MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	AG	3	6	679	684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018651	AT	3	6	823	828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018651	TC	4	8	925	932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018651	AG	3	6	1768	1773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018651	AG	3	6	4195	4200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018651	AC	3	6	4557	4562	50 %	0 %	0 %	50 %	410485114
7	NC_018651	TA	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018651	AT	3	6	5911	5916	50 %	50 %	0 %	0 %	410485116
9	NC_018651	CT	3	6	6249	6254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018651	TA	3	6	6349	6354	50 %	50 %	0 %	0 %	410485118
11	NC_018651	AG	3	6	6955	6960	50 %	0 %	50 %	0 %	410485118
12	NC_018651	GC	3	6	7444	7449	0 %	0 %	50 %	50 %	410485119
13	NC_018651	CA	3	6	7523	7528	50 %	0 %	0 %	50 %	410485119
14	NC_018651	AG	3	6	7736	7741	50 %	0 %	50 %	0 %	410485120
15	NC_018651	AG	4	8	8968	8975	50 %	0 %	50 %	0 %	410485121
16	NC_018651	TG	3	6	9408	9413	0 %	50 %	50 %	0 %	410485121
17	NC_018651	TC	3	6	11524	11529	0 %	50 %	0 %	50 %	410485123
18	NC_018651	CT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	0 %	50 %	410485124
19	NC_018651	GA	3	6	12660	12665	50 %	0 %	50 %	0 %	410485124
20	NC_018651	AC	3	6	13042	13047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018651	TA	3	6	13155	13160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018651	TA	4	8	13182	13189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018651	AC	3	6	13604	13609	50 %	0 %	0 %	50 %	410485126
24	NC_018651	GT	3	6	15242	15247	0 %	50 %	50 %	0 %	410485128
25	NC_018651	TC	3	6	15902	15907	0 %	50 %	0 %	50 %	410485129
26	NC_018651	GT	3	6	17168	17173	0 %	50 %	50 %	0 %	410485130
27	NC_018651	TG	3	6	17239	17244	0 %	50 %	50 %	0 %	410485130
28	NC_018651	TC	3	6	17581	17586	0 %	50 %	0 %	50 %	410485130
29	NC_018651	GT	3	6	17884	17889	0 %	50 %	50 %	0 %	410485130
30	NC_018651	CA	3	6	18633	18638	50 %	0 %	0 %	50 %	410485132
31	NC_018651	AT	3	6	18744	18749	50 %	50 %	0 %	0 %	410485132
32	NC_018651	AC	3	6	19013	19018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018651	AT	3	6	20808	20813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018651	CG	3	6	21731	21736	0 %	0 %	50 %	50 %	410485137
35	NC_018651	GC	3	6	22015	22020	0 %	0 %	50 %	50 %	410485138
36	NC_018651	AT	3	6	22104	22109	50 %	50 %	0 %	0 %	410485138
37	NC_018651	AG	3	6	23889	23894	50 %	0 %	50 %	0 %	410485140
38	NC_018651	CT	3	6	24652	24657	0 %	50 %	0 %	50 %	410485142
39	NC_018651	CA	3	6	25221	25226	50 %	0 %	0 %	50 %	410485143
40	NC_018651	TA	3	6	25802	25807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018651	CT	3	6	26098	26103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018651	CT	3	6	26136	26141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018651	CA	3	6	26197	26202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018651	CT	3	6	26417	26422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018651	GT	3	6	26488	26493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018651	GT	3	6	26647	26652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018651	GA	3	6	26728	26733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018651	CG	3	6	