MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 1171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	AGC	2	6	3661	3666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485112
2	NC_018651	AGT	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485112
3	NC_018651	TCA	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485113
4	NC_018651	CTG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485113
5	NC_018651	TCG	2	6	3964	3969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485113
6	NC_018651	GCC	2	6	4113	4118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485113
7	NC_018651	AGG	2	6	4137	4142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410485113
8	NC_018651	ATT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485114
9	NC_018651	CAC	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485114
10	NC_018651	CAT	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485114
11	NC_018651	TCA	3	9	4523	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485114
12	NC_018651	CAT	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485114
13	NC_018651	GGT	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485114
14	NC_018651	TTG	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485114
15	NC_018651	ACC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485114
16	NC_018651	CAC	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485114
17	NC_018651	CAT	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485115
18	NC_018651	TAA	2	6	5323	5328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485115
19	NC_018651	TGG	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485116
20	NC_018651	TTC	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485116
21	NC_018651	CTT	2	6	5717	5722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485116
22	NC_018651	TGT	2	6	5855	5860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485116
23	NC_018651	GCG	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410485117
24	NC_018651	CAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485117
25	NC_018651	AAC	2	6	6041	6046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485117
26	NC_018651	TGC	2	6	6375	6380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485118
27	NC_018651	TGC	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485118
28	NC_018651	AAC	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485118
29	NC_018651	CTT	2	6	6531	6536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485118
30	NC_018651	AGT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485118
31	NC_018651	CAG	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485118
32	NC_018651	TTC	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485119
33	NC_018651	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485119
34	NC_018651	GCA	2	6	7405	7410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485119
35	NC_018651	CTG	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485119
36	NC_018651	AAT	2	6	7538	7543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485119
37	NC_018651	TCT	2	6	7850	7855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485120
38	NC_018651	GAC	2	6	7992	7997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485120
39	NC_018651	CAT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485120
40	NC_018651	GCA	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485120
41	NC_018651	CAT	2	6	8080	8085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485120
42	NC_018651	TCG	2	6	8126	8131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485120
43	NC_018651	TCT	2	6	8169	8174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485120
44	NC_018651	GTT	2	6	8324	8329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485120
45	NC_018651	TGC	2	6	8398	8403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485120
46	NC_018651	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485120
47	NC_018651	CTT	2	6	8583	8588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485120
48	NC_018651	TTC	2	6	8685	8690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485121
49	NC_018651	TCA	2	6	8944	8949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485121
50	NC_018651	ATC	2	6	9093	9098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485121
51	NC_018651	CAC	2	6	9121	9126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485121
52	NC_018651	ACG	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
53	NC_018651	CAG	2	6	9284	9289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
54	NC_018651	GCT	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485121
55	NC_018651	CAG	2	6	9427	9432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
56	NC_018651	ACG	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485121
57	NC_018651	CAC	2	6	9607	9612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
58	NC_018651	GGA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410485122
59	NC_018651	TCT	2	6	9727	9732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485122
60	NC_018651	GAC	2	6	9754	9759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485122
61	NC_018651	TCA	2	6	9810	9815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
62	NC_018651	TGA	2	6	10093	10098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485122
63	NC_018651	TCA	2	6	10209	10214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
64	NC_018651	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485122
65	NC_018651	ATC	2	6	10325	10330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
66	NC_018651	CCA	2	6	10458	10463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
67	NC_018651	CTT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485122
68	NC_018651	TCA	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485122
69	NC_018651	CGT	3	9	10606	10614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485122
70	NC_018651	CAC	2	6	10705	10710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
71	NC_018651	ACA	2	6	10725	10730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485122
72	NC_018651	GAC	2	6	10752	10757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485122
73	NC_018651	GGC	2	6	10769	10774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410485122
74	NC_018651	TCT	2	6	10866	10871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485122
75	NC_018651	TGA	2	6	10888	10893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485122
76	NC_018651	ACC	2	6	10899	10904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
77	NC_018651	CCA	2	6	11077	11082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485122
78	NC_018651	ACC	2	6	11149	11154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485123
79	NC_018651	AAT	2	6	11397	11402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485123
80	NC_018651	TCA	2	6	11534	11539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485123
81	NC_018651	TCA	2	6	11576	11581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485123
