MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	TTGA	2	8	90	97	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018651	TTCT	2	8	546	553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018651	TCCT	2	8	1026	1033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018651	AGCC	2	8	1782	1789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018651	CTGC	2	8	1891	1898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018651	ATTA	2	8	1968	1975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018651	CGCA	2	8	2238	2245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018651	CCAA	2	8	2718	2725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018651	TTGC	2	8	3091	3098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018651	AAGC	2	8	3263	3270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018651	GCTT	2	8	3317	3324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018651	CGAT	2	8	3436	3443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018651	CAGT	2	8	3944	3951	25 %	25 %	25 %	25 %	410485113
14	NC_018651	CAGT	2	8	4422	4429	25 %	25 %	25 %	25 %	410485114
15	NC_018651	CATT	2	8	5013	5020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018651	TATT	2	8	5047	5054	25 %	75 %	0 %	0 %	410485115
17	NC_018651	AATA	2	8	5061	5068	75 %	25 %	0 %	0 %	410485115
18	NC_018651	GTAA	2	8	5356	5363	50 %	25 %	25 %	0 %	410485115
19	NC_018651	TGTC	2	8	5374	5381	0 %	50 %	25 %	25 %	410485115
20	NC_018651	GCCA	2	8	6274	6281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018651	ATCG	2	8	6796	6803	25 %	25 %	25 %	25 %	410485118
22	NC_018651	ACAT	2	8	6875	6882	50 %	25 %	0 %	25 %	410485118
23	NC_018651	GTAC	2	8	7760	7767	25 %	25 %	25 %	25 %	410485120
24	NC_018651	CCAG	2	8	8357	8364	25 %	0 %	25 %	50 %	410485120
25	NC_018651	CGAT	2	8	8525	8532	25 %	25 %	25 %	25 %	410485120
26	NC_018651	GAAG	2	8	8981	8988	50 %	0 %	50 %	0 %	410485121
27	NC_018651	CATC	2	8	9472	9479	25 %	25 %	0 %	50 %	410485121
28	NC_018651	TAAG	2	8	9618	9625	50 %	25 %	25 %	0 %	410485122
29	NC_018651	CCAT	2	8	9883	9890	25 %	25 %	0 %	50 %	410485122
30	NC_018651	CAAG	2	8	9949	9956	50 %	0 %	25 %	25 %	410485122
31	NC_018651	TTCG	2	8	10029	10036	0 %	50 %	25 %	25 %	410485122
32	NC_018651	TCTT	2	8	10671	10678	0 %	75 %	0 %	25 %	410485122
33	NC_018651	ACCA	2	8	10996	11003	50 %	0 %	0 %	50 %	410485122
34	NC_018651	CGCC	2	8	11004	11011	0 %	0 %	25 %	75 %	410485122
35	NC_018651	TTTG	2	8	11092	11099	0 %	75 %	25 %	0 %	410485122
36	NC_018651	TTAC	2	8	11132	11139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018651	AATC	2	8	11283	11290	50 %	25 %	0 %	25 %	410485123
38	NC_018651	CTTT	2	8	11869	11876	0 %	75 %	0 %	25 %	410485123
39	NC_018651	TGGT	2	8	14126	14133	0 %	50 %	50 %	0 %	410485126
40	NC_018651	AACA	2	8	14690	14697	75 %	0 %	0 %	25 %	410485127
41	NC_018651	ACAG	2	8	14814	14821	50 %	0 %	25 %	25 %	410485127
42	NC_018651	TTTA	2	8	15005	15012	25 %	75 %	0 %	0 %	410485127
43	NC_018651	GCAA	2	8	15137	15144	50 %	0 %	25 %	25 %	410485128
44	NC_018651	CTGA	2	8	16046	16053	25 %	25 %	25 %	25 %	410485129
45	NC_018651	ACTT	2	8	16425	16432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018651	TGAT	2	8	17363	17370	25 %	50 %	25 %	0 %	410485130
47	NC_018651	GCAA	2	8	17700	17707	50 %	0 %	25 %	25 %	410485130
48	NC_018651	CTGG	2	8	17803	17810	0 %	25 %	50 %	25 %	410485130
49	NC_018651	GTCG	2	8	17845	17852	0 %	25 %	50 %	25 %	410485130