26816	26821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018651	TG	3	6	26939	26944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018651	GT	3	6	27020	27025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018651	GT	3	6	27037	27042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018651	TG	3	6	27114	27119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018651	AG	3	6	27990	27995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018651	AG	3	6	28944	28949	50 %	0 %	50 %	0 %	410485147
55	NC_018651	GA	3	6	29660	29665	50 %	0 %	50 %	0 %	410485147
56	NC_018651	GC	3	6	29999	30004	0 %	0 %	50 %	50 %	410485147
57	NC_018651	AC	3	6	30326	30331	50 %	0 %	0 %	50 %	410485148
58	NC_018651	TC	3	6	31136	31141	0 %	50 %	0 %	50 %	410485148
59	NC_018651	TC	3	6	33132	33137	0 %	50 %	0 %	50 %	410485151
60	NC_018651	AG	3	6	33644	33649	50 %	0 %	50 %	0 %	410485153
61	NC_018651	AC	3	6	34549	34554	50 %	0 %	0 %	50 %	410485155
62	NC_018651	TC	3	6	35273	35278	0 %	50 %	0 %	50 %	410485157
63	NC_018651	CA	3	6	35296	35301	50 %	0 %	0 %	50 %	410485157
64	NC_018651	CA	3	6	35304	35309	50 %	0 %	0 %	50 %	410485157
65	NC_018651	CA	3	6	36615	36620	50 %	0 %	0 %	50 %	410485160
66	NC_018651	TC	3	6	36677	36682	0 %	50 %	0 %	50 %	410485160
67	NC_018651	AG	3	6	37477	37482	50 %	0 %	50 %	0 %	410485162
68	NC_018651	GC	3	6	37897	37902	0 %	0 %	50 %	50 %	410485162
69	NC_018651	CT	3	6	38365	38370	0 %	50 %	0 %	50 %	410485163
70	NC_018651	AG	3	6	38502	38507	50 %	0 %	50 %	0 %	410485163
71	NC_018651	AG	3	6	39355	39360	50 %	0 %	50 %	0 %	410485163
72	NC_018651	TA	3	6	40006	40011	50 %	50 %	0 %	0 %	410485164
73	NC_018651	TA	3	6	40057	40062	50 %	50 %	0 %	0 %	410485164
74	NC_018651	TA	3	6	40129	40134	50 %	50 %	0 %	0 %	410485164
75	NC_018651	CA	3	6	40539	40544	50 %	0 %	0 %	50 %	410485164
76	NC_018651	TA	5	10	40599	40608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018651	CA	3	6	40718	40723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018651	TG	3	6	40944	40949	0 %	50 %	50 %	0 %	410485165
79	NC_018651	AG	3	6	41141	41146	50 %	0 %	50 %	0 %	410485165
80	NC_018651	CT	3	6	41262	41267	0 %	50 %	0 %	50 %	410485165
81	NC_018651	CT	3	6	41364	41369	0 %	50 %	0 %	50 %	410485165
82	NC_018651	CT	3	6	41583	41588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018651	TC	3	6	41777	41782	0 %	50 %	0 %	50 %	410485166
84	NC_018651	CG	3	6	43776	43781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018651	AT	4	8	44696	44703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018651	AG	3	6	45285	45290	50 %	0 %	50 %	0 %	410485172
87	NC_018651	CT	3	6	45424	45429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018651	CT	3	6	45481	45486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018651	CT	3	6	46460	46465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018651	TA	3	6	46596	46601	50 %	50 %	0 %	0 %	410485174
91	NC_018651	AG	3	6	46608	46613	50 %	0 %	50 %	0 %	410485174
92	NC_018651	GA	3	6	47779	47784	50 %	0 %	50 %	0 %	410485176
93	NC_018651	AT	3	6	48112	48117	50 %	50 %	0 %	0 %	410485176
94	NC_018651	CA	3	6	48390	48395	50 %	0 %	0 %	50 %	410485177
95	NC_018651	CA	4	8	49213	49220	50 %	0 %	0 %	50 %	410485179
96	NC_018651	GT	3	6	49663	49668	0 %	50 %	50 %	0 %	410485179
97	NC_018651	GT	3	6	51383	51388	0 %	50 %	50 %	0 %	410485181
