MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	CAGT	2	8	3944	3951	25 %	25 %	25 %	25 %	410485113
2	NC_018651	CAGT	2	8	4422	4429	25 %	25 %	25 %	25 %	410485114
3	NC_018651	TATT	2	8	5047	5054	25 %	75 %	0 %	0 %	410485115
4	NC_018651	AATA	2	8	5061	5068	75 %	25 %	0 %	0 %	410485115
5	NC_018651	GTAA	2	8	5356	5363	50 %	25 %	25 %	0 %	410485115
6	NC_018651	TGTC	2	8	5374	5381	0 %	50 %	25 %	25 %	410485115
7	NC_018651	ATCG	2	8	6796	6803	25 %	25 %	25 %	25 %	410485118
8	NC_018651	ACAT	2	8	6875	6882	50 %	25 %	0 %	25 %	410485118
9	NC_018651	GTAC	2	8	7760	7767	25 %	25 %	25 %	25 %	410485120
10	NC_018651	CCAG	2	8	8357	8364	25 %	0 %	25 %	50 %	410485120
11	NC_018651	CGAT	2	8	8525	8532	25 %	25 %	25 %	25 %	410485120
12	NC_018651	GAAG	2	8	8981	8988	50 %	0 %	50 %	0 %	410485121
13	NC_018651	CATC	2	8	9472	9479	25 %	25 %	0 %	50 %	410485121
14	NC_018651	TAAG	2	8	9618	9625	50 %	25 %	25 %	0 %	410485122
15	NC_018651	CCAT	2	8	9883	9890	25 %	25 %	0 %	50 %	410485122
16	NC_018651	CAAG	2	8	9949	9956	50 %	0 %	25 %	25 %	410485122
17	NC_018651	TTCG	2	8	10029	10036	0 %	50 %	25 %	25 %	410485122
18	NC_018651	TCTT	2	8	10671	10678	0 %	75 %	0 %	25 %	410485122
19	NC_018651	ACCA	2	8	10996	11003	50 %	0 %	0 %	50 %	410485122
20	NC_018651	CGCC	2	8	11004	11011	0 %	0 %	25 %	75 %	410485122
21	NC_018651	TTTG	2	8	11092	11099	0 %	75 %	25 %	0 %	410485122
22	NC_018651	AATC	2	8	11283	11290	50 %	25 %	0 %	25 %	410485123
23	NC_018651	CTTT	2	8	11869	11876	0 %	75 %	0 %	25 %	410485123
24	NC_018651	TGGT	2	8	14126	14133	0 %	50 %	50 %	0 %	410485126
25	NC_018651	AACA	2	8	14690	14697	75 %	0 %	0 %	25 %	410485127
26	NC_018651	ACAG	2	8	14814	14821	50 %	0 %	25 %	25 %	410485127
27	NC_018651	TTTA	2	8	15005	15012	25 %	75 %	0 %	0 %	410485127
28	NC_018651	GCAA	2	8	15137	15144	50 %	0 %	25 %	25 %	410485128
29	NC_018651	CTGA	2	8	16046	16053	25 %	25 %	25 %	25 %	410485129
30	NC_018651	TGAT	2	8	17363	17370	25 %	50 %	25 %	0 %	410485130
31	NC_018651	GCAA	2	8	17700	17707	50 %	0 %	25 %	25 %	410485130
32	NC_018651	CTGG	2	8	17803	17810	0 %	25 %	50 %	25 %	410485130
33	NC_018651	GTCG	2	8	17845	17852	0 %	25 %	50 %	25 %	410485130
34	NC_018651	TTCT	2	8	18442	18449	0 %	75 %	0 %	25 %	410485132
35	NC_018651	TATC	2	8	18668	18675	25 %	50 %	0 %	25 %	410485132
36	NC_018651	CTTG	2	8	19626	19633	0 %	50 %	25 %	25 %	410485134
37	NC_018651	AAAG	2	8	19809	19816	75 %	0 %	25 %	0 %	410485134
38	NC_018651	TTAC	2	8	19993	20000	25 %	50 %	0 %	25 %	410485134
39	NC_018651	TCGT	2	8	20065	20072	0 %	50 %	25 %	25 %	410485134
40	NC_018651	ATGT	2	8	20339	20346	25 %	50 %	25 %	0 %	410485135
41	NC_018651	GCAC	2	8	21129	21136	25 %	0 %	25 %	50 %	410485136
42	NC_018651	AGCA	2	8	21256	21263	50 %	0 %	25 %	25 %	410485136
43	NC_018651	AATG	2	8	21463	21470	50 %	25 %	25 %	0 %	410485136
44	NC_018651	TAAT	2	8	21659	21666	50 %	50 %	0 %	0 %	410485136
45	NC_018651	TGTT	2	8	21936	21943	0 %	75 %	25 %	0 %	410485138
46	NC_018651	TTGC	2	8	22809	22816	0 %	50 %	25 %	25 %	410485139