50	NC_018651	AGAA	2	8	18371	18378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018651	TTCT	2	8	18442	18449	0 %	75 %	0 %	25 %	410485132
52	NC_018651	TATC	2	8	18668	18675	25 %	50 %	0 %	25 %	410485132
53	NC_018651	CTTG	2	8	19626	19633	0 %	50 %	25 %	25 %	410485134
54	NC_018651	AAAG	2	8	19809	19816	75 %	0 %	25 %	0 %	410485134
55	NC_018651	TTAC	2	8	19993	20000	25 %	50 %	0 %	25 %	410485134
56	NC_018651	TCGT	2	8	20065	20072	0 %	50 %	25 %	25 %	410485134
57	NC_018651	ATGT	2	8	20339	20346	25 %	50 %	25 %	0 %	410485135
58	NC_018651	TCAT	2	8	20770	20777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018651	AAAT	2	8	20975	20982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018651	GCAC	2	8	21129	21136	25 %	0 %	25 %	50 %	410485136
61	NC_018651	AGCA	2	8	21256	21263	50 %	0 %	25 %	25 %	410485136
62	NC_018651	AATG	2	8	21463	21470	50 %	25 %	25 %	0 %	410485136
63	NC_018651	TAAT	2	8	21659	21666	50 %	50 %	0 %	0 %	410485136
64	NC_018651	TGTT	2	8	21936	21943	0 %	75 %	25 %	0 %	410485138
65	NC_018651	ACTC	2	8	22251	22258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018651	GAAA	2	8	22533	22540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018651	TTGC	2	8	22809	22816	0 %	50 %	25 %	25 %	410485139
68	NC_018651	CAGA	2	8	22974	22981	50 %	0 %	25 %	25 %	410485139
69	NC_018651	AGGT	2	8	23754	23761	25 %	25 %	50 %	0 %	410485140
70	NC_018651	TCAT	2	8	23822	23829	25 %	50 %	0 %	25 %	410485140
71	NC_018651	TCCA	2	8	23876	23883	25 %	25 %	0 %	50 %	410485140
72	NC_018651	CATT	2	8	24766	24773	25 %	50 %	0 %	25 %	410485142
73	NC_018651	TTGG	2	8	25085	25092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018651	ACGA	2	8	25678	25685	50 %	0 %	25 %	25 %	410485144
75	NC_018651	AATA	2	8	26321	26328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018651	TCGT	2	8	26520	26527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018651	GGTT	2	8	26854	26861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018651	GGTT	2	8	26915	26922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018651	ATTT	2	8	27384	27391	25 %	75 %	0 %	0 %	410485145
80	NC_018651	TTGC	2	8	27752	27759	0 %	50 %	25 %	25 %	410485146
81	NC_018651	TCAA	2	8	27889	27896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018651	TCAG	2	8	28537	28544	25 %	25 %	25 %	25 %	410485147
83	NC_018651	AACA	2	8	29070	29077	75 %	0 %	0 %	25 %	410485147
84	NC_018651	TCTT	2	8	29185	29192	0 %	75 %	0 %	25 %	410485147
85	NC_018651	CCAG	2	8	29273	29280	25 %	0 %	25 %	50 %	410485147
86	NC_018651	GATG	2	8	30318	30325	25 %	25 %	50 %	0 %	410485148
87	NC_018651	ACCA	2	8	30482	30489	50 %	0 %	0 %	50 %	410485148
88	NC_018651	CAAC	2	8	30722	30729	50 %	0 %	0 %	50 %	410485148
89	NC_018651	CATC	2	8	31422	31429	25 %	25 %	0 %	50 %	410485149
90	NC_018651	CTTC	2	8	31447	31454	0 %	50 %	0 %	50 %	410485149
91	NC_018651	CTCA	2	8	31773	31780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018651	CCGC	2	8	32104	32111	0 %	0 %	25 %	75 %	410485150
93	NC_018651	TCCA	2	8	33049	33056	25 %	25 %	0 %	50 %	410485151
94	NC_018651	CTTC	2	8	33249	33256	0 %	50 %	0 %	50 %	410485151
95	NC_018651	GTTC	2	8	33415	33422	0 %	50 %	25 %	25 %	410485152
96	NC_018651	TTGC	2	8	33549	33556	0 %	50 %	25 %	25 %	410485153
97	NC_018651	GGCA	2	8	34108	34115	25 %	0 %	50 %	25 %	410485154
98	NC_018651	CTGA	2	8	35398	35405	25 %	25 %	25 %	25 %	410485157