98	NC_018651	CA	3	6	54168	54173	50 %	0 %	0 %	50 %	410485182
99	NC_018651	GA	3	6	54928	54933	50 %	0 %	50 %	0 %	410485183
100	NC_018651	CA	3	6	55180	55185	50 %	0 %	0 %	50 %	410485183
101	NC_018651	AG	3	6	56504	56509	50 %	0 %	50 %	0 %	410485185
102	NC_018651	CG	4	8	57216	57223	0 %	0 %	50 %	50 %	410485185
103	NC_018651	GT	3	6	58168	58173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018651	CA	3	6	58381	58386	50 %	0 %	0 %	50 %	410485186
105	NC_018651	TA	3	6	59150	59155	50 %	50 %	0 %	0 %	410485186
106	NC_018651	TA	3	6	59587	59592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018651	GT	3	6	60109	60114	0 %	50 %	50 %	0 %	410485187
108	NC_018651	TA	3	6	60497	60502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018651	TA	3	6	63102	63107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018651	CA	3	6	63524	63529	50 %	0 %	0 %	50 %	410485193
111	NC_018651	TG	3	6	63554	63559	0 %	50 %	50 %	0 %	410485193
112	NC_018651	AT	3	6	63935	63940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018651	AT	3	6	64089	64094	50 %	50 %	0 %	0 %	410485194
114	NC_018651	CT	3	6	64202	64207	0 %	50 %	0 %	50 %	410485194
115	NC_018651	TA	3	6	64584	64589	50 %	50 %	0 %	0 %	410485195
116	NC_018651	GT	3	6	65505	65510	0 %	50 %	50 %	0 %	410485196
117	NC_018651	TG	4	8	65996	66003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018651	AG	3	6	66510	66515	50 %	0 %	50 %	0 %	410485197
119	NC_018651	TA	3	6	67139	67144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018651	AG	3	6	69537	69542	50 %	0 %	50 %	0 %	410485202
121	NC_018651	CT	3	6	69548	69553	0 %	50 %	0 %	50 %	410485202
122	NC_018651	GA	3	6	69900	69905	50 %	0 %	50 %	0 %	410485202
123	NC_018651	CG	3	6	73106	73111	0 %	0 %	50 %	50 %	410485204
124	NC_018651	GT	3	6	73767	73772	0 %	50 %	50 %	0 %	410485204
125	NC_018651	GT	3	6	74397	74402	0 %	50 %	50 %	0 %	410485204
126	NC_018651	AG	3	6	74720	74725	50 %	0 %	50 %	0 %	410485204
127	NC_018651	AC	3	6	74867	74872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018651	AG	3	6	74907	74912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018651	TC	3	6	76353	76358	0 %	50 %	0 %	50 %	410485206
130	NC_018651	TC	3	6	76450	76455	0 %	50 %	0 %	50 %	410485206
131	NC_018651	GC	3	6	76469	76474	0 %	0 %	50 %	50 %	410485206
132	NC_018651	GA	3	6	76673	76678	50 %	0 %	50 %	0 %	410485206
133	NC_018651	AT	3	6	77056	77061	50 %	50 %	0 %	0 %	410485206
134	NC_018651	TG	3	6	77543	77548	0 %	50 %	50 %	0 %	410485206
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137	NC_018651	AC	3	6	78116	78121	50 %	0 %	0 %	50 %	410485206
138	NC_018651	GT	3	6	78411	78416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018651	AG	3	6	78466	78471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018651	AG	3	6	78906	78911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018651	CA	3	6	79914	79919	50 %	0 %	0 %	50 %	410485209
142	NC_018651	AT	3	6	79933	79938	50 %	50 %	0 %	0 %	410485209
143	NC_018651	GA	3	6	80089	80094	50 %	0 %	50 %	0 %	410485209
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145	NC_018651	AT	3	6	81002	81007	50 %	50 %	0 %	0 %	410485210
146	NC_018651	CT	4	8	81435	81442	0 %	50 %	0 %	50 %	410485210
147	NC_018651	CA	4	8	82682	82689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.