47	NC_018651	CAGA	2	8	22974	22981	50 %	0 %	25 %	25 %	410485139
48	NC_018651	AGGT	2	8	23754	23761	25 %	25 %	50 %	0 %	410485140
49	NC_018651	TCAT	2	8	23822	23829	25 %	50 %	0 %	25 %	410485140
50	NC_018651	TCCA	2	8	23876	23883	25 %	25 %	0 %	50 %	410485140
51	NC_018651	CATT	2	8	24766	24773	25 %	50 %	0 %	25 %	410485142
52	NC_018651	ACGA	2	8	25678	25685	50 %	0 %	25 %	25 %	410485144
53	NC_018651	ATTT	2	8	27384	27391	25 %	75 %	0 %	0 %	410485145
54	NC_018651	TTGC	2	8	27752	27759	0 %	50 %	25 %	25 %	410485146
55	NC_018651	TCAG	2	8	28537	28544	25 %	25 %	25 %	25 %	410485147
56	NC_018651	AACA	2	8	29070	29077	75 %	0 %	0 %	25 %	410485147
57	NC_018651	TCTT	2	8	29185	29192	0 %	75 %	0 %	25 %	410485147
58	NC_018651	CCAG	2	8	29273	29280	25 %	0 %	25 %	50 %	410485147
59	NC_018651	GATG	2	8	30318	30325	25 %	25 %	50 %	0 %	410485148
60	NC_018651	ACCA	2	8	30482	30489	50 %	0 %	0 %	50 %	410485148
61	NC_018651	CAAC	2	8	30722	30729	50 %	0 %	0 %	50 %	410485148
62	NC_018651	CATC	2	8	31422	31429	25 %	25 %	0 %	50 %	410485149
63	NC_018651	CTTC	2	8	31447	31454	0 %	50 %	0 %	50 %	410485149
64	NC_018651	CCGC	2	8	32104	32111	0 %	0 %	25 %	75 %	410485150
65	NC_018651	TCCA	2	8	33049	33056	25 %	25 %	0 %	50 %	410485151
66	NC_018651	CTTC	2	8	33249	33256	0 %	50 %	0 %	50 %	410485151
67	NC_018651	GTTC	2	8	33415	33422	0 %	50 %	25 %	25 %	410485152
68	NC_018651	TTGC	2	8	33549	33556	0 %	50 %	25 %	25 %	410485153
69	NC_018651	GGCA	2	8	34108	34115	25 %	0 %	50 %	25 %	410485154
70	NC_018651	CTGA	2	8	35398	35405	25 %	25 %	25 %	25 %	410485157
71	NC_018651	AACT	2	8	35734	35741	50 %	25 %	0 %	25 %	410485158
72	NC_018651	TAAT	2	8	36095	36102	50 %	50 %	0 %	0 %	410485158
73	NC_018651	GCTC	2	8	36632	36639	0 %	25 %	25 %	50 %	410485160
74	NC_018651	ACCA	2	8	36721	36728	50 %	0 %	0 %	50 %	410485160
75	NC_018651	TGTA	2	8	37179	37186	25 %	50 %	25 %	0 %	410485161
76	NC_018651	AACT	2	8	37509	37516	50 %	25 %	0 %	25 %	410485162
77	NC_018651	TTCT	2	8	37562	37569	0 %	75 %	0 %	25 %	410485162
78	NC_018651	GCTC	2	8	37922	37929	0 %	25 %	25 %	50 %	410485162
79	NC_018651	CGCC	2	8	38324	38331	0 %	0 %	25 %	75 %	410485163
80	NC_018651	CAGC	2	8	38352	38359	25 %	0 %	25 %	50 %	410485163
81	NC_018651	CGCT	2	8	39281	39288	0 %	25 %	25 %	50 %	410485163
82	NC_018651	CCAG	2	8	39627	39634	25 %	0 %	25 %	50 %	410485163
83	NC_018651	GAAC	2	8	40390	40397	50 %	0 %	25 %	25 %	410485164
84	NC_018651	GACA	2	8	41702	41709	50 %	0 %	25 %	25 %	410485166
85	NC_018651	GCAG	2	8	42038	42045	25 %	0 %	50 %	25 %	410485167
86	NC_018651	ACCC	2	8	42117	42124	25 %	0 %	0 %	75 %	410485167
87	NC_018651	GCCA	2	8	42455	42462	25 %	0 %	25 %	50 %	410485168
88	NC_018651	CTTT	2	8	42723	42730	0 %	75 %	0 %	25 %	410485169
89	NC_018651	ACTT	2	8	43139	43146	25 %	50 %	0 %	25 %	410485170
90	NC_018651	TGTT	2	8	43149	43156	0 %	75 %	25 %	0 %	410485170
91	NC_018651	TCTT	2	8	43173	43180	0 %	75 %	0 %	25 %	410485170
92	NC_018651	CATC	2	8	43355	43362	25 %	25 %	0 %	50 %	410485170
93	NC_018651	TTGC	2	8	43705	43712	0 %	50 %	25 %	25 %	410485170
