MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 plasmid p09EL50

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018651	AG	3	6	679	684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018651	AT	3	6	823	828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018651	TC	4	8	925	932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018651	AG	3	6	1768	1773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018651	AG	3	6	4195	4200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018651	TA	3	6	5035	5040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018651	CT	3	6	6249	6254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_018651	AC	3	6	13042	13047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018651	TA	3	6	13155	13160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018651	TA	4	8	13182	13189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018651	AC	3	6	19013	19018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018651	AT	3	6	20808	20813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018651	TA	3	6	25802	25807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018651	CT	3	6	26098	26103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018651	CT	3	6	26136	26141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018651	CA	3	6	26197	26202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018651	CT	3	6	26417	26422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018651	GT	3	6	26488	26493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018651	GT	3	6	26647	26652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018651	GA	3	6	26728	26733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018651	CG	3	6	26816	26821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018651	TG	3	6	26939	26944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018651	GT	3	6	27020	27025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018651	GT	3	6	27037	27042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018651	TG	3	6	27114	27119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018651	AG	3	6	27990	27995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018651	TA	5	10	40599	40608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018651	CA	3	6	40718	40723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018651	CT	3	6	41583	41588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018651	CG	3	6	43776	43781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018651	AT	4	8	44696	44703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018651	CT	3	6	45424	45429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018651	CT	3	6	45481	45486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018651	CT	3	6	46460	46465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018651	GT	3	6	58168	58173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018651	TA	3	6	59587	59592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018651	TA	3	6	60497	60502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018651	TA	3	6	63102	63107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018651	AT	3	6	63935	63940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018651	TG	4	8	65996	66003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018651	TA	3	6	67139	67144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018651	AC	3	6	74867	74872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018651	AG	3	6	74907	74912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018651	GT	3	6	78411	78416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018651	AG	3	6	78466	78471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018651	AG	3	6	78906	78911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018651	CA	4	8	82682	82689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018651	GT	3	6	82915	82920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018651	GT	3	6	82932	82937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018651	AG	3	6	83029	83034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018651	AG	3	6	83142	83147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018651	GC	3	6	83205	83210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018651	TG	3	6	83972	83977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018651	GT	3	6	84186	84191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018651	AC	3	6	87021	87026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018651	GA	3	6	87028	87033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018651	TA	4	8	91432	91439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018651	AT	3	6	93175	93180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018651	TA	3	6	94252	94257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018651	CT	4	8	95396	95403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018651	TA	3	6	96880	96885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018651	GC	3	6	108781	108786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.