MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	GGTAAT	2	12	4792	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485114
2	NC_018651	TCAACG	2	12	8342	8353	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410485120
3	NC_018651	AACGGC	2	12	8808	8819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
4	NC_018651	CTCTTT	2	12	9254	9265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485121
5	NC_018651	GTAGGC	2	12	10652	10663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410485122
6	NC_018651	ACCATC	2	12	12718	12729	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	410485124
7	NC_018651	GCACAA	2	12	16598	16609	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	410485130
8	NC_018651	ATGAAA	2	12	19602	19613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410485134
9	NC_018651	TAGTGT	2	12	24187	24198	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410485141
10	NC_018651	TGGCTA	2	12	31900	31911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410485150
11	NC_018651	TCATCC	2	12	33292	33303	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	410485152
12	NC_018651	AAAAAT	2	12	42337	42348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	410485168
13	NC_018651	TTTTTG	2	12	43677	43688	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410485170
14	NC_018651	ACCAAC	2	12	50899	50910	50 %	0 %	0 %	50 %	410485180
15	NC_018651	ACCAAT	2	12	54075	54086	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	410485182
16	NC_018651	TGTGGT	2	12	58850	58861	0 %	50 %	50 %	0 %	410485186
17	NC_018651	CGTTGG	2	12	63670	63681	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	410485193
18	NC_018651	CGTATT	2	12	65150	65161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410485196
19	NC_018651	TCTGCT	2	12	66195	66206	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410485197
20	NC_018651	TCTTTG	2	12	67736	67747	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410485199
21	NC_018651	AAGTCC	2	12	73487	73498	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410485204
22	NC_018651	TTGACG	2	12	75764	75775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410485205
23	NC_018651	CTTTCA	2	12	77692	77703	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410485206
24	NC_018651	AGAGCC	2	12	78496	78507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485207
25	NC_018651	CTTCAT	2	12	82330	82341	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410485210
26	NC_018651	AATCAG	2	12	92485	92496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410485221
27	NC_018651	TCAAGG	2	12	95134	95145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410485225
28	NC_018651	CCATTT	2	12	97812	97823	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	410485230
29	NC_018651	ACATTA	2	12	100494	100505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410485230
30	NC_018651	GCATCA	2	12	101578	101589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410485231
31	NC_018651	TGTTTT	2	12	101931	101942	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	410485231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.