99	NC_018651	AACT	2	8	35734	35741	50 %	25 %	0 %	25 %	410485158
100	NC_018651	TAAT	2	8	36095	36102	50 %	50 %	0 %	0 %	410485158
101	NC_018651	GCTC	2	8	36632	36639	0 %	25 %	25 %	50 %	410485160
102	NC_018651	ACCA	2	8	36721	36728	50 %	0 %	0 %	50 %	410485160
103	NC_018651	ATTT	2	8	36971	36978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018651	TTTA	2	8	36998	37005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018651	TGTA	2	8	37179	37186	25 %	50 %	25 %	0 %	410485161
106	NC_018651	AACT	2	8	37509	37516	50 %	25 %	0 %	25 %	410485162
107	NC_018651	TTCT	2	8	37562	37569	0 %	75 %	0 %	25 %	410485162
108	NC_018651	GCTC	2	8	37922	37929	0 %	25 %	25 %	50 %	410485162
109	NC_018651	TAAG	2	8	38158	38165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018651	CGCC	2	8	38324	38331	0 %	0 %	25 %	75 %	410485163
111	NC_018651	CAGC	2	8	38352	38359	25 %	0 %	25 %	50 %	410485163
112	NC_018651	CGCT	2	8	39281	39288	0 %	25 %	25 %	50 %	410485163
113	NC_018651	CCAG	2	8	39627	39634	25 %	0 %	25 %	50 %	410485163
114	NC_018651	GAAC	2	8	40390	40397	50 %	0 %	25 %	25 %	410485164
115	NC_018651	GACA	2	8	41702	41709	50 %	0 %	25 %	25 %	410485166
116	NC_018651	GCAG	2	8	42038	42045	25 %	0 %	50 %	25 %	410485167
117	NC_018651	ACCC	2	8	42117	42124	25 %	0 %	0 %	75 %	410485167
118	NC_018651	TAAA	2	8	42257	42264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018651	GCCA	2	8	42455	42462	25 %	0 %	25 %	50 %	410485168
120	NC_018651	CTTT	2	8	42723	42730	0 %	75 %	0 %	25 %	410485169
121	NC_018651	TTCA	2	8	42865	42872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018651	TCCA	2	8	43006	43013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018651	ACTT	2	8	43139	43146	25 %	50 %	0 %	25 %	410485170
124	NC_018651	TGTT	2	8	43149	43156	0 %	75 %	25 %	0 %	410485170
125	NC_018651	TCTT	2	8	43173	43180	0 %	75 %	0 %	25 %	410485170
126	NC_018651	CATC	2	8	43355	43362	25 %	25 %	0 %	50 %	410485170
127	NC_018651	TTGC	2	8	43705	43712	0 %	50 %	25 %	25 %	410485170
128	NC_018651	CGTG	2	8	43792	43799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018651	CGAA	2	8	43862	43869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018651	GTGA	2	8	43870	43877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018651	CGAA	2	8	43887	43894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018651	CCCA	2	8	44228	44235	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_018651	TATC	2	8	44314	44321	25 %	50 %	0 %	25 %	410485171
134	NC_018651	GATT	2	8	44327	44334	25 %	50 %	25 %	0 %	410485171
135	NC_018651	TTAT	2	8	44690	44697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018651	TTCT	2	8	45333	45340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018651	TATG	2	8	45378	45385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018651	CAGG	2	8	46406	46413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018651	AAAG	2	8	46441	46448	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018651	TATT	2	8	46518	46525	25 %	75 %	0 %	0 %	410485174
141	NC_018651	CGAT	2	8	47938	47945	25 %	25 %	25 %	25 %	410485176
142	NC_018651	GTTC	2	8	48598	48605	0 %	50 %	25 %	25 %	410485177
143	NC_018651	GAGC	2	8	48908	48915	25 %	0 %	50 %	25 %	410485178
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145	NC_018651	TGAG	2	8	49308	49315	25 %	25 %	50 %	0 %	410485179
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.