94	NC_018651	TATC	2	8	44314	44321	25 %	50 %	0 %	25 %	410485171
95	NC_018651	GATT	2	8	44327	44334	25 %	50 %	25 %	0 %	410485171
96	NC_018651	TATT	2	8	46518	46525	25 %	75 %	0 %	0 %	410485174
97	NC_018651	CGAT	2	8	47938	47945	25 %	25 %	25 %	25 %	410485176
98	NC_018651	GTTC	2	8	48598	48605	0 %	50 %	25 %	25 %	410485177
99	NC_018651	GAGC	2	8	48908	48915	25 %	0 %	50 %	25 %	410485178
100	NC_018651	ACAT	2	8	49043	49050	50 %	25 %	0 %	25 %	410485178
101	NC_018651	TGAG	2	8	49308	49315	25 %	25 %	50 %	0 %	410485179
102	NC_018651	TAGA	2	8	49473	49480	50 %	25 %	25 %	0 %	410485179
103	NC_018651	CATT	2	8	50955	50962	25 %	50 %	0 %	25 %	410485180
104	NC_018651	CAGT	2	8	51183	51190	25 %	25 %	25 %	25 %	410485180
105	NC_018651	TCAA	2	8	52300	52307	50 %	25 %	0 %	25 %	410485181
106	NC_018651	CTGG	2	8	52959	52966	0 %	25 %	50 %	25 %	410485182
107	NC_018651	GGCA	2	8	53325	53332	25 %	0 %	50 %	25 %	410485182
108	NC_018651	GTAG	2	8	53509	53516	25 %	25 %	50 %	0 %	410485182
109	NC_018651	CTGG	2	8	54687	54694	0 %	25 %	50 %	25 %	410485182
110	NC_018651	ATGG	2	8	54982	54989	25 %	25 %	50 %	0 %	410485183
111	NC_018651	GTTG	2	8	55574	55581	0 %	50 %	50 %	0 %	410485184
112	NC_018651	CTCG	2	8	56329	56336	0 %	25 %	25 %	50 %	410485185
113	NC_018651	ACTT	2	8	56521	56528	25 %	50 %	0 %	25 %	410485185
114	NC_018651	CATC	2	8	56587	56594	25 %	25 %	0 %	50 %	410485185
115	NC_018651	GCTC	2	8	57597	57604	0 %	25 %	25 %	50 %	410485185
116	NC_018651	GCTG	2	8	58533	58540	0 %	25 %	50 %	25 %	410485186
117	NC_018651	CCAG	2	8	58774	58781	25 %	0 %	25 %	50 %	410485186
118	NC_018651	CAAC	2	8	59300	59307	50 %	0 %	0 %	50 %	410485186
119	NC_018651	GCGT	2	8	60346	60353	0 %	25 %	50 %	25 %	410485187
120	NC_018651	CCAA	2	8	60808	60815	50 %	0 %	0 %	50 %	410485188
121	NC_018651	GTGG	2	8	61000	61007	0 %	25 %	75 %	0 %	410485188
122	NC_018651	CCAA	2	8	61412	61419	50 %	0 %	0 %	50 %	410485188
123	NC_018651	TGCG	2	8	61446	61453	0 %	25 %	50 %	25 %	410485188
124	NC_018651	ACTC	2	8	63121	63128	25 %	25 %	0 %	50 %	410485192
125	NC_018651	GTCT	2	8	63721	63728	0 %	50 %	25 %	25 %	410485193
126	NC_018651	CTTT	2	8	64106	64113	0 %	75 %	0 %	25 %	410485194
127	NC_018651	AATG	2	8	64216	64223	50 %	25 %	25 %	0 %	410485194
128	NC_018651	GTTC	2	8	64892	64899	0 %	50 %	25 %	25 %	410485195
129	NC_018651	TTGT	2	8	65250	65257	0 %	75 %	25 %	0 %	410485196
130	NC_018651	CGCC	2	8	65777	65784	0 %	0 %	25 %	75 %	410485196
131	NC_018651	GTTA	2	8	65880	65887	25 %	50 %	25 %	0 %	410485196
132	NC_018651	TTTG	2	8	66688	66695	0 %	75 %	25 %	0 %	410485197
133	NC_018651	ATAG	2	8	67075	67082	50 %	25 %	25 %	0 %	410485198
134	NC_018651	CGAG	2	8	68347	68354	25 %	0 %	50 %	25 %	410485200
135	NC_018651	GAAC	2	8	68576	68583	50 %	0 %	25 %	25 %	410485201
136	NC_018651	AACT	2	8	69044	69051	50 %	25 %	0 %	25 %	410485201
137	NC_018651	AGAT	2	8	69078	69085	50 %	25 %	25 %	0 %	410485201
138	NC_018651	CCTT	2	8	69225	69232	0 %	50 %	0 %	50 %	410485201
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.