MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	TTGA	2	8	90	97	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018651	TTCT	2	8	546	553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018651	TCCT	2	8	1026	1033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018651	AGCC	2	8	1782	1789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018651	CTGC	2	8	1891	1898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018651	ATTA	2	8	1968	1975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018651	CGCA	2	8	2238	2245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018651	CCAA	2	8	2718	2725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018651	TTGC	2	8	3091	3098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018651	AAGC	2	8	3263	3270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018651	GCTT	2	8	3317	3324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018651	CGAT	2	8	3436	3443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018651	CATT	2	8	5013	5020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018651	GCCA	2	8	6274	6281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018651	TTAC	2	8	11132	11139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018651	ACTT	2	8	16425	16432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018651	AGAA	2	8	18371	18378	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018651	TCAT	2	8	20770	20777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018651	AAAT	2	8	20975	20982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018651	ACTC	2	8	22251	22258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018651	GAAA	2	8	22533	22540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018651	TTGG	2	8	25085	25092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018651	AATA	2	8	26321	26328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018651	TCGT	2	8	26520	26527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018651	GGTT	2	8	26854	26861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018651	GGTT	2	8	26915	26922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018651	TCAA	2	8	27889	27896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018651	CTCA	2	8	31773	31780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018651	ATTT	2	8	36971	36978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018651	TTTA	2	8	36998	37005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018651	TAAG	2	8	38158	38165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018651	TAAA	2	8	42257	42264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018651	TTCA	2	8	42865	42872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018651	TCCA	2	8	43006	43013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018651	CGTG	2	8	43792	43799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018651	CGAA	2	8	43862	43869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018651	GTGA	2	8	43870	43877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018651	CGAA	2	8	43887	43894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018651	CCCA	2	8	44228	44235	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_018651	TTAT	2	8	44690	44697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018651	TTCT	2	8	45333	45340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018651	TATG	2	8	45378	45385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018651	CAGG	2	8	46406	46413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018651	AAAG	2	8	46441	46448	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018651	CATT	2	8	50214	50221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018651	AGAT	2	8	50236	50243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018651	TAAG	2	8	59579	59586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018651	TATT	2	8	59595	59602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018651	TCTA	2	8	59690	59697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018651	ATAG	2	8	60484	60491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018651	TTTG	2	8	62090	62097	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018651	TAAT	2	8	62114	62121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018651	CAGT	2	8	62346	62353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018651	GTTA	2	8	63435	63442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018651	AGTA	2	8	67129	67136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018651	TTCC	2	8	69480	69487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018651	TACT	2	8	70655	70662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018651	AGTT	2	8	78772	78779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018651	AATG	2	8	78812	78819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018651	ACTG	2	8	82900	82907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018651	TTTC	2	8	82948	82955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018651	TATT	2	8	83606	83613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018651	ACCG	2	8	84110	84117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018651	TAAG	2	8	84337	84344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018651	TTAC	2	8	91300	91307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018651	ATAG	2	8	95469	95476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018651	ACTT	2	8	107816	107823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018651	TAGT	2	8	108209	108216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018651	TCAT	2	8	108468	108475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018651	TCAG	2	8	109221	109228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.