	NC_018654	T	8	8	46373	46380	0 %	100 %	0 %	0 %	410480104
60	NC_018654	G	6	6	46402	46407	0 %	0 %	100 %	0 %	410480104
61	NC_018654	C	9	9	46598	46606	0 %	0 %	0 %	100 %	410480104
62	NC_018654	T	6	6	50096	50101	0 %	100 %	0 %	0 %	410480107
63	NC_018654	T	6	6	50405	50410	0 %	100 %	0 %	0 %	410480107
64	NC_018654	T	6	6	52308	52313	0 %	100 %	0 %	0 %	410480110
65	NC_018654	G	7	7	53336	53342	0 %	0 %	100 %	0 %	410480111
66	NC_018654	G	6	6	53703	53708	0 %	0 %	100 %	0 %	410480112
67	NC_018654	A	6	6	54143	54148	100 %	0 %	0 %	0 %	410480112
68	NC_018654	A	6	6	54839	54844	100 %	0 %	0 %	0 %	410480112
69	NC_018654	G	6	6	56894	56899	0 %	0 %	100 %	0 %	410480112
70	NC_018654	T	6	6	58000	58005	0 %	100 %	0 %	0 %	410480114
71	NC_018654	A	7	7	58276	58282	100 %	0 %	0 %	0 %	410480115
72	NC_018654	A	6	6	58463	58468	100 %	0 %	0 %	0 %	410480115
73	NC_018654	A	8	8	58671	58678	100 %	0 %	0 %	0 %	410480115
74	NC_018654	T	6	6	62087	62092	0 %	100 %	0 %	0 %	410480121
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76	NC_018654	A	6	6	62836	62841	100 %	0 %	0 %	0 %	410480122
77	NC_018654	T	8	8	70251	70258	0 %	100 %	0 %	0 %	410480133

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.