82	NC_018651	GTA	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485123
83	NC_018651	AGC	2	6	11797	11802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485123
84	NC_018651	CCG	2	6	11811	11816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
85	NC_018651	CCG	2	6	11954	11959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
86	NC_018651	TCA	2	6	12023	12028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485123
87	NC_018651	CGC	2	6	12051	12056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
88	NC_018651	TTC	2	6	12104	12109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485123
89	NC_018651	GTG	2	6	12125	12130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485123
90	NC_018651	GCC	2	6	12248	12253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410485123
91	NC_018651	AAT	2	6	12259	12264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485123
92	NC_018651	AAC	2	6	12310	12315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485123
93	NC_018651	ATT	2	6	12395	12400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410485123
94	NC_018651	TCC	2	6	12403	12408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410485124
95	NC_018651	CAT	2	6	12419	12424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485124
96	NC_018651	CTT	3	9	12449	12457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485124
97	NC_018651	GAT	2	6	12483	12488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485124
98	NC_018651	TCG	2	6	12496	12501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485124
99	NC_018651	TTC	2	6	12564	12569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485124
100	NC_018651	ACG	2	6	12765	12770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485124
101	NC_018651	TTC	2	6	12771	12776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485124
102	NC_018651	ACG	2	6	12903	12908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485124
103	NC_018651	TCC	2	6	12922	12927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410485124
104	NC_018651	CGG	2	6	13279	13284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410485125
105	NC_018651	CCA	2	6	13325	13330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485125
106	NC_018651	TGA	2	6	13457	13462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485125
107	NC_018651	GTT	2	6	13538	13543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485126
108	NC_018651	CGA	2	6	13579	13584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485126
109	NC_018651	AGC	2	6	13651	13656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485126
110	NC_018651	CCA	2	6	13676	13681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485126
111	NC_018651	TCG	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485126
112	NC_018651	CCA	2	6	13760	13765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485126
113	NC_018651	CGA	3	9	13783	13791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485126
114	NC_018651	AAC	2	6	13807	13812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485126
115	NC_018651	GTT	2	6	14076	14081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485126
116	NC_018651	GGT	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410485126
117	NC_018651	AGT	2	6	14170	14175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485126
118	NC_018651	ACG	2	6	14194	14199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485126
119	NC_018651	CCA	2	6	14201	14206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485126
120	NC_018651	ATC	2	6	14211	14216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485126
121	NC_018651	ATG	3	9	14374	14382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410485126
122	NC_018651	TCA	2	6	14400	14405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485127
123	NC_018651	TTC	2	6	14481	14486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485127
124	NC_018651	GTC	2	6	14499	14504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485127
125	NC_018651	CCA	2	6	14506	14511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485127
126	NC_018651	CAG	2	6	14602	14607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485127
127	NC_018651	AAC	2	6	14727	14732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410485127
128	NC_018651	ATC	2	6	14798	14803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485127
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132	NC_018651	TTC	2	6	15124	15129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485128
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139	NC_018651	TCA	2	6	15470	15475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485128
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142	NC_018651	TAA	2	6	15552	15557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485128
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152	NC_018651	GTC	2	6	16086	16091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485129
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251	NC_018651	GTC	2	6	28314	28319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485147
252	NC_018651	GTC	2	6	28344	28349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485147
253	NC_018651	CTT	3	9	28388	28396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485147
254	NC_018651	CCA	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485147
255	NC_018651	TCA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485147
256	NC_018651	CCA	2	6	28646	28651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485147
257	NC_018651	TTG	2	6	28831	28836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410485147
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260	NC_018651	TAA	2	6	29012	29017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410485147
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271	NC_018651	CAT	2	6	29879	29884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485147
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279	NC_018651	GCT	2	6	30583	30588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410485148
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371	NC_018651	ACG	2	6	37690	37695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485162
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495	NC_018651	TCA	2	6	50634	50639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485180
496	NC_018651	ATC	2	6	50782	50787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410485180
497	NC_018651	ACC	2	6	50875	50880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410485180
498	NC_018651	CAG	2	6	50935	50940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485180
499	NC_018651	CTT	2	6	50988	50993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410485180
500	NC_018651	AGC	2	6	51020	51025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410485180

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